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生物信息学杂志
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生物信息学杂志

《生物信息学》杂志创办于2003,是中华人民共和国工业和信息化部主管的国家重点学术期刊,国家级期刊,影响因子0.245,现被万方收录(中)等机构收录,主要征稿方向:研究论文、研究简报、综述进展、学科前沿、论坛、技术与方法、研...
  • 主管单位:中华人民共和国工业和信息化部
  • 主办单位:哈尔滨工业大学
  • 国际刊号:1672-5565
  • 国内刊号:23-1513/Q
  • 出版地方:黑龙江
  • 邮发代号:14-14
  • 创刊时间:2003
  • 发行周期:季刊
  • 业务类型:期刊征订
  • 复合影响因子:0.245
  • 综合影响因子:0.238
期刊级别: 国家级期刊
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期刊征稿:生物信息学 关注收藏
生物信息学期刊级别: 国家级期刊
生物信息学期刊分类: 期刊 > 自然科学与工程技术 > 基础科学 > 生物学
产品参数:
主管单位:中华人民共和国工业和信息化部
主办单位:哈尔滨工业大学
出版地方:黑龙江
快捷分类:生物
国际刊号:1672-5565
国内刊号:23-1513/Q
邮发代号:14-14
创刊时间:2003
发行周期:季刊
期刊开本:A4
下单时间:1个月内

生物信息学杂志简介

《生物信息学》是工业和信息化部主管,哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物,报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。本刊于2003年9月创刊,季刊,国内统一连续出版物号:CN23-1513/Q,国际连续出版物号:ISSN1672-5565。

《生物信息学》主要刊载生物信息及相关领域的研究进展、综述、研究论文、研究简报、技术与方法、专题评论等学术文章。《生物信息》登载的研究论文应是没有在国内外公开出版的刊物上发表过的原始研究工作报告;综述进展应结合作者研究领域的工作,对相关领域的发展及研究进展进行全面的介绍和评述,及时反映生物信息领域的发展热点和最新进展;本刊还刊登有关生物信息技术国内外研究开发动态、简讯、产业政策与产业发展动态、学术活动与展会通知、书评、短评、启事等文章。

《生物信息学》为中国科技核心期刊,并加入了中国期刊全文数据库(CJFD)、万方数据库、中国核心期刊(遴选)数据库和中国学术期刊综合评价数据库(CAJCED)、中国生物医学文献数据库(SinoMed)等。2013年入选美国《乌利希期刊指南》(网络版);本年度在美国《科学引文索引(扩展库)》(SCIE)施引文献数6篇,总被引频次7次。

生物信息学栏目设置

研究论文、研究简报、综述进展、学科前沿、论坛、技术与方法、研究快讯、评论、动态、产业报道、知识产权、新书推介、展会报道

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2017-07-12 11:19:38 重命名 ¥ 48.00 1 生物信息学

生物信息学杂志社 文档目录

生物信息学杂志研究论文

生命机体危险因子信息特征分析

摘要:旨在生命机体与危险因子间建立生命物质信息对话平台,以物质化的信息,或信息化的物质的思维进行理解和推论,建立物质承载信息,信息通过物质的形式传递的思维模式,对生命信息中危险因子的属性、分类以及生命机体对危险因子的识别方式进行分析,从以上两个方面不同角度阐述危险因子与生命机体机制信息的相关互动关系。在分析与解读的过程中,主张建立合乎自然生成逻辑的科学概念,而摒弃一些主观是非逻辑所推导建立起来的概念,还原生命物质和生命过程的本来生物学位置及性质;主张一元化的思考方式和整体性理解生命信息安全控制机制的核心部分。分析结果:就生命信息中危险因子的属性和分类进行了分析,指出危险因子具有生命信息属性和生命安全属性两个属性,依据危险因子物质来源的不同,分外源性和内源性两类,绘出危险因子来源分类汇总图;从机体方面对危险因子识别方式不同,分为PRR识别方式和抗原(样)受体识别方式两类,并绘出危险因子识别方式分类汇总图。综合危险因子的属性、分类和生命机体对危险因子的识别方式,绘制出危险因子与生命机体机制信息的相关互动图,从保守性结构信息、生理产物信息、对机体损伤信息、代谢通路信息、对机体变应信息、精细纯外观构象信息及内在性核心信息7个方面对两者的相互关系进行了引证和分析,进一步阐释了生命信息安全控制机制。
69-77

