内蒙古地区全沟硬蜱细菌群落结构及多样性分析

作者:李思思; 张晓雨; 张艳凯; 刘敬泽

摘要:目的了解全沟硬蜱细菌的群落结构及种群多样性。方法应用罗氏454高通量测序技术对内蒙古地区全沟硬蜱细菌16S rDNA基因的V3高变异区段进行测定,分析其细菌的群落结构、种群多样性、优势菌群以及常见病原体的分布。结果获得用于分析的序列和操作分类单元(OTUs)数目分别为22 727条和1 570个;所有样本的覆盖度均≥0.95,表明本次测序量充分,基本可覆盖所有细菌物种。其中,雄蜱样本的丰富度指数、多样性指数最高,分别为2 431和4.11;其次为雌蜱和卵。全沟硬蜱中优势菌群依次为变形菌门、厚壁菌门、放线菌门,其中以α-变形菌纲相对丰度最高;在属水平上,不同类别样本中相对丰度较高的菌属组成差异较大。在样本中检测到致病菌塔拉塞维奇立克次体、螺原体和宫本疏螺旋体,环境细菌如金黄杆菌属、欧文菌、短波单胞菌等,以及母系遗传共生菌(Montezuma)。结论内蒙古地区全沟硬蜱不同样本间细菌群落和丰度具有较大差异。

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关键词:
  • 全沟硬蜱
  • 细菌群落结构
  • 多样性
  • 16s
  • rdna
  • 罗氏454高通量测序

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期刊名称:中国媒介生物学及控制

期刊级别:北大期刊

期刊人气:1572

杂志介绍:
主管单位:国家卫生健康委员会
主办单位:中国疾病预防控制中心
出版地方:北京
快捷分类:医学
国际刊号:1003-8280
国内刊号:10-1522/R
邮发代号:18-265
创刊时间:1990
发行周期:双月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
复合影响因子:1.03
综合影响因子:1.71