笛鲷属(Lutjanus)鱼类线粒体16S rRNA基因序列比较及系统学分析

作者:刘楚吾 徐田军 刘丽 郭昱嵩 董秋芬

摘要:对笛鲷属9种鱼的线粒体DNA 16S rRNA基因片段进行了PCR扩增,扩增产物经纯化后测序,得到了长度为561bp的分析序列。结合GenBank中的另外9种笛鲷的16S rRNA同源序列计算得出A、T、G、C的含量平均为28.5%、22.1%、23.6%和25.8%,AT含量稍高于GC含量,18种笛鲷碱基组成差异不大。利用MEGA3.1软件对所得序列进行比对后检测到72个变异位点,其中包括简约信息位点44个,在变异位点中75.61%的碱基替换是由于发生了转换,转换/颠换平均为3.1:1。计算了种间的遗传距离,结果表明,序列差异在0.0193—0.0680之间,其中勒氏笛鲷和金焰笛鲷、勒氏笛鲷和金带笛鲷的序列差异最小,而红鳍笛鲷和金焰笛鲷、红鳍笛鲷和画眉笛鲷的序列差异最大。选用高体四长棘鲷(Argyrops spinifer)为外群,利用NJ法构建了分子系统树,结果表明:本研究中的9种南海笛鲷与其它9种笛鲷进化关系较远;并且南海9种笛鲷相互之间仍然保持着着相对较远的遗传距离,遗传多样性较好,

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关键词:
  • 笛鲷属
  • 16s
  • rrna
  • 序列比较
  • 分子系统学

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期刊名称:海洋与湖沼

期刊级别:北大期刊

期刊人气:4428

杂志介绍:
主管单位:中国科学技术协会
主办单位:中国海洋湖沼学会
出版地方:山东
快捷分类:化学
国际刊号:0029-814X
国内刊号:37-1149/P
邮发代号:2-421
创刊时间:1957
发行周期:双月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
复合影响因子:0.8
综合影响因子:1.1