禾谷镰刀菌cAMP受体类GPCR生物信息学分析

摘要:禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum)是引起小麦赤霉病的主要致病菌。G蛋白偶联受体(G protein coupled receptors,GPCRs)是一类重要的细胞表面受体,其介导的cAMP信号通路可能参与了禾谷镰刀菌的致病和毒素合成,因此分析cAMP受体类型的GPCRs蛋白的结构及其理化性质对了解GPCRs的功能及其与赤霉病致病的关系具有重要意义。本研究运用生物信息学方法,对禾谷镰刀菌全基因组序列中cAMP类GPCR基因进行了生物信息学分析。发现禾谷镰刀菌中存在5个典型的cAMP受体类型GPCRs:FgcAR1、FgcAR2、FgcAR3、FgcAR4和FgcAR5,均含有7个跨膜结构域,并定位于细胞膜上。除FgcAR1外,其余为疏水性蛋白。蛋白质二级结构分析表明,均含有大量α螺旋,比例在60%左右,FgcAR4和FgcAR5没有β转角,FgcAR1、FgcAR2和FgcAR3也只有较少比例的β转角。这些GPCRs中含有较多的Ser和Thr磷酸化位点。遗传分析表明,禾谷镰刀菌cAMP受体类型的GPCR蛋白与假禾谷镰刀菌及F.langsethiae同源性最高,亲缘关系最近。本研究明确了禾谷镰刀菌中cAMP类GPCR蛋白的理化性质、定位、二级结构、磷酸化位点及进化关系,为了解小麦赤霉病发病机制及以GPCRs为靶标的新型杀菌剂研发奠定了基础。
97-104
生物信息学杂志研究快报

用于寡核苷酸探针设计的ARB软件

摘要:探针设计是制备高质量基因芯片的重中之重。ARB软件是用于设计系统发育芯片(Phylo Chip)探针的主要软件,然而由于安装困难、相关中文文章较少等原因,阻碍了其在国内的广泛使用。本文详细介绍了ARB软件的安装方法、探针设计及其他功能。这将有助于用户快速使用ARB软件进行探针设计,促进系统发育芯片的发展及其在各领域的应用。
127-133
生物信息学杂志研究论文

基于物化性质对嗜热蛋白的预测

摘要:嗜热蛋白在高温下能保持稳定性和活性,是研究蛋白质热稳定性的理想模型,开发一个蛋白质热稳定性识别的方法将对蛋白质工程和蛋白质的设计很有帮助。目前的研究中,氨基酸的组成及其物化性质一直被认为和蛋白质的热稳定性相关。本研究筛选出可靠的数据集,包括915个嗜热蛋白和793个非嗜热蛋白。利用蛋白质氨基酸的物化性质和氨基酸的组成表征嗜热蛋白,将二肽氨基酸组成整合到9组氨基酸物化性质中使蛋白序列公式化。支持向量机5折叠交叉验证表明:当gap=0时,290个特征产生的精度最高,为92.74%。因此说明对于分析蛋白质的热稳定性,所建立的预测模型将是一个很有效的工具。
1-6
生物信息学杂志研究快报

基于微量DNA样本的简化甲基化文库构建方法研究

摘要:RRBS(简化甲基化测序)是一种有效研究DNA甲基化状态的测序方案。文库构建是该方案中最关键的实验步骤之一,RRBS文库构建往往因为酶切产物少,文库构建步骤繁多等因素,导致DNA起始量需要1 ug以上。然而很多来源于人的样本,如冰冻组织穿刺、石蜡切片、显微微切割等,都往往只能获得100 ng以下的DNA,无法满足常规RRBS文库构建的起始DNA总量要求,从而大大限制RRBS技术的应用范围。本研究主要探讨并设计了基于微量DNA样本(〈100 ng)的RRBS文库构建策略,主要通过优化MspI酶切条件、DNA片段大小筛选、缩减反应步骤及减少DNA转移次数等技术手段,大大提高了DNA回收率,进而建立了2种有效使用微量DNA样品的RRBS文库构建方案(即EA-Method和WB-Method方案)。EA-Meth-od方案在处理100 ng左右的DNA时,有经济、快速、高效的特点,但文库质量略差于WB-Method方案;WB-Method方案可将DNA起始量降低至10 ng,并且文库质量高。为验证WB-Method方法的可靠性,研究人员选取了3种志愿者样本(全血和口拭子),采用WB-Method同时进行常量和微量RRBS文库构建,并进行Illumina Hiseq平台测序,数据通过生物信息分析得到微量RRBS检测的CpG,CHG,CHH中C碱基的甲基化比例与常量RRBS结果一致。同时,该方法可以大大降低DNA损耗及损伤,因而该方法可将RRBS技术应用到更广泛的样本类型中去,有效拓展RRBS的研究领域。
33-45
生物信息学杂志默认

