基因组学与应用生物学杂志

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基因组学与应用生物学杂志 北大期刊 CSCD期刊 统计源期刊

Genomics and Applied Biology

  • 45-1369/Q 国内刊号
  • 1674-568X 国际刊号
  • 1.11 影响因子
  • 1-3个月下单 审稿周期
基因组学与应用生物学是广西大学主办的一本学术期刊,主要刊载该领域内的原创性研究论文、综述和评论等。杂志于1982年创刊,目前已被维普收录(中)、CA 化学文摘(美)等知名数据库收录,是广西大学主管的国家重点学术期刊之一。基因组学与应用生物学在学术界享有很高的声誉和影响力,该期刊发表的文章具有较高的学术水平和实践价值,为读者提供更多的实践案例和行业信息,得到了广大读者的广泛关注和引用。
栏目设置:综述与专论、研究论文、研究报告、实验技术。

基因组学与应用生物学 2017年第02期杂志 文档列表

基因组学与应用生物学杂志分子医学与临床应用
HLA-DQB1*02、03基因及IFN-γ、IL-4与广西壮、瑶族肝癌家族聚集性的相关性410-418

摘要:本研究探讨HLA-DQB1*02、03等位基因及细胞因子IFN-γ和IL-4与广西壮、瑶族肝癌家庭聚集性的相关性。将来自肝癌高发区,民族为瑶族的肝癌高发家族成员、无癌家族成员各40例及民族为壮族的肝癌高发家族成员、无癌家族成员各48例作为研究对象(采用相同性别,年龄(±5岁)配对方法),采集研究对象外周血并提取全血DNA,采用PCR-SSP技术检测受试者的HLA-DQB1*02和HLA-DQB1*03等位基因,IFN-γ及IL-4细胞因子表达水平采用ELISA法检测。结果发现,HLA-DQB1*02、03基因在壮族肝癌高发家族成员组的表达频率均低于无癌家族成员组(p〈0.05);HLA-DQB1*02基因在瑶族肝癌高发家族成员组的表达频率高于无癌家族组(p=0.002),HLA-DQB1*03在两组间的表达频率无明显差异(p〉0.05)。广西壮、瑶族人群HLA-DQB1*02、03基因在乙肝病毒感染组及非感染组中的表达频率比较无显著性差异(p〉0.05)。壮、瑶族肝癌高发家族成员组IL-4平均表达水平均高于无癌家族成员组,肝癌高发家族成员组IFN-γ平均表达水平均低于无癌家族成员组,差异具有统计学意义(p〈0.05)。广西壮、瑶族人群中HLA-DQB1*02基因阳性和阴性成员的IL-4平均表达水平无明显差异(p〉0.05)。广西壮族人群中HLA-DQB1*03基因阳性成员的IFN-γ平均表达水平高于HLA-DQB1*03阴性成员(p=0.011),HLA-DQB1*03阳性和阴性成员的IL-4平均表达水平无明显差异(p〈0.05)。本课题得出结论,HLA-DQB1*02、03基因与广西壮、瑶族肝癌家庭聚集性有关,但存在较大的民族差异;细胞因子IFN-γ及IL-4的表达水平失衡可能是广西壮、瑶族肝癌家族聚集性的危险因素。HLA-DQB1*03基因导致广西壮族肝癌家族聚集性的发生可能是通过影响IFN-γ的表达水平来实现的。

MMP-2、MMP-3、MMP-9、TIMP-3及Col-Ⅱ因子在兔软骨细胞损伤后的表达变化419-425

摘要:检测MMP-2、MMP-3、MMP-9、TIMP-3及Ⅱ型胶原细胞外基质因子在正常兔关节软骨细胞和划伤后不同时间点的表达变化。在无菌条件下获取兔膝关节软骨细胞,原代体外培养软骨细胞,六孔板内制备细胞损伤模型。用显微镜观察正常细胞和损伤后1d、3d和7d3个时间点的软骨细胞增殖情况。采用实时PCR检测正常软骨细胞和损伤后1d、3d和7d3个时间点的基质金属蛋白酶-2、3和9,基质金属蛋白酶抑制物-3及Ⅱ型胶原的mRNA的表达水平。成功分离软骨,经原代培养后成功建立损伤细胞模型。MMP-2损伤后第1天与正常组相比升高,第3天时下降,第7天明显水平最高。与正常组相比,MMP-3在细胞损伤后第1天表达明显下降,随后第3天逐渐下降,第7天与第3天未见明显变化。MMP-9划伤后第1天比正常组升高,第3天上升至最高水平,第7天下降。TIMP-3基因在损伤后第1天与正常组相比明显下降,随后第3天稍有升高,第7天水平最低。Ⅱ型胶原划伤后第1天与正常组相比明显升高,随后第3天呈下降趋势接近于正常组,第7天又呈上升趋势。MMP-2、MMP-3、MMP-9、TIMP-3因子和Ⅱ型胶原在细胞损伤后的不同时间点有不同的表达行为,这可为调节细胞外基质基因治疗关节软骨损伤选择合适的靶基因和时间窗提供实验依据。

