摘要：研究利用20个微卫星标记对菲律宾蛤仔斑马蛤F2代家系107个个体进行遗传多样性分析,并对标记位点与生长相关性状进行分析。在20个微卫星位点共检测到41个等位基因,各位点等位基因数为2—3个,等位基因片段大小为109—430 bp,平均等位基因数为2.05个。平均有效等位基因数为1.71个,观测杂合度平均值为0.504,期望杂合度的平均值为0.431,平均多态信息含量为0.324。经卡方检验,3个位点SSR11,SSR164和SSR213的基因型分布显著偏离了孟德尔定律（P〈0.01）。运用SPSS 20.0对20个微卫星位点与菲律宾蛤仔斑马蛤家系生长性状的相关性（壳长、壳宽、壳高和体重）进行连锁显著性检验。结果表明,SSR9位点与壳高存在显著的相关关系（P〈0.05）,SSR135和SSR164位点与壳宽呈显著相关（P〈0.05）,SSR142位点与体重呈显著性相关（P〈0.05）。研究结果可为菲律宾蛤仔的分子标记辅助选育提供参考。