基于网络药理学的牡丹属抗流感病毒的作用机制研究简

作者:蔡亚启; 包雅婷; 王虹巾; 任晓东; 黄林芳; 何洁; 刘甜甜; 曾锐

摘要:该研究采用网络药理学虚拟筛选的方法,筛选牡丹抗流感病毒作用的潜在活性成分,预测抗流感病毒的作用靶点,探讨牡丹抗流感病毒活性的作用机制。首先,通过近10年中外文文献的查询汇总了牡丹属301个小分子化合物,使用PubChem和Chemical Book等数据库进行结构确认,并借助Chem Draw,Avogadro和Discovery Studio Visualizer软件对其进行分子对接配体的构建。其次,结合STITCH靶标数据库和文献的查找拟定了23个潜在抗流感病毒的作用靶点,采用Uniprot数据库找到相对应的基因靶点,并通过RCSB网站寻找相对应的蛋白亚型的PDB ID以及阳性小分子结构为分子对接的受体,利用Quick Vina 2.0软件进行分子对接。最后,借助Cytoscape 3.5.1软件绘制牡丹抗流感病毒潜在活性成分与抗流感病毒作用靶点网络图,使用Uniprot在线数据库进行其靶点GO分析和KEGG代谢通路分析。结果显示,牡丹中有74个化合物具有良好抗流感病毒作用,筛选得到18个潜在的抗流感病毒作用靶点,通过GO分析推断牡丹抗流感病毒的作用机制与神经氨酸酶抗流感病毒机制基本一致,以阻止病毒的出芽、分散、扩散,使病毒的感染能力下降,使感染受限,从而达到抗流感病毒的作用。

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关键词:
  • 牡丹
  • 网络药理学
  • 抗流感病毒
  • 分子对接

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期刊名称:中国中药

期刊级别:北大期刊

期刊人气:37981

杂志介绍:
主管单位:中国科学技术协会
主办单位:中国药学会
出版地方:北京
快捷分类:医学
国际刊号:1001-5302
国内刊号:11-2272/R
邮发代号:
创刊时间:1955
发行周期:半月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
复合影响因子:2.5
综合影响因子:3.87