番茄枯萎病菌基因组微卫星位点分析与引物设计

作者:罗梅; 李书锋; 罗媛子; 王嘉熠; 董章勇

摘要:通过对前期测定的番茄枯萎病菌 Fusarium oxysporum f. sp. lycopersic 基因组14 501条gene序列进行搜索,发现466个简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)分布在425条unigenes中,发生频率为2.93%.在番茄枯萎病基因组的SSR中,三核苷酸重复占主导地位,占SSR总数的65.88%.优势重复单元为AGC/CTG和AAG/CTT,分别占16.52%和12.66%.基于筛选的SSRs,运用Primer3软件进行引物的批量设计,共设计出451对引物.结果说明番茄枯萎病菌基因组中含有丰富的SSR位点.

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关键词:
  • 番茄枯萎病
  • 基因组
  • 简单重复序列
  • 微卫星dna
  • 引物

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期刊名称:仲恺农业工程学院学报

期刊级别:省级期刊

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杂志介绍:
主管单位:广东省教育厅
主办单位:仲恺农业工程学院
出版地方:广东
快捷分类:教育
国际刊号:1674-5663
国内刊号:44-1660/S
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创刊时间:1988
发行周期:季刊
期刊开本:A4
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