通过微阵列数据信息库进行系统筛选并验证宫颈癌中的关键候选基因

作者:何文容; 许荣

摘要:目的:通过生物信息学方法分析NCBI公共数据库的4个队列数据集,阐明宫颈癌中潜在的关键候选基因和信号通路。方法:筛选差异表达的基因(DEG)并分析候选基因和途径富集。利用在线数据库STRING进行DEG编码的相关蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)分析。选取宫颈癌和正常组织标本,采用qPCR验证筛选的中枢基因。结果:从4个GSE数据集中鉴定出79个差异基因(69个上调和10个下调)。根据功能和信号通路对DEG进行聚类,并进行显著的富集分析。通过PPI网络的整合筛选4个中枢基因RFC4、TOP2A、PCNA和BUB1。与正常组织相比,癌组织中RFC4、TOP2A、PCNA和BUB1表达明显升高,差异有统计学意义。结论:使用整合的生物信息学分析,在宫颈癌中鉴定了候选基因和途径,候选基因和相关途径可能是宫颈癌的治疗靶标。

分类:
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关键词:
  • 差异表达的基因
  • 宫颈癌
  • 生物信息学
  • 验证

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期刊名称:现代妇产科进展

期刊级别:北大期刊

期刊人气:7836

杂志介绍:
主管单位:中华人民共和国教育部
主办单位:山东大学;现代妇产科进展编辑委员会
出版地方:山东
快捷分类:医学
国际刊号:1004-7379
国内刊号:37-1211/R
邮发代号:24-104
创刊时间:1989
发行周期:月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
复合影响因子:1.09
综合影响因子:1.98