摘要：短花针茅（Stipa breviflora）属亚洲中部荒漠草原种,分布范围极其广泛,为荒漠草原地带重要的牧草资源。在内蒙古地区,短花针茅群落类型复杂多样,与本氏针茅（S.bungeana）、小针茅（S.klemenzii）和克氏针茅（S.krylovii）均能共同建群,具有很广的生态幅和很强的适应能力。研究以8个不同的短花针茅地理种群为对象,随机采集健康、无锈短花针茅叶片样本,通过RAPD（Random Amplified Polymorphism DNA,RAPD）分析,研究短花针茅种群的遗传多样性,丰富人们对短花针茅生物多样性的认识,也为合理利用短花针茅草原提供依据。结果表明,（1）从102条10碱基随机引物中筛选出28条有效引物,共扩增出308条DNA带,多态性DNA带151条,占49.03%,特异性DNA带45条,占14.61%。（2）遗传多样性较为丰富,多态性位点百分率为49.03%,但低于同种方法获得的大针茅（54.75%）和克氏针茅（74.67%）的遗传多样性。（3）等级聚类、PCA分析和UPGMA聚类3种不同方法都将8个不同地理种群分为同样的两类：暖温性种群和中温性种群,热量差异是主导因素,而且,与种群的空间分布相吻合。（4）经Mantel检验发现,遗传距离与地理距离存在显著相关性（r=0.534,P〈0.05）。（5）Pearson相关分析表明,特异性位点百分率与≥10℃积温、干燥度和年平均降水量之间均无显著相关性。