摘要：随着新的分析技术的不断出现和成熟，促进了微生物分子生态学及相关学科的诞生和迅速发展。其中，元基因组文库分析技术即是近年来微生物分子生态学研究领域兴起的一种新的分析技术。就元基因组分析技术诞生的背景及该技术的原理进行了讨论，着重阐述了元基因组文库分析技术在寻找新基因、开发新的生物活性物质、研究群落中微生物多样性、人类元基因组测序等方面的应用。另外，归纳总结了目前国际上常用的诸如PCR为基础的筛选、荧光原位杂交（fluorescent in situ hybridization，FISH）、底物诱导的基因表达筛选（substrate induced gene expression screening，SIGEX）、基因芯片等元基因组文库筛选方法，并就不同方法的优缺点进行了分析和讨论，指出了目前元基因组文库分析技术存在的主要问题并对今后该技术的发展进行了展望。