基因组学与应用生物学杂志 北大期刊 CSCD期刊 统计源期刊

基因组学与应用生物学 2016年第10期杂志 文档列表

基因组学与应用生物学杂志分子医学与临床应用

Smad1在结直肠癌中的突变及功能分析2525-2532

摘要：DNA损伤是肿瘤发生的基础,细胞内应答DNA损伤的分子信号通路是阻挡癌症发生的屏障。近年来发现Smad1在DNA损伤应答的分子信号通路中具有重要的作用。本实验旨在探究结直肠癌患者组织中Smad1的序列突变及其生物学意义。本实验提取结直肠癌患者肿瘤组织和正常组织的总RNA并逆转录成c DNA,分段扩增Smad1基因并进行克隆和双向测序,测序结果进行比对,发现Smad1的MH1区域与MH2区域的错义突变较少,6个主要的错义突变均集中在Linker区域,其氨基酸残基改变分别是：N147H、P167S、T202A、M218I、M247V和A248V,其中Thr202是已知的GSK3作用位点;正常组织及肿瘤组织中的突变情况不同,T202A和M218I分别是仅存在于正常组织和肿瘤组织中的突变,提示Smad1 Linker区域的突变可能影响其生物学功能。并利用RNAfold和SOPMA在线服务器分别预测发现错义突变对Smad1的RNA二级结构和蛋白质二级结构造成不同程度的影响。

Legume Genomics and Genetics（LGG）2532-2532

Exo70二聚化的关键序列及其在乳腺癌细胞迁移过程中的作用2533-2538

摘要：Exo70是胞外分泌复合体Exocyst的关键亚基,可通过参与Exocyst复合体或自身聚合促进细胞迁移。我们在研究中发现,Exo70自身形成二聚体的能力显著强于与Exocyst其它7个亚基的结合,提示Exo70二聚化的重要作用。进一步构建Exo70缺失突变体,并通过一系列免疫共沉淀实验确定了Exo70形成二聚体的关键位置是位于氨基酸31~35与505~509的两段同样的序列SLEKS。进而利用这两个序列的缺失突变体,通过transwell迁移实验,证实这两段SLEKS序列在Exo70二聚化及乳腺癌细胞迁移过程中的关键作用。以上结果为Exo70独立于Exocyst复合体功能之外的新功能研究提供了依据,也为乳腺癌及其转移的治疗提供潜在的靶点。

Molecular Entomology2538-2538

BMP9/PI3K/Akt信号通路抑制乳腺癌MDA-MB-231细胞生长2539-2544

摘要：探讨骨形态发生蛋白9是否可通过其它非经典BMPs/SMAD信号通路来抑制人乳腺癌癌细胞MDA-MB-231的生长。本研究采用免疫组化方法检测临床乳腺癌患者癌组织和癌旁组织中BMP9、Akt总蛋白和Akt磷酸化蛋白表达,采用Western blot检测过表达BMP9或靶向干扰BMP9后,对乳腺癌细胞中PI3K/Akt信号通路中Akt总蛋白和Akt磷酸化蛋白表达的影响,通过裸鼠异位移植瘤动物模型证实BMP9可抑制乳腺癌生长,及其对细胞增殖核抗原PCNA表达改变。结果显示,临床乳腺癌患者癌组织中BMP9表达明显低于癌旁组织,癌组织中存在BMP9表达,Akt磷酸化蛋白表达明显降低;BMP9腺病毒感染MDA-MB-231后,MDA-MB-231/BMP9组的Akt磷酸化蛋白表达明显低于MDA-MB-231/GFP,干扰掉MCF7中内源性BMP9后,MCF7/si BMP9组Akt磷酸化蛋白表达明显高于MVF7/si NC组;裸鼠移植瘤动物模型在成瘤后的第21天,MDA-MB-231/BMP9瘤体大小为（0.329±0.047）明显小于MDA-MB-231/GFP（3.102±0.027）,PCNA染色显示MDA-MB-231/BMP9的PCNA阳性率为（26.3±3.1）%,明显低于MDA-MB-231/GFP（57.8±5.3）%。由此得出结论,BMP9抑制乳腺癌MDA-MB-231细胞生长还可以通过抑制PI3K/Akt信号通路激活来发挥作用。