寨卡病毒基因组密码子偏爱性分析426-432

摘要:寨卡病毒是一类对人类危害极重的RNA病毒,为了解其密码子使用特点和主要影响因素,本研究采用CHIPS、CUSP、CodonW和SPSS软件对寨卡病毒所有基因序列进行了偏爱性分析和多元统计分析,获得了每个基因密码子3个位置的GC含量和ENC值以及所有基因序列的RSCU值,并与大肠杆菌、酵母、人的密码子使用频率进行了对比分析。结果显示,寨卡病毒GC,含量相对较高,为54.14%,ENC值为52.54,表明该病毒密码子偏爱性偏低且偏爱以G、C、A碱基结尾的密码子,这和一般病毒的偏爱性有所不同。中性绘图和ENC绘图分析表明密码子的偏爱性主要受到选择作用的影响。通过和其它3种生物密码子使用频率进行比较,发现其与人的密码子使用频率相差最小。在此基础上确定了寨卡的18个最优密码子。研究结果对寨卡病毒寻找最佳宿主进行体外表达,从而研发基因工程疫苗及治疗性抗体具有一定的意义。

中国地区汉族人类血小板抗原基因多态性研究433-444

摘要:为探讨中国汉族人群的人类血小板特异性抗原(human platelet antigens,HPA)的基因多态性特点并对南北方汉族人群进行比较,本研究合并了24个地区的28篇HPA基因多态性调查文献中HPA-1、HPA-2、HPA-3、HPA-4、HPA-5、HPA-6和HPA-15的基因分型数据,利用统计学方法及相关软件进行整理,并对整理后数据进行对比分析。结果显示HPA-1、HPA-2、HPA-3、HPA-4、HPA-5和HPA-6位点的a、b基因频率差距很大且bb基因型频率接近于0,而HPA-3和HPA-15位点的a、b基因频率差距不大。南北方汉族人群的比较中,HPA-1,和HPA-5的基因分型有所差异,而HPA-2的基因型频数分布差异有统计学意义(p〈0.05)。此结果旨在获取人类血小板抗原基因多态性的特点并提供建立人类血小板抗原数据库的相关资料,对临床输血的指导具有重要意义。

封面图片介绍444-444

摘要:H7N9型禽流感病毒(avian influenza A),属正粘病毒科甲型流感病毒属,其内部基因来自于H9N2禽流感病毒,是一种新型重配病毒。长江三角和珠江三角是人感染H7N9禽流感的高发地区,通常在冬春季节高发流行。主要经由呼吸道传播,

二苯乙烯苷对黑素细胞黑素合成及酪氨酸酶活性的影响445-449

摘要:为了研究何首乌有效成分二苯乙烯苷对黑素合成及黑素细胞酪氨酸酶活性的影响。采用体外培养的正常人表皮黑素细胞作为实验对象解法测定二苯乙烯苷作用72h后的黑素细胞黑素含量;多巴氧化法测定二苯乙烯苷作用72h后的黑素细胞酪氨酸酶活性。研究发现,3组不同浓度的药物对黑素合成产生了不同的影响。两组低浓度药物作用下黑素含量与对照组比较有所增加;一组较高浓度的药物抑制了黑素的合成。3组药物对酪氨酸酶活性也有不同影响,与对照组相比两组较低浓度的药物提高了实验对象酪氨酸酶的活性;而高浓度的药物对酪氨酸酶无明显的抑制或提高。

SMP30对肝癌细胞行为学影响及其与糖代谢关系研究450-455

摘要:糖代谢是癌症的一个典型特征,研究显示SMP30(senescence marker protein 30)是一种肝癌相关抗原,与脂代谢关系密切,为了探讨SMP30与糖代谢的变化是否相关,我们构建了稳定转染SMP30的人SK-HEP1肝癌细胞株。通过迁移实验、侵袭实验和CCK8实验对比检测了过表达SMP30组与对照组肝癌细胞的迁移、侵袭、增殖的情况;同时还检测了细胞的葡萄糖吸收、乳酸排出的情况。结果显示,与对照组相比,SMP30对SK-HEP1肝癌细胞株的迁移、侵袭有明显的抑制作用(p〈0.01);对细胞的增殖作用不明显(p〉0.05)。过表达SMP30对肝癌细胞的葡萄糖吸收和乳酸排出作用不显著(p〉0.05)。SMP30对肝癌细胞SK-HEP1的迁移、侵袭有一定的抑制作用,但这种作用与糖代谢关系不明显。

