水稻OsATG12基因的克隆、表达及生物信息学分析

作者:胡方志; 杜强; 袁利花; 韦鹏飞; 苏莹; 王志龙; 陈秋红

摘要:ATG12蛋白参与调控植物体内自噬途径的发生,在自噬小体的形成过程中发挥重要作用。为研究水稻OsATG12基因的功能,本研究克隆到该基因的全长CDS序列,长度为282 bp,编码93个氨基酸。OsATG12为亲水性蛋白,具多个磷酸化位点,无跨膜结构和信号肽,预测定位于细胞质,具有APG12_C结构域。进化树分析表明该蛋白与短药野生稻的ATG12蛋白的亲缘关系最近。组织表达谱检测结果表明,在水稻幼苗中,OsATG12基因在根中表达量最高,在茎中基本不表达;在孕穗期水稻中,该基因在叶中的表达量最高,在茎、叶鞘中只有低水平的表达。高温、低温、盐、双氧水、PEG4000处理均能诱导该基因的表达。本研究为水稻OsATG12基因功能的进一步探索提供参考。

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关键词:
  • 自噬
  • osatg12基因
  • 生物信息学分析
  • 表达分析

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期刊名称:分子植物育种

期刊级别:北大期刊

期刊人气:6100

杂志介绍:
主管单位:海南省科学技术协会
主办单位:海南省生物工程协会
出版地方:海南
快捷分类:农业
国际刊号:1672-416X
国内刊号:46-1068/S
邮发代号:84-23
创刊时间:2003
发行周期:半月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
复合影响因子:0.85
综合影响因子:0.89