Molecular Entomology2544-2544

p53基因5／6外显子突变与广西肝癌高发区肝癌家族聚集性的相关性2545-2550

摘要：为了研究p53基因5／6外显子突变与广西肝癌高发地区肝癌家族聚集性的关系。研究采用配对方法，选取肝癌高发家族、肝癌单发家族和无癌家族中未发生肝癌的家族成员各130例作为研究对象，同时选取上述高发地区肝癌患者30例作为肝癌组对照。应用PCR．SSCP技术检测研究对象外周血细胞DNA中p53基因5／6外显子的突变情况并进行基因测序。研究发现三组家族成员中p＂基因5／6外显子的突变率为0％。肝癌组中p53基因5／6外显子的总突变率为10％（3／30）。肝癌组p53基因5／6外显子的总突变率与肝癌家族组间突变率比较，差异均具有统计学意义（p〈0．05）。综上，P53基因5／6外显子突变可能不是广西肝癌高发区肝癌家族聚集性的遗传易感因素，广西肝癌高发区肝癌家族成员中可能尚未发生口53基因5／6外显子突变或较为罕见，肝癌患者中出现的p53基因5／6外显子突变可能是在后天多因素的影响下发生，从而参与了肝癌的发生发展。

小窝蛋白-1对洛伐他汀联合塞来昔布治疗宫颈癌的分子影响2551-2554

摘要：探讨洛伐他汀联合塞来昔布作用于宫颈癌细胞SiHa的关键分子及对下游信号分子的影响。分别用不同浓度的洛伐他汀和塞来昔布孵育宫颈癌细胞Si Ha,根据CCK-8试剂盒检测24 h的细胞增殖结果,计算两药的IC_（50）。用IC_（50）浓度的洛伐他汀和塞来昔布作用于SiHa,qPCR检测小窝蛋白-1的mRNA水平变化以及Akt、ERK1/2和STAT3的磷酸化水平。SiHa细胞经洛伐他汀和塞来昔布处理24 h后,IC_（50）值分别为25μmol/L和50μmol/L;洛伐他汀或塞来昔布单独处理Si Ha细胞24 h,均可从蛋白水平抑制小窝蛋白-1的表达;并且洛伐他汀可协同塞来昔布降低小窝蛋白-1引起的Akt、ERK1/2和STAT3信号分子磷酸化。洛伐他汀和塞来昔布联合应用下调宫颈癌细胞小窝蛋白-1的表达,并且可以显著性抑制下游信号分子的激活。

Aptamer-siRNA核酸复合物对人慢性粒细胞白血病（CML）小鼠模型凋亡信号转导的影响2555-2560

摘要：SELEX技术筛选人慢性粒细胞白血病（CML）核酸适配子,合成aptamer-si RNA核酸复合物,观察aptamer-si RNA核酸复合物干预NOD/SCID小鼠慢性粒细胞白血病（CML）bcr-abl融合基因及P210、P53、TNF-α、bcl-xl相关因子表达水平。将K562细胞接种于全身照射后的裸鼠,待皮下成瘤后取出瘤块,制备成瘤细胞混悬液,再尾静脉接种于NOD/SCID小鼠,实验成功建立了全身播散型白血病模型,对实验小鼠行随机分组,以RT-PCR法检测aptamer-si RNA核酸复合物治疗小鼠体内bcr-abl融合基因表达水平,ELASA法检测小鼠P210、P53、TNF-α、bcl-xl表达水平。实验结果表明：Aptamer-si RNA核酸复合物可显著降低模型小鼠体内融合基因bcr-abl及融合蛋白P210表达水平,能提升P53表达,抑制TNF-α、bcl-xl过度表达,其抑制效果与aptamer-si RNA核酸复合物浓度有一定的相关性。aptamer-si RNA核酸复合物通过干预CMLbcr-abl融合基因及其表达的融合蛋白P210,影响细胞信号传导通路途径,有效阻断了CML传变的进展,揭示了aptamer-si RNA核酸复合物干预CML疾病的微观机理。

