基于物化性质对嗜热蛋白的预测

作者:刀福英; 陈欣欣; 林昊

摘要:嗜热蛋白在高温下能保持稳定性和活性,是研究蛋白质热稳定性的理想模型,开发一个蛋白质热稳定性识别的方法将对蛋白质工程和蛋白质的设计很有帮助。目前的研究中,氨基酸的组成及其物化性质一直被认为和蛋白质的热稳定性相关。本研究筛选出可靠的数据集,包括915个嗜热蛋白和793个非嗜热蛋白。利用蛋白质氨基酸的物化性质和氨基酸的组成表征嗜热蛋白,将二肽氨基酸组成整合到9组氨基酸物化性质中使蛋白序列公式化。支持向量机5折叠交叉验证表明:当gap=0时,290个特征产生的精度最高,为92.74%。因此说明对于分析蛋白质的热稳定性,所建立的预测模型将是一个很有效的工具。

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关键词:
  • 嗜热蛋白
  • 热稳定性
  • 伪氨基酸组分
  • 氨基酸物化性质

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期刊名称:生物信息学

期刊级别:统计源期刊

期刊人气:3117

杂志介绍:
主管单位:中华人民共和国工业和信息化部
主办单位:哈尔滨工业大学
出版地方:黑龙江
快捷分类:生物
国际刊号:1672-5565
国内刊号:23-1513/Q
邮发代号:14-14
创刊时间:2003
发行周期:季刊
期刊开本:A4
下单时间:1个月内
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综合影响因子:0.81