摘要：我国高新技术开发区(简称“高新区”)在其发展过程中形成了适应市场经济发展的新的管理体制机制,推动了区域科技创新和社会经济发展。随着市场经济的深入发展以及新时代高新区肩负的新的历史使命,这种体制逐渐显露出困境,表现为体制外摩擦、体制回归、机制僵化以及成果认证滞后等。探讨问题深层次原因,包括高新区定位的偏差、“政区合一”模式、制约监督弱化等。提出从政府治理向企业治理转变、行政管理向科技转变、集中管理向协调管理转变、权利型管理体制向服务型管理体制转变等思路。