摘要：本研究以典型的瘦肉型（杜洛克）和肥胖型（陆川）猪种为模型，利用新一代RRBS （Reduced Representation Bisulfite Sequencing）技术研究两猪种脂肪组织基因组启动子及CpG岛（CpG Islands，CGls）的DNA甲基化差异。我们分别取得杜洛克、陆川样本中的Clean Reads 98720992、97254298，占各样品Reads的99．4％和99．56％;得到两样品中甲基化C位点（mC）中CG类型的甲基化所占比例最大；得到不同分布类型的mC差异；结果成功鉴定出两猪种脂肪组织基因组中的差异甲基化区域（Differentially methylated regions, DMRs），发现瘦肉型猪种（杜洛克）甲基化水平更高；共筛选出792个差异甲基化基因（Differentially methylated gene,DMG），对其进行GO、KEGG富集分析，得到其主要影响intracellular part、binding和biological regulation等生物学过程，参与了endocytosis、MAPK signaling pathway和calcium signaling pathway等与脂肪代谢相关的通路。本研究探索了脂肪代谢的表观遗传调控机制，为优质、高效的猪肉生产提供参考数据。