骨关节炎中的炎性因子与骨关节严重程度相关性分析2561-2566

摘要：本研究旨在探索骨关节炎患者体内炎性因子IL-4、s IL-4R、b FGF与病情程度的相关性。选取骨关节炎患者65例,根据ISOA评分对其进行严重程度分级后,对其血清及关节液中的IL-4、s IL-4R和b FGF进行检测,分析各指标与患者病情严重程度的相关性。结果发现,观察组血清和关节液中的s IL-4R、b FGF的含量均明显高于对照组,差异有统计学意义。而IL-4在不同组别及观察组不同严重程度患者血清及关节液中均无明显差异（p〉0.05）;在不同程度骨关节炎患者体内s IL-4R、b FGF与ISOA评分值存在线性相关关系,差异有统计学意义。由此可认为,患者血清及关节液中s IL-4R、b FGF两项指标含量与关节炎严重程度相关,应该引起临床医师的足够重视,并采取相应的治疗措施。

Journal of Mosquito Research（JMR）2566-2566

肌电生物反馈对脑梗死急性期心率变异性的影响2567-2571

摘要：为观察肌电生物反馈对脑梗死急性期心率变异性的影响。本研究选取脑梗死患者60例,随机分为对照组28例和实验组32例,两组均进行常规卒中康复治疗,实验组加做肌电生物反馈治疗。分别于入院一周内和治疗2周检测动态心电图。选取同年龄段、排除脑梗死等影响自主神经活性疾病的动态心电图检查的患者60例,做为正常组,收集其动态心电图数据。正常组与脑梗组比较,脑梗组SDNN、LF、HF值均明显低于正常组（p〈0.01）,LF/HF比值明显高于正常组（p〈0.05）;脑梗死患者中实验组与对照组比较,治疗前两组SDNN、LF、HF、LF/HF均无显著性差异（p〉0.05）;治疗后对照组中SDNN、LF、HF高于治疗前,但无显著性差异（p〉0.05）,LF/HF低于治疗前,但无显著性差异（p〉0.05）;实验组中SDNN、LF、HF明显高于治疗前（p〈0.01）,LF/HF明显低于治疗前（p〈0.05）。通过相关分析表明脑梗死患者心率变异指标存在异常。研究结果表明肌电生物反馈可以促进脑梗死急性期患者心率变异指标恢复。

一个常染色体显性遗传非综合征型耳聋家系致病基因及可能性分子遗传学机制研究2572-2580

摘要：对一个中国常染色体显性遗传非综合征型耳聋家系（HBXG-712家系）进行了考察，主要采用了微阵列芯片法、全外显子组测序（wholeexomesequencing，WES）技术以及Sanger测序法等方法检测该家系致病基因，另通过对蛋白产物进行三维重建进行生物信息学分析。经WES测序，本次研究共获得51个候选基因，通过将Sanger测序结果与标准序列进行比对及验证基因型与表型的一致性，确定EYA4为该家系致病基因，同时位于该基因上的错义突变c．T1301A（p．1434K）为其分子病因基础，且生物信息学分析认为该突变具有致病性。本研究结果提示：EYA4（c．T1301A；p．1434K）为HBXG-712家系耳聋的致病基因，提示发生于eya同源区域的错义突变可导致非综合征型耳聋的发生。

