基于线粒体细胞色素C氧化酶亚基I基因序列的帘蛤科贝类分子系统发育研究

作者:程汉良 彭永兴 董志国 易乐飞 孟学平 申欣 周旻纯 陈冬勤

摘要:对21种帘蛤科贝类线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(cytochromeCoxidasesubunitI,C01)基因核苷酸序列进行了分析,以探讨这一序列在种质鉴定、分子系统发生研究中的应用价值。测序结果表明,所有物种扩增片段长度均为707bp(含引物),序列A+T含量(62.4%-67.8%)明显高于G+C含量。物种间共有变异位点379个,其中简约信息位点334个;此区段共编码235个氨基酸,种间共有氨基酸变异位点100个。以COI基因片段序列为标记,用中国蛤蜊(Mactrachinensis)作外群,构建了35种帘蛤科贝类(其中14种贝类C01序列从GenBank下载)的系统发生树,结合拓扑结构分析和序列比对分析,结果表明:支持将短文蛤(Meretrixpetechinalis)和丽文蛤(M.1usoria)订为文蛤(M.meretrix)的同物异名的观点,建议将丽文蛤和短文蛤订为文蛤的地理亚种;支持将薄片镜蛤(Dosiniacorrugata)和D.angulosa订为2个独立种的观点;认为将波纹巴非蛤(Paphiaundulata)和织锦巴非蛤(P.textile)订为2个独立种是合适的。C01基因序列含有丰富的遗传信息,适合作为帘蛤科贝类种群遗传结构和系统发生研究的分子标记。.

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关键词:
  • 帘蛤科
  • 线粒体dna
  • 系统发生

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期刊名称:生态学报

期刊级别:北大期刊

期刊人气:5700

杂志介绍:
主管单位:中国科学技术协会
主办单位:中国生态学会;中国科学院生态环境研究中心
出版地方:北京
快捷分类:生物
国际刊号:1000-0933
国内刊号:11-2031/Q
邮发代号:82-7
创刊时间:1981
发行周期:半月刊
期刊开本:B5
下单时间:1-3个月
复合影响因子:3.21
综合影响因子:4.06