基于RNA—Seq转录组测序技术揭示南方黄牛肉质嫩度调控相关的分子机制

作者:孟祥忍; 张成龙; 樊永亮; 王文强; 毛永江; 黄必志; 亏开兴; 杨章平

摘要:为揭示南方黄牛肉质调控的分子机制并挖掘与肌肉嫩度相关的功能基因,本研究以1周岁左右的云岭牛、文山牛和中国西门塔尔牛为试验对象,屠宰后测定背最长肌不同排酸时间(0、1、2、3、5、7 d)下剪切力变化,揭示不同黄牛品种肌肉嫩度的差异,利用RNA—Seq技术对背最长肌进行比较转录组学分析,并结合生物信息学筛选与肌肉嫩度调控相关的信号通路及差异表达基因,最后利用qPCR进行验证。结果表明:在宰后成熟过程中,黄牛肌肉嫩度表现为明显的下降趋势,且在同一个成熟时间点下,剪切力值表现为西门塔尔牛〉文山牛〉云岭牛,表明云岭牛嫩度较好,而西门塔尔牛嫩度相对较差;云岭牛与西门塔尔牛背最长肌2组文库经测序后,筛选出3 198个差异表达基因,其中云岭牛上调基因1 750个,KEGG功能注释发现2个与肉质调控相关的重要信号通路:脂肪细胞因子信号通路和内质网蛋白加工通路,结合qPCR验证、基因表达水平与剪切力值相关性分析,最终筛选出Leptin和CAPN12个可能肌肉嫩度相关的功能基因。本研究筛选与鉴定出南方黄牛肌肉嫩度相关信号通路及其关键基因,为今后南方黄牛肉质遗传改良奠定理论基础。

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关键词:
  • 南方黄牛
  • 嫩度
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期刊名称:中国畜牧

期刊级别:北大期刊

期刊人气:14273

杂志介绍:
主管单位:中国科学技术协会
主办单位:中国畜牧兽医学会
出版地方:北京
快捷分类:农业
国际刊号:0258-7033
国内刊号:11-2083/S
邮发代号:82-147
创刊时间:1953
发行周期:月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
复合影响因子:1.05
综合影响因子:1.41