荧光定量PCR对FEN1敲低细胞株转录组测序结果的验证

作者:苏倩; 吴洁; 杜佳慧; 杨凡; 袁濮玉; 刘松柏; 邱秀芹

摘要:目的探讨DNA分枝结构特异性内切酶-1(FEN1)基因敲低细胞株及对照细胞株的差异表达基因,用实时荧光定量PCR方法进行结果验证。方法从293T野生型及293T FEN1敲低细胞株中提取RNAs,并反转录成cDNA;挑选10个转录组测序中差异表达的基因,设计引物,利用SYBR Green染料法,定量检测挑选基因的表达情况。结果挑选的10个差异表达基因中,成功扩增了其中7个基因;通过实时荧光定量PCR方法对两组细胞的7个基因进行定量检测发现,与转录组测序结果相比较,其中有2个没有明显差异,另外5个基因荧光定量方法的检测结果与转录组测序结果一致。结论在细胞内基因表达水平检测中,为提高转录组测序结果的可靠性,还需通过实时荧光定量PCR方法对其结果进一步验证。

分类:
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关键词:
  • 荧光定量pcr
  • fen1
  • rna
  • 信使
  • 转录组
  • 测序
  • 基因敲低技术

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期刊名称:重庆医学

期刊级别:统计源期刊

期刊人气:47324

杂志介绍:
主管单位:重庆市卫生健康委员会
主办单位:重庆市卫生健康统计信息中心;重庆市医学会
出版地方:重庆
快捷分类:医学
国际刊号:1671-8348
国内刊号:50-1097/R
邮发代号:78-27
创刊时间:1972
发行周期:半月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
复合影响因子:2.31
综合影响因子:2.05