PKM2在白血病NB4细胞系的分布及对c-Myc蛋白的影响456-460

摘要:探讨PKM2在白血病NB4细胞中的分布情况及对c-Myc蛋白的影响。免疫荧光技术检测PKM2在NB4细胞中的分布情况。将含靶点序列的GV248载体、包装质粒Helper1.0和Helper2.0共转染293T细胞,包装慢病毒。收集病毒上清,浓缩纯化后感染NB4细胞,荧光显微镜观察感染效率,Western blotting检测PKM2和c-Myc蛋白的表达变化。CCK-8实验检测细胞增殖情况。结果显示,PKM2在NB4细胞核及细胞质中均有表达,细胞核中比例较大。成功构建LV-PKM2-RNAi病毒,感染的细胞PKM2和c-Myc表达下调(p〈0.05),细胞增殖能力降低(p〈0.05)。这些结果表明PKM2主要分布在NB4细胞核,抑制PKM2表达可明显抑制NB4细胞增殖,并抑制c-Myc蛋白表达。

不同剂量的舒芬太尼对中老年胸科手术患者苏醒的影响461-465

摘要:为探讨不同剂量的舒芬太尼对中老年胸科手术患者苏醒的影响,选择全身麻醉下行胸科手术的中老年患者100例,将所有患者随机分成A、B、C、D4组,设定D组为对照组,手术结束关胸前不进行舒芬太尼注射;A、B、C3组分别在手术结束关胸前静脉注射0.10μg/kg、0.15μg/kg和0.20μg/kg的舒芬太尼,对比4组患者麻醉前、麻醉后关胸时心率变化情况,记录四组患者手术过程中丙泊酚的用量,并对术后拔管时间、患者苏醒时间、患者自主恢复时间、术后躁动及呼吸抑制情况进行统计对比分析。结果显示,4组患者麻醉前心率差异不显著,在麻醉后关胸时D组的心率变化情况最大;A、B、C3组患者术后拔管时间、苏醒时间、自主恢复时间相比于D组患者显著缩短;B、C两组患者术后躁动发生率相比于A、D两组显著降低;A和B组患者术后未出现呼吸抑制的情况。不同剂量的舒芬太尼对中老年胸科手术患者苏醒的影响也不相同,选择0.15μg/Kg更利于患者的术后苏醒,患者呼吸抑制情况发生较少,效果较好。

雷公藤多甙联合福辛普利治疗小儿HSPN的疗效观察466-471

摘要:本研究的为探讨雷公藤多甙联合福辛普利治疗小儿过敏性紫癜性肾炎(Henoch-Schonlein purpura nephritis。HSPN)的临床疗效及相关机制。选取2013年1月~2015年1月收入我院的94例过敏性紫癜性肾炎患儿,根据随机数字表法分为对照组和观察组,各47例。两组患者均给予常规内科治疗,对照组患儿在此基础上给予福辛普利钠,观察组患儿在对照组的基础上给予雷公藤多甙片。比较两组患儿的临床资料。治疗后,比较两组患儿免疫球蛋白水平、PT、APPT、PLT、FIB水平的变化情况。观察组的总有效率显著高于对照组,且复发率显著低于对照组(p〈0.05)。观察组的收缩压、舒张压、24h尿蛋白量及腹痛、关节疼痛和水肿消失时间等临床症状的改善均显著优于对照组(p〈0.05)。治疗后,两组患者IgA水平均显著降低白〈0.05),且观察组较对照组降低更明显(p〈0.0S);对照组PT较治疗前无明显改变(p〉0.05),而观察组PT则显著升高(p〈0.05),组间比较差异显著(p〈0.05);两组患者PLT较治疗前均显著降低(p〈0.05),且观察组较对照组降低更明显,组间比较差异显著(p〈0.0S)。雷公藤多甙联合福辛普利对小儿HSPN临床疗效较好,可显著改善患者症状,其机制可能与降低IgA水平、抑制细胞免疫、升高PT、降低PLT计数,以及改善凝血功能相关。

