基因组学与应用生物学杂志

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基因组学与应用生物学杂志 北大期刊 CSCD期刊 统计源期刊

Genomics and Applied Biology

  • 45-1369/Q 国内刊号
  • 1674-568X 国际刊号
  • 1.11 影响因子
  • 1-3个月下单 审稿周期
基因组学与应用生物学是广西大学主办的一本学术期刊,主要刊载该领域内的原创性研究论文、综述和评论等。杂志于1982年创刊,目前已被维普收录(中)、CA 化学文摘(美)等知名数据库收录,是广西大学主管的国家重点学术期刊之一。基因组学与应用生物学在学术界享有很高的声誉和影响力,该期刊发表的文章具有较高的学术水平和实践价值,为读者提供更多的实践案例和行业信息,得到了广大读者的广泛关注和引用。
栏目设置:综述与专论、研究论文、研究报告、实验技术。

基因组学与应用生物学 2016年第08期杂志 文档列表

基因组学与应用生物学杂志分子医学与临床应用
卵巢癌相关长链非编码RNA的生物信息学挖掘1841-1845

摘要:探讨卵巢癌中差异表达的长链非编码RNA,从NCBI基因芯片数据库GEO下载卵巢癌基因芯片数据GSE14407,用SAM软件输出差异表达的基因,对其进行重注释并筛选出其中的长链非编码RNA,用Gene Cluster和Tree View软件验证SAM软件分析结果。针对该芯片数据,筛出133个在卵巢癌中表达有差异的长链非编码RNA,其中112个上调,21个下调,且这些长链非编码RNA的表达倍数均〉2或〈0.5,差异有统计学意义(q值〈0.05)。用生物信息学方法挖掘普通基因芯片中卵巢癌相关长链非编码RNA是十分有效的方法,可为卵巢癌相关长链非编码RNA的探索提供新途径。

金黄色葡萄球菌基因组表达文库的构建及免疫学初步筛选1846-1851

摘要:为从基因组水平筛选金黄色葡萄球菌疫苗抗原,建立金黄色葡萄球菌基因组表达文库,用患者恢复期血清对表达文库进行血清学筛选,并对获得的阳性克隆进行序列测定及同源性分析。结果显示,构建的金黄色葡萄球菌基因组表达文库共有5x10。个克隆,片段插入正确率为91.67%。对文库进行初步筛选,共获得6个阳性克隆,经测序鉴定和同源性分析发现6个克隆涉及金黄色葡萄球菌基因组6个开放阅读框(ORF)。结果表明,本研究建立的疫苗抗原筛选方法可用于金黄色葡萄球菌疫苗抗原的系统筛选。

Legume Genomics and Genetics (LGG)1851-1851

人APEXl基因的生物信息学分析1852-1857

摘要:APEXl是影响基因表达和氧化还原活性相关碱基修复和多功能蛋白的关键基因,对APEXl基因及编码蛋白进行生物信息学方面的深入分析,更有利于对APEXl基因相关癌症及其他遗传流行病学的阐述。本研究利用生物信息学分析方法以11个物种APEXl基因序列及编码蛋白序列为研究对象,对人APEXl基因进行了系统进化分析及预测启动子及CpG岛,并对其蛋白质理化性质及结构功能等进行了预测分析。核酸分析结果表明,人APEXl基因包含5个外显子,预测核心启动子区域为158~208bp。进化分析结果显示,人与黑猩猩的遗传距离为0.003,亲缘关系最近。蛋白预测软件结果显示,人APEXl蛋白主要由自由卷曲及仪一螺旋结构组成,无合适信号肽及明显跨膜区,表明该基因不参与跨膜物质运输及信号转导。

