摘要：环境DNA metabarcoding（eDNA metabarcoding）是指利用环境样本（如土壤、水、粪便等）中分离的DNA进行高通量的多个物种（或高级分类单元）鉴定的方法。近年来，该方法引起了学者的广泛关注，逐渐应用于生物多样性研究、水生生物监测、珍稀濒危物种和外来入侵物种检测等生态学领域。介绍环境DNA metabarcoding的含义和研究方法；重点介绍环境DNA metabarcoding在物种监测、生物多样性研究和食性分析等生态学领域中的应用；总结环境DNA metabarcoding应用于生态学研究领域面临的挑战并对该方法的发展进行展望。