三种脱敏药物封闭牙本质小管的扫描电镜观察472-476

摘要:观察3M Singlebond^TM Universal自酸蚀粘结剂堵塞牙本质小管的效果,为治疗牙本质过敏提供理论依据。收集新鲜的离体第三磨牙42颗,制备成牙本质敏感症模型后随机分为空白对照组(n=6)、3M Singlebond^TM Universal组(n=121、极固宁组(n=12)、高露洁专效抗敏牙膏组(n=12)。从涂布脱敏剂的3组中各随机抽取6个样本进行刷牙实验。分析所有分组牙本质小管的堵塞效果,并采用SPSS17.0数据分析系统对结果进行分析。从结果可以看出空白对照组牙本质小管完全开放,3M Singlebond^TM Universal、极固宁、高露洁抗敏牙膏均能有效封闭牙本质小管,3M Singlebond^TM Universal的封闭效果最佳。经过刷牙实验3M Singlebond^TM Universal仍具有较好的牙本质小管封闭效果,而脱敏牙膏组有大量牙本质小管再次开放。这说明3种脱敏剂都具有良好的牙本质小管封闭效果,3M Singlebond^TM Universal的封闭性和抗磨耗性最佳。

盐酸右美托咪定及丙泊酚用于乳腺癌根治术中的镇静作用比较477-481

摘要:比较盐酸右美托咪定及丙泊酚用于全凭静脉麻醉乳腺癌根治术患者术中镇静作用及对围术期炎症因子的影响。选择择期行乳腺癌根治术患者60名,用随机数字表法分为两组:盐酸右美托咪定组(C组)和丙泊酚组(E组)(n=30),两组均采用全凭静脉麻醉(TIVA)。其中C组在麻醉中采用盐酸右美托咪啶静脉维持;E组在麻醉中采用丙泊酚静脉维持。记录患者术中镇静程度BIS监测评分、术中知晓率、术后呼吸抑制发生率(术后SPO2〈94%)、恶心呕吐发生率、寒战不适发生率和术后镇痛的满意率,分别比较麻醉诱导前10min(T1)、术后30minfT2)2时间点外周血中TNF-α、IL-6、CRP的变化情况。两组患者术中镇静程度BIS监测评分及术中知晓率无显著差异(p〉0.05),C组术后呼吸抑制发生率明显小于E组(p〈0.01),且恶心呕吐及寒战不适的发生率也显著低于E组患者(p〈0.05);同时,与E组相比,C组的术后镇痛满意率显著提高(p〈0.05)。两组患者T1时刻的TNF-α、CRP、IL-6水平比较,差异无统计学意义(p〉0.05)。组间比较,C组T2时刻TNF-α、CRP、IL-6水平低于E组,差异有统计学意义(p〈0.05)。盐酸右美托咪定较丙泊酚更适用于全凭静脉麻醉乳腺癌根治术的镇静,且有利于降低围术期应激反应,提高患者舒适度。

短暂禁食减轻四氯化碳诱导的小鼠急性肝炎482-487

摘要:短暂禁食可引起包括糖皮质激素释放在内的一系列神经内分泌改变,对于疾病防治具有独特而重要的意义。本研究观察了短暂禁食对四氯化碳(carbon tetrachloride,CCl4)诱导的急性肝炎小鼠肝组织损伤程度及炎症反应水平的影响及其与糖皮质激素之间的可能关联。结果发现,短暂禁食可明显下调CCl。处理小鼠血浆中天冬氨酸转氨酶(aspartate transaminase,AST)及丙氨酸转氨酶(alanine transaminase,ALT)水平,显著减轻肝组织病理学改变,对肝组织内还原型谷胱甘肽(glutathione,GSH)含量无明显影响但可显著降低血浆中肿瘤坏死因子仪(tumor necrosis factor-α,TNF-α)及白介素-6(imerleukin-6,IL-6)浓度。糖皮质激素受体拮抗剂米非司酮不能阻断短暂禁食对转氨酶水平的下调作用,糖皮质激素受体激活剂地塞米松也不能模拟短暂禁食对转氨酶水平的下调作用。以上结果提示:短暂禁食可通过不依赖于糖皮质激素的途径抑制炎症反应、从而减轻CCl4诱导的急性肝炎。

