黄粉甲抗冻蛋白基因克隆及生物信息学分析

作者:任谦; 熊鸿燕; 朱才众; 张世界

摘要:目的:获得黄粉甲抗冻蛋白基因afpTx及相关生物信息学资料.方法:从黄粉甲幼虫中提取总RNA,通过RT-PCR合成黄粉甲抗冻蛋白基因afpTx的cDN段,克隆入载体pMD19-T,进行测序分析.酶切后将其亚克隆入表达载体pET32a(+),构建表达质粒pET32a-afpTx,并转化到大肠杆菌DL21后提取质粒,双酶切鉴定.采用MEGA4.0,BioEdit5.0.6软件对本研究克隆的抗冻蛋白基因afpTx进行氨基酸序列同源性变异及进化分析.结果:测序结果afpTx的cDNA长度为336bp;编码112个氨基酸;酶切、电泳结果表明克隆和亚克隆获得成功.抗冻蛋白氨基酸序列相似性分析表明afpTx与GenBank上提交的23条黄粉甲抗冻蛋白的氨基酸序列平均一致性为88%;与11条赤翅甲抗冻蛋白氨基酸序列的平均一致性为67%,2种甲虫的平均一致性为63%.进化树分析结果显示黄粉甲与赤翅甲抗冻蛋白序列是同源序列.赤翅甲的序列趋异度显著大于黄粉甲抗冻蛋白基因序列.结论:成功克隆了本地黄粉甲的afpTx基因,该序列是GenBank上提交的黄粉甲与赤翅甲抗冻蛋白的同源序列.

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关键词:
  • 黄粉甲
  • 抗冻蛋白
  • 克隆
  • afptx基因
  • 生物信息学

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期刊名称:医学争鸣

期刊级别:部级期刊

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杂志介绍:
主管单位:第四军医大学
主办单位:第四军医大学
出版地方:陕西
快捷分类:医学
国际刊号:1674-8913
国内刊号:61-1481/R
邮发代号:52-86
创刊时间:2010
发行周期:双月刊
期刊开本:A4
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