中原汉族Y染色体短串联重复序列的遗传多态性分析1858-1864

摘要:Y染色体特异区呈父系单倍型遗传,其基因标记是近年来遗传学的研究热点。本研究应用27个荧光标记Y染色体STR基因座复合扩增系统,对中原地区汉族3951名男性无关个体进行Y染色体短串联重复序列遗传多态性研究,以获得中原汉族人群的遗传信息。结果显示27个Y.STR基因座在中原地区汉族3951名男性无关个体中检出3944种单倍型,单倍型多样性为0.999683,单倍型数目最多的两个基因座分别是DYS385和DYF387S1,分别检出95种和65种单倍型,其余基因座分别检出5~19种单倍型。27个基因座的基因多样性在0.3772~0.9691之间,累计基因多态性达0.999999。同时将DYS385、DYS391和DYS438这3个基因座的基因多样性和湖南、湖北、浙江、广州、辽宁、闽南汉族及广西彝族进行比较分析。据本研究结果可知27个Y.STR基因座在中原汉族人群中具有丰富的遗传多态性,其数据为群体遗传学研究、法医学应用及Y.STR数据库建设提供数据支撑。

Molecular Entomology1864-1864

滇重楼茎叶总皂苷抗肝癌HepG2细胞活性1865-1870

摘要:探究滇重楼茎叶总皂苷对肝癌HepG2细胞增殖的抑制、细胞周期阻滞及诱导细胞凋亡作用。从滇重楼地上茎叶提取总皂苷,配制成浓度为10μg/mL、20μg/mL、40μg/mL、80μg/mL和160μg/mL的总皂苷提取物处理HepG2细胞。总皂苷提取物对细胞增殖的抑制作用采用MTT法检测;对细胞周期阻滞作用采用流式细胞术检测;诱导细胞凋亡的作用采用细胞核荧光染色、流式细胞术和caspase-3活性试剂盒检测。结果表明,滇重楼茎叶总皂苷提取物能显著抑制细胞增殖,且具有时间、剂量依赖效应,能阻滞细胞周期于s期,并能诱导细胞凋亡。但其诱导凋亡作用仅高剂量组(≥80μg/mL)效果显著,低剂量组(〈80μg/mL)不显著。

P38通路激活对大鼠脑组织抗氧化酶的表达和凋亡的影响1871-1876

摘要:探究p38通路在心肺复苏后大鼠脑组织过氧化物岐化酶(superoxide dismutase,SOD)表达过程中的作用以及对脑细胞凋亡的影响。经食道交流电刺激诱导心室颤动(vF)建立大鼠心脏骤停/心肺复苏(cardiac arrest/cardiopulmonary resuscitation,CA/CPR)模型。假手术(sH)组大鼠只行手术操作,不诱导CA/CPR(n=6)。恢复自主循环后的48只大鼠随机分成两组,分别为SKF86002(SKY)组(2.5mg/kg,iv.,n=24)和模型组(给予等量生理盐水,n=24),每组分别设12h、24h、48h、72h四个检测时间点,每个时间点6只大鼠。用免疫荧光标记法检测大脑皮层过氧化物岐化酶的荧光密度,TUNEL标记法检测细胞凋亡情况。结果发现:CPR后,SKF组在各时间点的SODi和SOD2的荧光密度均较模型组较高(P〈0.05)。但是CPR后72h,SKF组的凋亡率明显较模型组高(p〈0.05)。表明SKF干预治疗能显著提高心脏骤停/心肺复苏后模型大鼠脑组织的SOD的表达水平,但并不能抑制脑细胞凋亡。

甲基苯丙胺对其依赖人群血管内皮功能的影响1877-1880

摘要:为探讨甲基苯丙胺对其依赖人群血管内皮功能的影响,入选50例甲基苯丙胺依赖人群(I组)和50例健康人群(Ⅱ组),2组人群均采用高分辨血管超声检测肱动脉血流介导的血管扩张功能(FMD),以及血中一氧化氮(N0)、内皮素-1(ET-1)水平。甲基苯丙胺依赖人群组(I组)肱动脉FMD、血一氧化氮(N0)水平较健康对照组(11组)显著降低(f)〈0.05);血内皮素-1(ET-1)水平较健康对照组(Ⅱ组)显著升高(P〈0.05)。甲基苯丙胺对其依赖人群的血管内皮功能有损害作用。

