绿萝叶腐病病原菌16 S rDNA序列的克隆与分析
作者：邬张颖; 徐凡舒; 钟依妮; 马佳莹; 朱欣; 张慧娟; 蒋明
摘要：为绿萝叶腐病病原菌菌株LR12的分子鉴定和应用研究提供参考,利用PCR法克隆其16S序列,并借助生物信息学方法进行分析,明确其16S rDNA序列特征。结果表明:以YFUP/YFDN为PCR引物,扩增到大小约为1700 bp的条带;LR12的16S rDNA全长为1551 bp,GC为53.9%;LR12与胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种的16S rDNA相似性最高,达100%,与巴西亚种的相似性次之,为99.9%,两者存在2个碱基的差异;15种细菌在发育树上可分为5组,其中LR12与胡萝卜软腐果胶杆菌巴西亚种的关系最近,处于同一分支,支持率达100%,并与其他2种果胶杆菌属细菌聚在同一组。
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关键词：
- 绿萝
- 叶腐病病原菌
- 菌株lr12
- 胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种
- 16s
- rdna
- 克隆
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