转mapk双链RNA干扰表达载体黄瓜对根际土壤细菌多样性的影响

作者:陈国华 弭宝彬 李莹 李春月

摘要:随着RNA干扰技术的发展,通过植物表达病原物特异的dsRNA来防治植物病害的转基因作物越来越多。转根结线虫mapk双链RNA表达载体的黄瓜能够通过RNA干扰作用沉默线虫的mapk基因,对根结线虫具有良好的防治效果。为了评价该转基因黄瓜的安全性,明确mapk双链RNA干扰表达载体转基因黄瓜植株对根际土壤细菌多样性的影响,采用16S rRNA基因克隆文库方法对非转基因黄瓜和转基因黄瓜土壤细菌群落多样性进行分析。结果表明,非转基因黄瓜土壤细菌文库包含124个OTU(可操作分类单元),转基因黄瓜土壤细菌文库包含122个OTU。2个文库共同拥有的OTU为115个。2个文库都包含13个类群细菌,Acidobacteria、Actinobacteria、Armatimonadetes、Bacteroidetes、candidate division BRC1、Chloroflexi、Firmicutes、Gemmatimonadetes、Nitrospira、Planctomycetes、Proteobacteria、Verrucomicrobia、unclassified_Bacteria。其中Proteobacteria、Bacteroidetes、Chloroflexi和Acidobacteria是优势菌群。其他细菌类群数量相对较少。在纲分类水平上,两个文库包含的细菌类群一致,且各类群细菌比例差异不大。在Acidobacteria门中,Acidobacteria_Gp6为优势菌群。在Bacteroidetes门中,Sphingobacteria纲细菌数量最多。在Chloroflexi门中,unclassified Chloroflexi细菌最多。在Proteobacteria门中,其中Betaproteobacteria纲的细菌数量最多。从多样性指数角度分析,两种土壤细菌群落的Shannon、Simpson和Chao值差异不大。总体来看,两种土壤细菌类群差异不显著,转基因黄瓜未对根际土壤细菌群落产生明显影响。

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关键词:
  • 土壤细菌
  • 16s
  • rrna
  • 克隆文库
  • 转基因黄瓜

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期刊名称:生态学报

期刊级别:北大期刊

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杂志介绍:
主管单位:中国科学技术协会
主办单位:中国生态学会;中国科学院生态环境研究中心
出版地方:北京
快捷分类:生物
国际刊号:1000-0933
国内刊号:11-2031/Q
邮发代号:82-7
创刊时间:1981
发行周期:半月刊
期刊开本:B5
下单时间:1-3个月
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综合影响因子:4.06