羽叶三七的转录组测序与三萜皂苷生物合成的关键酶基因的识别

作者:黄勋; 金健; 余洁; 韩喆; 闫祺; 陈平

摘要:羽叶三七是五加科人参属的名贵药材,三萜皂苷为羽叶三七最主要的活性成分。为了探索羽叶三七根茎中皂苷物质生物合成的分子基础,采用Illumina HiSeq2000高通量测序获得羽叶三七根茎的转录组数据;使用Trinity和TGICL软件实现Un iGene的derbovo拼接;基于BLAST完成UniGene的蛋白功能注释、KOG功能注释、GO分类和KEGG代谢通路分析。最终通过de novo拼接注释得到Uni Gene62240个。研究发现,羽叶三七根茎部表达的26个Uni Gene与三萜碳环骨架合成相关;三萜合成通路中的关键酶FPS、SS、SE等,分别有11114个UniGene。该研究发现的三萜皂苷合成相关候选基因对于阐明羽叶三七三萜皂苷合成方式研究提供了理论基础。

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关键词:
  • 羽叶三七
  • 转录组测序
  • 三萜合成关键酶

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期刊名称:基因组学与应用生物学

期刊级别:北大期刊

期刊人气:9289

杂志介绍:
主管单位:广西大学
主办单位:广西大学
出版地方:广西
快捷分类:农业
国际刊号:1674-568X
国内刊号:45-1369/Q
邮发代号:48-213
创刊时间:1982
发行周期:月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
复合影响因子:1.11
综合影响因子:0.89