基因组序列8-mer频次使用规律及与物种进化的关系

摘要:基因组序列k-mer的非随机使用规律及包含的生物学意义一直是人们关注的问题,目前还没有根本性进展。本文以七个物种的全部基因序列为样本,得到各物种基因组序列的8-mer频谱分布。发现狗和牛的频谱有三个峰,而斑马鱼、青鳉鱼、秀丽线虫和酿酒酵母的频谱只有一个峰,鸡的频谱分布形状介于两者之间。将8-mer集合按照XY二核苷含量分类,结果显示只有CG二核苷分类下0CG、1CG和2CG三类子集的频谱形成各自独立的单峰分布。对照随机序列,发现0CG模体是随机进化的,1CG和2CG模体是定向进化的,它们的使用频次远小于随机频次,且这种独立进化分离规律具有物种普适性。三个CG子集频谱之间的距离是产生单峰或多峰现象的根本原因。将七个物种基因组序列标准化到109bp,比较发现1CG和2CG子集频谱与物种进化显著相关,0CG子集频谱与物种进化无显著关系。可以认为三种CG模体各自执行着不同的生物学功能。基因组序列8-mer的独立分离规律为揭示基因组结构、基因组进化以及模体的生物功能提供了一种新的思维方式。
195-202
226-229

数据挖掘在生物信息学中的应用——文献计量学视角

摘要:基因组和蛋白质结构与功能方面已积累了海量数据。如何从海量数据中获取有效信息成为生物信息学迫切要解决的问题。本文以相关主题词检索文献,分析了该领域历年文章数量、发文最多的机构和作者、被引用频次居前论文、期刊载文量,并对关键词和被引用频次居前论文的作者进行共现分析。我们发现,生物信息学中运用数据挖掘方法的文献逐年增多,该领域30.1%的文献发表在十个期刊上,分类、聚类、特征选择和支持向量机等数据挖掘方法使用较多。本研究描绘了生物信息学与数据挖掘这一交叉领域的研究概况,为后续数据挖掘方法与生物信息学研究相结合提供帮助。
249-253
生物信息学杂志研究论文

牦牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPS)的生物信息学分析

摘要:GGPS是萜类化合物合成的一个重要分支点酶,同时也是合成GGPP的催化酶。本课题共选择了9个不同科的植物,对其GGPS核苷酸及氨基酸序列的理化性质、蛋白质结构功能以及亲缘进化关系等进行详细的分析。结果表明,九个科植物GGPS核苷酸序列长度均大于1 000 bp小于2 000 bp;GGPS氨基酸都不含有信号肽,不存在跨膜结构域;GGPS蛋白的二级结构中α螺旋和无规卷曲是主要结构,且无β-折叠结构,延伸链和β-转角则分散于整个蛋白中。通过生物信息学方法进行合理预测,为进一步研究GGPS的酶学特性提供了重要理论依据。
127-133
生物信息学杂志综述

基于PBL结合多媒体教学模式在生物技术教学上的应用

摘要:为提升学生学习兴趣,培养学生自主学习的能力是当前教育关注的首要问题。本文针对在生物技术课堂上遇到的实际问题,提出建立多媒体资料库,引导学生自己提出问题并加以解决,拓展学生思路,提高了教学效果,学生反响良好。
156-159
生物信息学杂志研究快报

蛋白质二级结构指定

摘要:蛋白质二级结构是指蛋白质骨架结构中有规律重复的构象。由蛋白质原子坐标正确地指定蛋白质二级结构是分析蛋白质结构与功能的基础,二级结构的指定对于蛋白质分类、蛋白质功能模体的发现以及理解蛋白质折叠机制有着重要的作用。并且蛋白质二级结构信息广泛应用到蛋白质分子可视化、蛋白质比对以及蛋白质结构预测中。目前有超过20种蛋白质二级结构指定方法,这些方法大体可以分为两大类:基于氢键和基于几何,不同方法指定结果之间的差异较大。由于尚没有蛋白质二级结构指定方法的综述文献,因此,本文主要介绍和总结已有蛋白质二级结构指定方法。
181-187

