摘要：基于ISSR分子标记技术,对来自舟山群岛4个獐（Hydropotes inermis）养殖种群的遗传多样性和遗传结构进行了分析。26条ISSR引物共扩增出286个可分析位点,多态位点百分比（PPL）为64.34%。獐物种水平上的Nei’s遗传多样性指数（H）为0.210,Shannon’s多态信息指数（I）为0.318,各种群的H介于0.157—0.190之间,I在0.228—0.278之间,与已报道的ISSR标记在其它动物物种中的应用结果相比,其遗传多样性较为丰富。Structure软件分析结果显示,所有个体根据遗传信息的不同可以被分为4个组群,每个养殖场内的个体基本上都在各自独立的组群中,这与地理区域的划分相似。另外发现各养殖场獐种群间已表现出了较大的遗传分化（Gst=0.163）。同时,为了解各种群间的遗传关系,计算了各种群间的Nei’s遗传距离,结果显示舟山种群（ZS）和秀山种群（XS）之间的遗传距离最近,为0.045,而岱山种群（DS）和朱家尖种群（ZJJ）间的遗传距离最大,为0.066。基于以上结果,建议加强不同岛屿种群间的个体交流,特别是朱家尖种群（ZJJ）与其它种群间的交流。