地塞米松对脑出血后脑水肿自由基及血清ICAM-1、MMP-9表达的影响2581-2585

摘要：观察糖皮质激素治疗脑出血后脑水中患者过程中血清MDA、MMP-9和ICAM-1水平的变化,探讨这种变化与糖皮质激素治疗脑出血后脑水肿的疗效关系。2010年1月至2015年12月入院的脑出血患者100例,按随机数字表法分为两组,分为常规治疗组50例和GC组50例。健康体检对照组50例。检测脑出血患者不同时间血清中的MDA、MMP-9和ICAM-1水平,通过CT检查计算同时间的脑水肿体积。TBA法检测MDA含量,酶联免疫吸附试验检测血清MMP-9和ICAM-1水平。入院24 h内,常规治疗组和GC组血清MDA含量,MMP-9和ICAM-1水平均高于健康对照组（p〈0.05）。24 h内常规治疗组与GC组比较,脑水肿体积、MDA、MMP-9和ICAM-1差异均无统计学意义。而治疗后7 d和14 d,GC组与常规治疗组比较,脑水种体积、MDA、MMP-9和ICAM-1均减少（p〈0.05）,GC组MMP-9和ICAM-1与脑水肿体积呈正相关（r=0.881,r=0.845,r=0.861,p〈0.05）。治疗后14 d,GC组MDA与脑水肿体积无相关性。糖皮质激素可能通过降低ICMA-1和MMP-9表达,消除自由基等机制减少脑出血后脑水肿程度。

International Journal of Super Species Research2585-2585

ICU脑外伤及脑血管病合并肺部感染的病原分布及耐药性分析2586-2591

摘要：探讨本院重症监护病房（ICU）中脑外伤、脑血管病合并肺部感染患者的病原菌分布及耐药情况。对本院2012年~2015年ICU中154例脑外伤、脑血管病合并肺部感染患者的痰液标本进行培养鉴定及药敏实验分析,了解本院ICU脑外伤、脑血管病合并肺部感染患者的病原菌分布及耐药菌群分布情况。本研究共计分离出570株病原菌,其中革兰阳性菌株220株（38.60%）、革兰阴性菌株284株（49.28%）、真菌66株（11.58%）;铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯菌及不动杆菌的耐药情况十分严重,对大多数抗生素均具有较高的耐药率,对美罗培南、亚胺培南的耐药率相对较低;表皮葡萄球菌、金黄色葡萄球菌的耐药情况十分严重,对大多数抗生素均具有较高的耐药率,对利奈唑胺、万古霉素及呋喃妥因的耐药率相对较低;白色念珠球菌、光滑念珠球菌对大多数抗真菌药物的耐药率均较低,对咪康唑的耐药率均较高。本院ICU肺部感染患者病原菌以革兰阳性菌为主,应根据病原菌药敏结果进行针对性治疗。

不同接触DNA检材提取纯化方法在法医学中的应用价值比较2592-2596

摘要：比较不同DNA检材的提纯方法,便于法医的实际应用选择。采集饮用过的饮料瓶或矿泉水瓶、废弃的烟蒂、使用过的手套口罩及衣物各90份,随机分为Chelex组、磁珠组和有机组,各组检材分别使用相应的方法进行DNA的提纯,对提纯后三组检材的DNA提取液的STR分型、DNA提取量与紫外线分光光度计下OD值水平进行比较。由磁珠法提纯得到的DNA超过9个基因座的例数最多;提取量与DNA提取纯度显著优于其他二组,差异具有统计学意义（p〈0.05）。对于微量接触或污染严重的检材,可使用DNA IQ磁珠法进行提纯,可优化DNA的提取纯度,利于法医工作的进行。

人GlnRSN端多肽的原核表达、纯化及其多抗的制备2597-2602

摘要：制备谷氨酰胺-t RNA合成酶（Gln RS）多克隆抗体,为下一步深入研究其结构与功能做准备。以Gln RS全长基因为模板,PCR获取编码Gln RS N端236个氨基酸的基因片段,将PCR产物插入p ET28a以构建N（1-236）-Gln RS的重组表达载体（p ET28a-N-Gln RS）,转化大肠杆菌BL21（DE3）进行诱导表达N-Gln RS重组蛋白,用镍柱对表达的蛋白进行纯化,将纯化的蛋白对BALB/c小鼠采取皮下注射制备多克隆抗体,离心取血清,最后对制备的抗体进行特异性检测。PCR获得了目的片段,成功构建表达载体,获得表达的Gln RS N端236个氨基酸重组蛋白,制备抗体具有很好的特异性,可用于Gln RS检测。以N-Gln RS重组蛋白为抗原制备的抗体对Gln RS具有很好的免疫特异性,为下一步在蛋白水平深入研究Gln RS的结构与功能提供了抗体准备。