摘要：家蚕灰僵病为低频率发生的家蚕真菌性地方病,病原为爪哇棒束孢。采用ISSR分子标记对安徽潜山和浙江桐乡的2个家蚕灰僵病病原种群进行了指纹图谱分析。利用12个ISSR引物共扩增出132个位点,其中多态位点数为93个,占70.45%。在种群水平上的Nei’s遗传多样性指数（h）和Shannon’s指数（Is）具有一致性。采用UPGMA法进行聚类分析,来自2个地区的19个菌株在遗传相似系数0.76处完全按地理来源分为2个类群;基于ISSR信息的三维主坐标分析（PCA）结果与分子聚类结果一致。2个家蚕灰僵病病原种群间的基因流（Nm）为0.5106,遗传分化系数（Gst）为0.3287,说明种群间遗传多样性高于种群内。2个种群单独聚类表明,潜山地方病种群在0.8的相似处有一个明显的优势类群,而桐乡种群未表现出优势性。上述分析可知,家蚕灰僵病病原种群表现出与地理来源相关的空间异质性,种群异质性是地方病种群维持的重要原因。