拟南芥与水稻AAAP家族基因的鉴定与比较分析

作者:王红星; 张菊; 于德水; 周琳; 胡利宗

摘要:AAAP蛋白广泛存在于各种生物中,在生物生长与发育过程中扮演重要作用。本研究基于生物信息学方法对水稻和拟南芥AAAP进行系统剖析,旨在深入认识该家族基因的序列、表达及进化特征。结果显示:拟南芥包括49个AAAP基因,水稻包括71个AAAP基因,这些基因被分为3个类群,细分为13个亚类群;不同类群基因结构和保守基序均显示较高的多样性,亚类群水平基因结构和保守基序显示出较高的保守性,这说明该家族基因具有多样化的功能;进化树末端的同源基因对之间表达情况分化程度较高,但其进化速率具有较高的同质性,这说明同源基因对的分化主要体现在表达变化上。这些结果有助于研究其它植物AAAP家族基因的功能。

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关键词:
  • 拟南芥
  • 水稻
  • aaap家族
  • 序列
  • 进化

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期刊名称:基因组学与应用生物学

期刊级别:北大期刊

期刊人气:9301

杂志介绍:
主管单位:广西大学
主办单位:广西大学
出版地方:广西
快捷分类:农业
国际刊号:1674-568X
国内刊号:45-1369/Q
邮发代号:48-213
创刊时间:1982
发行周期:月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
复合影响因子:1.11
综合影响因子:0.89