生物信息学杂志社分期列表:

2017:
2016:
2015:
2014:
2013:
2012:
2011:
2010:
2009:
2008:
2007:
2006:

生物信息学杂志社要求

《生物信息学》来稿要求论点明确,数据可靠,条理清晰,文字精炼。研究论文一般在4000字以内,综述性文章以5000字为限,研究简讯、动态等文章一般在1000字以内。其他栏目根据具体情况确定。

《生物信息学》来稿请提供激光打印样一式两份(请用A4纸小4号通栏打印,作者自留副本),并附作者工作单位推荐信。稿件须注明联系人详细通讯地址(包括邮政编码、电话、传真、电子信箱等)、第一作者个人信息(包括性别、出生年月、职称、所获学位等),以便处理稿件时能及时与作者联系。

《生物信息学》来稿务必做到清稿定稿。稿件中的外文字母、符号必须分清大、小写,正、斜体,上下角的字母、数码和符号,其位置高低应区别明显。容易混淆的字母、符号等在首次出现时,请用铅笔注明。文中计量单位务必使用新出版的中华人民共和国国家标准《量和单位》中颁布的法定计量单位名称和符号。非许用单位,务请换算成许用单位。

本刊的编排规则和格式依据国家标准的要求,来稿由中英文标题、作者、单位(城市、邮政编码)、中英文摘要、关键词、正文(含文字、图表)、脚注、参考文献等部分组成。对各部分要求如下:

标题中英文对照。一般不用副标题,中文题名一般不超过20个字,英文题名应与中文题名含义一致,一般不超过10个实词。标题应简洁、明确地反映研究成果的实质及特点。

作者应是对文章全部或部分内容作出主要贡献、能对内容负责的人,并应征得各人同意。作者单位应标明全称及所在城市和邮政编码。文章第一作者通常为联系人,另定联系人时,请用脚注标明。

摘要以第三人称撰写,内容包括研究目的、方法、结果、主要数据、和结论等。研究论文中文摘要一般不超过300字,英文摘要内容与中文摘要基本一致。请注意中国作者在英文稿中的姓名采用汉语拼音,姓前名后分写,姓和名的首字母均大写,复姓和双名间均不加连字符,但会产生歧音的可用隔音符号(’)区分。

每篇文章应选取反映文章内容的关键词3~5个。关键词分别列在中英文摘要之后。

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生物信息学杂志网友评论

yuanliu** 的评论:

生物信息学杂志审稿很快,专家给的意见很中肯,态度也很好!我投的一篇8月4号投出,8月21号收到了录用通知,当然我修改的速度也很快。特别是外审意见也很神速。

2019-10-12 17:26:37
weichen** 的评论:

生物信息学杂志工作人员的处理速度相当不错哦,审稿专家很负责,提了很多问题,有些问题水平很高,给了小修,感觉还是很有希望中。编辑老师态度超好,给人感觉很温和亲切。值得推荐!

2019-09-06 09:21:06
zhuangv** 的评论:

生物信息学杂志很规范,编辑部整体效率高,基本能在计划时间内完成审稿流程。个人感觉只要按外审专家意见认真修改可以修改的意见,将不能改或不好改的意见在修改说明中充分阐述理由,基本能通过终审。

2019-08-13 10:51:26
jinfang** 的评论:

生物信息学杂志审稿速度很快,第一次投这个杂志,编辑老师人很好,每次打电话都很热心,回复很及时,三周左右的时间知道审稿结果,终审不到一周。目前还在排队。总体感觉编辑和审稿人认真负责。

2019-07-29 09:14:55
bthfgob** 的评论:

总的来说还可以,生物信息学编辑很负责任,极其有耐心,审稿老师意见都很中肯,中间返回修改两次,个人感觉文章语言要凝练。总的来说编辑和审稿都是比较快的。最后祝大家论文百发百中

2018-02-12 10:26:55
tmkolp_** 的评论:

今年评上的工程师,这个文章是发表了以后评高工用的,一篇综述性的文章。速度很快,我同事比我先投的另一个杂志,我的已经录用了,他的还没审完稿呢。对于急用文章的朋友很推荐生物信息学。

2018-01-25 11:13:29
ghjkol_** 的评论:

初审比较快,几天后送外审,外审半个月结束,认真修改后于1月初录用。生物信息学的视野很开阔,只要论文有新意,比较容易被接受。这本杂志给我留下的第一印象很好,下次还来哟。

