摘要：国内外对土壤线虫的研究绝大部分都是基于旱地的非根际土壤,对水田土壤,尤其是水旱轮作下根际土壤线虫对有机肥的响应研究非常地有限。因此,探讨在稻麦轮作体系中以猪粪堆肥和秸秆为原料的不同有机类肥料,对水稻和小麦根际土壤线虫的影响。田间试验处理为：CK（不施肥）、F（100%化肥）、PF（猪粪堆肥＋50%化肥）、SF（秸秆全量还田＋100%化肥）、PSF（猪粪堆肥＋秸秆全量还田＋50%化肥）、PMF（猪粪商品有机无机复合肥）。结果表明：小麦根际主要线虫优势属为头叶属（Cephalobus）、拟丽突属（Acrobeloides）和丝尾垫刃属（Filenchus）;水稻根际则为杆咽属（Rhabdolaimus）、潜根属（Hirschmanniella）和丝尾垫刃属（Filenchus）。小麦根际土壤线虫总数显著高于水稻根际;SF和PSF对两季土壤线虫总数的提高显著高于PF和PMF,F对线虫总数没有显著影响。线虫营养类群表现为小麦根际食真菌线虫相对丰度显著高于水稻根际,植食性线虫和杂食/捕食性线虫丰度显著低于水稻根际。有机肥对稻季线虫群落的影响远大于麦季,秸秆配施有机肥显著提高麦季瓦斯乐斯卡指数（WI）;施肥均显著提高稻季的多样性指数（H＇）,降低优势度指数（λ）。土壤线虫对肥料的响应取决于作物及肥料的质量和养分含量;在稻麦轮作系统下,同时添加秸秆和猪粪对提高土壤线虫数量和食微线虫丰度更有益。