12a-羟基明杜西酮通过Wnt/β-catenin信号通路促进人肝癌细胞凋亡的作用研究1881-1886

摘要:为了探讨化合物12a-羟基明杜西酮对人肝癌细胞系HepG2增殖与凋亡的影响及其作用机制,本研究采用MTT法检测人肝癌细胞系HepG2的增殖情况;应用流式细胞术检测细胞的周期分布、凋亡率和ROS水平;通过Western Blotting法检测Wnt/β-catenin信号通路相关蛋白的表达情况。结果表明,化合物12a-羟基明杜西酮可抑制人肝癌细胞系HepG2的增殖,其抑制率与作用浓度呈时间和剂量依赖性,24h、48h和72h的IC5(1分别为(12.8+0.67)μmol/L、(8.8±0.43)txmol/L和(6.6±0.42)μmol/L;12a-羟基明杜西酮可剂量依赖性地(5ixmol/L、10μmol/L和20μmol/L)使HepG2细胞阻滞在G2/M期(p〉0.05),同时可增加细胞凋亡率0〉0.05),提高细胞内ROS水平(p〉0.05)。此外,12a-羟基明杜西酮对HepG2细胞内总的、细胞质的和细胞核的B—catenin蛋白表达均有降低作用,这说明Wnt/β-atenin通路可能受到了抑制。进一步的研究结果也证实了上述推测:12a-羟基明杜西酮可使Dvl-2、Dvl-3、GSK-3B(p—ser9)、c.myc、survivin的蛋白表达下降,而使GSK-3(p-tyr216)、Axin-2的蛋白表达水平升高,对总的GSK-3p蛋白水平则无明显影响。上述结果表明,化合物12a-羟基明杜西酮可以抑制人肝癌细胞系HepG2的增殖并诱导其凋亡,其主要作用机制可能与升高细胞内ROS水平和抑制Dvl/GSK-3β/β-catenin信号通路有关。

厄洛替尼治疗老年非小细胞肺癌者的疗效和安全性1887-1892

摘要:本研究通过厄洛替尼对老年非小细胞肺癌(NSCLC)患者的治疗,观察其临床治疗效果和治疗安全性。回顾性分析2013年1月到2015年1月入住我院的46例老年非小细胞肺癌为研究对象,随机分为观察组和对照组,对照组吉非替尼治疗,观察组厄洛替尼进行治疗,总结厄洛替尼治疗老年非小细胞肺癌临床治疗效果与安全性。治疗后,症状缓解率达到75%,咳嗽、气短症状缓解最为明显,中位时间15d。19例患者口服厄洛替尼后CEA数值下降,其中4例患者自行缓解,7例患者CEA持续增长。临床症状部分缓解、病情稳定和疾病进展的患者分别有6例、9例和8例,治疗客观有效率和疾病控制率分别为26.09%和65.21%,患者中为无进展生存期和总生存期分别为27周和47周;治疗期间出现的皮疹、腹泻、口干、口腔溃疡、食欲下降等不良反应的患者分别有11例(47.83%)、6例(26.09%)、2例(8.70%)、2例(8.70%)和2例(8.70%),研究过程中未出现一例患者因不良反应而死亡或者退出本次研究。皮疹患者给予皮肤消毒、松软膏等后逐渐好转,不影响继续治疗。腹泻症状出现在服药后1周后,口服止泻药物后得到好转,多为I度和Ⅱ度,不影响患者继续治疗。研究结果表明厄洛替尼治疗可以有效的控制老年非小细胞型肺癌患者的病情,治疗过程中毒副反应较轻微,可以作为老年非小细胞肺癌治疗药物之一。需要注意的是不同人群及个体对药物特异性不同,因此在采用厄洛替尼治疗中,需要个性化给药,减少不良反应的出现。