Legume Genomics and Genetics (LGG)487-487

中青年高尿酸血症与中医体质类型相关性研究488-493

摘要:为了研究中青年高尿酸血症患者中的中医体质分布情况并探讨其相关性,本研究将2014年6月~2016年6月在我院体检确诊的766例中青年高尿酸血症患者为治疗对象,根据《中医体质量表》制作调查问卷以判定患者的中医体质分型及其分布情况,采用描述性分析和统计学分析来判断患者的中医体质分布规律。结果表明中青年高尿酸血症患者的中医偏颇体质分布最多,其中湿热质患者有214例f27.94%)、痰湿质患者有142例(18.54%)和兼夹体质患者有91例(11.88%),而兼夹体质分型包括痰湿兼血瘀质患者24例(3.13%)、气虚兼痰湿质患者13例(1.70%)、气虚兼湿热质患者11例(1.44%)、湿热兼气郁质患者8例(1.04%);男性患者中有湿热质有208人(35.19%),痰湿质有130人(22.00%),兼夹体质有55人(9.31%),女性患者中有湿热质6人(3.43%),痰湿质有12人(6。86%),兼夹体质有36人(20.57%),男性患者的中医体质数据显著大于女性患者的相应数据(p〈0.01)。结论:中医偏颇体质以湿热质和痰湿质与中青年高尿酸血症相关性最高,且男性比女性发病率更高,应加强对这些人群的疾病防治工作。

骨质疏松症患者治疗中的健康宣教研究494-498

摘要:选择我院2015年1月至2015年12月间收治的80例骨质疏松症患者,按照随机数字法将患者分成两组,即观察组(n=40)及对照组(n=40)。对照组患者接受常规护理,观察组患者接受常规护理联合健康宣教,观察两组患者的服药方法掌握率、生活方式影响、饮食影响和不良反应例数以及骨密度变化。与对照组患者相比,观察组患者治疗后的评分更高,对比分析后,差异有统计学意义(t=6.283,p〈0.05)。观察组患者的骨密度恢复情况更好,有效率更高,为90.0%,对比分析后,差异有统计学意义(X^2=7.349,P〈0.05)。观察组患者的服药方法掌握、生活方式影响、饮食影响和不良反应分别为16例(40.0%)、37例(92.5%)、36例(90.0%)和1例(2.5%),对比分析后,差异有统计学意义(X^2=9.342,7.793,8.084,9.228,p〈0.05)。健康宣教有利于骨质疏松症患者的康复,可以帮助患者保持良好的生活和饮食习惯,有效降低并发症的发生,提高了患者的治疗效果,保证了患者的生活水平。

自体cage融合在治疗退行性腰椎疾病中的应用499-503

摘要:本研究将72例腰椎退行性变患者根据随机数字表分为两组,其中,对照组予以PEEK cage融合治疗,观察组予以自体cage融合治疗。对比两组干预后的腰椎前凸角度,椎间盘高度,VAS评分,术后功能之后,发现两组治疗后的VAS评分较治疗前降低,且两组间无显著差异(p〉0.05);两组优良率无显著差异(p〉0.05);治疗后的椎间隙高度、L3/4腰椎前突角、L4/5腰椎前突角、L5/SI腰椎前突角较治疗前增大(p〈0.05),且两组间无显著差异(p〉0.05)。提示在腰椎后路融合术中行棘突骨块所制的自体cage与PEEK cage有着同等的安全性和有效性,是一种良好的椎间融合方式。

持续灌注和静态保存对中性粒细胞凋亡的影响504-510

摘要:为研究体外循环机持续灌注、间断压力灌注、单纯低温保存犬离体肺对支气管肺泡灌洗液中中性粒细胞凋亡变化以及对肺泡巨噬细胞吞噬凋亡中性粒细胞的影响,探索最佳的离体肺保存方式,将30只Mongrel犬随机分成3组,为体外循环组、压力灌注组和低温保存组,每组10只。在保持机械通气的条件下,完整摘取双肺,3种不同方式保存离体肺,并按时间点留取支气管肺泡灌洗液标本。流式细胞仪检测犬离体肺支气管肺泡灌洗液中中性粒细胞凋亡,免疫组织化学法检测犬离体肺肺泡巨噬细胞对凋亡中性粒细胞吞噬。随着犬肺离体时间的推移,各实验组离体肺支气管肺泡灌洗液中凋亡的中性粒细胞明显减少,在每个时间点上,体外循环组中性粒细胞的凋亡最多,压力灌注组中次之,低温保存组中最少。各实验组吞噬凋亡中性粒细胞的巨噬细胞随着离体时间的延长呈逐渐减少的趋势,在肺离体各时间点上,体外循环组中巨噬细胞对凋亡中性粒细胞的吞噬清除优于间断压力灌注组和单纯低温保存组。采用体外循环机持续灌注犬离体肺,能增加中性粒细胞凋亡,促使吞噬细胞吞噬凋亡的中性粒细胞,避免发生凋亡延迟,从而减轻离体肺组织的缺血再灌注损伤,具有较好的肺保护作用。