肠炎沙门菌多位点序列分型技术的研究

作者:李燕俊 计融 王玉平 江涛 崔生辉 刘秀梅

摘要:目的研究肠炎沙门菌菌株间的分子特征,建立了分子流行病学研究方法——多位点基因序列分型技术(MLST),并对食品中的肠炎沙门菌分离株进行分型研究。方法选择肠炎沙门菌的6个管家基因thrA、purE、sucA、aroC、hemD、dnaN及一个特异性的DNA标记SdfΙ作为目标基因。对上述基因分别进行PCR扩增及产物测序,用sequencer2.0软件对测序结果进行分析、比对核苷酸的差异。同时,将肠炎沙门菌株与GenBank中鼠伤寒沙门菌LT2相应的基因序列进行比较。结果在肠炎沙门菌标准菌株50041和18株食品分离株之间,6个基因PCR产物范围内的近60000个核苷酸序列完全相同,未观察到同一血清型内的基因突变。而与LT2相比,基因产物发生了1到6个点突变。在对SdfΙ的核苷酸序列比较研究中发现,肠炎沙门菌标准菌株与食品中分离株SdfΙ的核苷酸序列与GenBank中该序列的碱基对比,发生了C182T的点突变。即MLST技术揭示了在同一血清型内各菌株管家基因碱基序列的高度保守。结论MLST方法适用于不同血清型沙门菌株间的分型研究,而不适于同一血清型的菌株分型。

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关键词:
  • 肠炎沙门菌
  • 管家基因
  • 序列分析
  • 鼠伤寒沙门菌lt2

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期刊名称:卫生研究

期刊级别:北大期刊

期刊人气:3988

杂志介绍:
主管单位:中华人民共和国卫生部
主办单位:中国疾病预防控制中心
出版地方:北京
快捷分类:医学
国际刊号:1000-8020
国内刊号:11-2158/R
邮发代号:82-720
创刊时间:1972
发行周期:双月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
复合影响因子:0.76
综合影响因子:1.26