瑞舒伐他汀与阿托伐他汀对早发冠心病急性心肌梗死患者血管内皮功能和心脏功能的影响1893-1898

摘要:本研究将78例早发冠心病急性心肌梗死患者采用随机数表分为A组(39例)和B组(39例),所有患者均给予基础治疗,A组另给予瑞舒伐他汀,B组另给予阿托伐他汀。对比两种他汀类药物治疗前后患者血管内皮功能、心脏功能相关指标水平变化,并观察血脂和hs.CRP水平变化。随访一年,比较不良心血管事件发生率。结果发现在治疗前和治疗后两组FMD、LVEF、IMT水平比较均无显著差异(p〉0.05),且治疗后两组各项水平均较治疗前显著改善幻〈0.05);治疗前两组TG、TC、HDL-C、LDL—C和hs-CRP水平无显著差异(p〉0.05),治疗后除HDL-C无明显改善外,其他因子水平均较治疗前显著改善(P〈0.05),且治疗后A组TC、LDL-C和hs-CRP水平均显著优于B组(p〈0.05);A组不良心血管事件发生率为7.69%,B组为12.82%,前者稍低于后者,但差异无统计学意义0〉0.05)。提示瑞舒伐他汀和阿托伐他汀在改善早发冠心病急性心肌梗死患者血管内皮功能和心脏功能方面作用相近,但前者降脂和减轻炎症反应效果更为显著,不良心血管事件少。

Journal of Mosquito Research (JMR)1898-1898

甘草酸二铵肠溶胶囊防治肝功能损害的临床研究1899-1902

摘要:本研究对甘草酸二铵肠溶胶囊防治抗结核药物对肝功能损害临床疗效的前瞻性进行分析。统计分析2013年1月至2014年12月期间的180例结核病患者的临床资料。在本次研究中,观察组患者治疗2周、1个月和2个月后的肝功能损伤发生率为1.11%、5.56%和13.33%,对照组的发生率为7.78%、17.78%和30.00‰〈0.05)。观察组与对照组患者治疗后的肝功能指标(谷丙转氨酶,谷草转氨酶,总胆红素)与治疗前比较有显著差异(P〈0.05)。且治疗后的观察组与对照组患者的肝功能指标对比分析,有显著差异(p〈0.05)。通过相关分析表明抗结核疾病的治疗中,使用甘草酸二铵肠溶胶囊治疗,可以显著的降低对患者肝功能产生的损伤,促进结核疾病的顺利进行,并提高治疗成功率。

International Journal of Super Species Research1902-1902

基于纳米金修饰的核酸适体生物传感器用于环孢素浓度的体外测定1903-1907

摘要:利用环孢素(CsA)的两条高亲和力核酸适体生物传感器用于环孢素浓度的体外测定,在柠檬酸三钠为还原剂条件下,以氯金酸为原料,制备纳米金(Au)溶液,并对其进行表征,将aptamer-I经酰胺化反应共价结合到磁性纳米颗粒表面,以纳米金(Au)修饰aptamer-Ⅱ,以固定在磁性纳米颗粒表面的aptamer-I与环孢素孵育,再与Au-aptamer-Ⅱ作用,形成磁性纳米颗粒/环孢素/纳米金三明治夹心结构,磁分离技术分离三明治复合物,210nm处检测分离前后紫外吸收强度的变化,对环孢素进行定量检测。结果紫外检测结果显示,制备的纳米金溶胶在520nm处呈现典型的吸收峰,JEM-4000EX电镜结果显示,纳米金溶胶颗粒粒径分布均匀、形貌、分散度较好,粒径大小在30nm左右,此法对环孢素的响应范围是50~1500ng/mL,其线性回归方程为Y=4x10-3^X+5.769x10-1^,R=0.9973。此法可在1~2h内完成检测,有望用于血液环孢素浓度的测定。

探讨人文护理在内分泌护理中的作用1908-1911

摘要:为探讨人文护理在内分泌护理中的作用,选取2014年6月至2015年10月我院收治的120例接受治疗的内分泌疾病患者,按照随机数字的方法分为两组,每组60人。调查所有患者治疗期间和治疗后的护理的满意程度(不满意、满意及非常满意)、住院时间、心理状态评分及基础护理落实率。总满意率=(满意+非常满意)/总人数×100%。实验组患者总满意率为91.67%,对照组患者的总满意率为78.34%;其中十分满意比例以及总满意率水平比对照组高,而实验组患者的不满意比例较对照组低,比较差异均有统计学意义(P〈0.05)。同时实验组患者的住院时间、心理状态评分和基础护理落实率值均比对照组高,比较差异均有统计学意义(P〈0.05)。研究结果表明人文护理可以显著提高内分泌患者护理满意率,降低患者住院时间,同时通过呵护病人,减少其心理恐惧。因此,临床上应大力推广人文护理在内分泌护理中的应用。

International Journal of Molecular Veterinary Research (IJMVR)1911-1911