摘要：深化综合改革是当前我国高校面临的重要课题之一。蔡元培任北京大学校长期间,围绕着“大学者,研究高深学问者也”的核心理念和目标,对北京大学的学科布局、科研组织、行政管理、学生自治等方面进行了大量卓有成效的改革。蔡元培在北京大学的综合改革具有理念清晰、定位明确,系统设计、整体推进,重心下移、激活基层,持续探索、不断调适等鲜明特点,对今天我国大学深化综合改革具有重要的启示意义。