2018-01-02 10:30:16
shxuij_** 的评论:

感觉还是比较容易的,当然文章质量要有保证,投稿前要严格按照期刊要求修改文章格式。生物信息学编辑人非常好,每次邮件联系时都很客气而且很耐心,对文章里的一些小问题也会细致地用红色字体给标出来。总体感觉这本杂志还是挺不错的,建议投稿。

2017-12-15 09:57:13
fazaht_** 的评论:

10月26号投稿,审稿意见是让我修改语句,有些地方交待得很清楚,按模版格式修改,已上传。而且编辑态度很好,回答问题很有耐心,回复很快,也可电话联系,值得推荐。

2017-11-30 08:59:12
mzhuip_** 的评论:

非常好的一个杂志,处理速度快、不拖延这是很重要的,不管中不中编辑尽快处理就会让作者很开心。当然很庆幸被录用了。编辑部找了两个审稿人,都是领域相关,审稿人很用心的提了一些意见,由于第一次投稿,写的不是很好,但是专家非常的认真,还帮我改了一些用词不当的地方。谢谢。

2017-11-08 11:36:54
yawjdf_** 的评论:

这次学术之家的速度没得说,第一天下的单,第二天中午收到。内容更是没得说,很建议有机会读读这方面的书籍,尽管这些知识到如今很多已经对我们全无用处,但别忘了,我们现在的一切还不都是在前人的基础了一步步发展而来的吧,那些都是人的心语、人的心智的记录。

2017-10-12 15:33:40
lepdjx_** 的评论:

第一次看这本杂志就爱上了,内容丰富,非常喜欢,行文流畅生动,可读性强。很好的一本书,是正版!价钱实惠,半价订阅的,好开心!一直很喜欢这类杂志呢,值得推荐。我很满意。

2017-09-08 08:43:50
shijuan** 的评论:

非常专业的书,文章质量很好,这是老师给推荐的书,里面讲解的非常详细。书很精致,硬壳的,字体大小合适,塑膜完整。内容很深究,通俗易懂,很满意值得推荐!

2017-08-29 09:37:39
wuxuan_** 的评论:

预定全年刊物了,感觉很划算,不是很时效性的杂志比报刊亭延迟三四天左右看到还是可以接受的。总体来说,十分合适。信任学术之家。

2017-08-17 15:19:40
gdghd** 的评论:

生物信息学杂志的外审老师审查意见都很中肯,按照老师意见修改后,同意录用发表。总体感觉审查专家是本领域的,因为意见都很到位,对文章分析很透彻。审稿流程比较规范,速度算可以。推荐投稿。

2017-05-04 15:16:26
arvin** 的评论:

之前中了篇文章,在这里给个结论,我认为学科前沿还是比较不错的杂志,至少从编辑的认真态度,对审稿时间的控制等等,都是相当负责任的。审稿老师的意见也很是中肯,有价值。大家都可以试试哦。

2017-04-28 09:39:13
sundesh** 的评论:

该期刊编辑很认真,而且很容易沟通,对论文质量要求较高,评审严格。但是发表也及时。很不错的期刊。

2017-04-12 10:35:01
jiaonu** 的评论:

生物信息学杂志还是很细致的,只要有创新点,对于初稿格式要求不高,但是录用后会要求修改格式,总的来说还是比较细致的,。编辑部老师的态度十分好,也很细心。工作效率也很快。

2016-02-16 10:33:54
guifuyu** 的评论:

初审通常一周,外审和复审就不一定了,得看专家了我的外审是一月左右,复审半月左右,终审包括国庆在内半月,效率还是很高的。审稿人专业水平挺高的,提的意见也都很中肯。

2015-10-13 16:59:10
wutianl** 的评论:

很不错的期刊,质量很高,编辑态度很好,认真负责,审稿仔细,赞一个!但审稿速度慢,这可能是国内期刊的通病,投了两篇,都是修改后录用,历时很长,最重要的是,基本上等发表的时候才知道是不是录用了,换句话说,就是在发表的前一天,你都不知道是否录用,

2015-06-02 10:57:09
xu789** 的评论:

第一次投稿,审稿两个月后建议转增刊,果断撤了,另一篇2014年11月15投稿,12月4号收到邮件回复,直接录用,2015年2-4期刊出,审稿速度挺快的,就是出刊慢

2015-01-05 17:28:41

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