基因组学与应用生物学杂志

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基因组学与应用生物学杂志 北大期刊 CSCD期刊 统计源期刊

Genomics and Applied Biology

  • 45-1369/Q 国内刊号
  • 1674-568X 国际刊号
  • 1.11 影响因子
  • 1-3个月下单 审稿周期
基因组学与应用生物学是广西大学主办的一本学术期刊,主要刊载该领域内的原创性研究论文、综述和评论等。杂志于1982年创刊,目前已被维普收录(中)、CA 化学文摘(美)等知名数据库收录,是广西大学主管的国家重点学术期刊之一。基因组学与应用生物学在学术界享有很高的声誉和影响力,该期刊发表的文章具有较高的学术水平和实践价值,为读者提供更多的实践案例和行业信息,得到了广大读者的广泛关注和引用。
栏目设置:综述与专论、研究论文、研究报告、实验技术。

基因组学与应用生物学 2016年第07期杂志 文档列表

基因组学与应用生物学杂志分子医学与临床应用_研究论文
基于人磷酸二酯酶4B2高通量筛选异香兰酸芳酰胺抑制剂1552-1557

摘要:磷酸二酯酶4B2(PDE4B2)选择性抑制剂是新型抗炎药物研究的热点。合成异香兰酸芳酰胺衍生物的猪磷酸二酯PDE4强效抑制剂,评价其对人PDE4B2的抑制活性,以明确可用于高通量筛选PDE4抑制剂的靶酶。以异香兰素为原料,经烷基化、氧化、酰胺化反应制得目标化合物;大肠杆菌原核重组表达人PDE4B2;偶联碱性磷酸酶的孔雀绿定磷法测定酶活性,96孔板高通量测定化合物的抑制常数。结果显示,结构确认的5个异香兰酸芳酰胺衍生物纯度超过88%,其对人PDE4B2的抑制常数明显高于对猪主动脉PDE4的抑制常数。不同来源PDE4对异香兰酸芳酰胺衍生物敏感性不同,拟用人PDE4B2为靶酶进行抑制剂高通量筛选。

基因组学与应用生物学杂志分子医学与临床应用_研究报告
Dalbinol抑制肝癌细胞SMMC-7721增殖及其分子机制1558-1562

摘要:肝细胞肝癌是恶性程度很高的肿瘤,其恶性增殖是临床治疗失败的原因之一。寻找能有效的抑制肝癌细胞增殖的药物,是肝癌治疗的一条重要途径。体外抗肿瘤活性筛选结果表明,天然产物Dalbinol能浓度依赖性的显著抑制肝癌细胞SMMC-7721增殖;初步的机制研究发现Dalbinol能够降低Dvl-2/3和GSK-3β(p S9)的表达水平,从而抑制Wnt/β-catenin通路的过度激活,下调β-catenin靶蛋白c-Myc和Survivin的表达。此外,Dalbinol也能抑制β-catenin的上游一个重要的调节蛋白Fox M1的表达。综上所述,本研究发现了Dalbinol在肝癌中的抗肿瘤效果,初步阐明了其抑制肝癌增殖的分子机制,可能为肝细胞肝癌的临床治疗提供更有效的候选药物和相关的理论基础。

bFGF调控成釉细胞中牙釉质基质蛋白的基因表达1563-1568

摘要:本研究旨在说明b FGF可以通过DLX1/DLX2调控成釉细胞中牙釉质基质蛋白的基因表达。首先利用免疫组织化学显示DLX1/DLX2在分泌期成釉细胞中的表达;分离培养成釉细胞,并通过RT-PCR检测Dlx1/Dlx2及牙釉质基质蛋白在成釉细胞中的表达;在成釉细胞中分别过表达Dlx1和Dlx2后,Real time PCR检测牙釉质基质蛋白表达的改变;最后以50 ng/m L的b FGF的刺激成釉细胞,研究b FGF对Dlx1/Dlx2表达的影响。结果显示DLX1在分泌期小鼠成釉细胞中表达信号呈强阳性,而DLX2较弱;成功分离培养成釉细胞后,RT-PCR证实了Dlx1/Dlx2与牙釉质基质蛋白基因的表达在时空上存在同步性。在成釉细胞中分别过表达Dlx1和Dlx2对Ambn、Amelx、Amtn和MMP20的表达均有不同程度的影响;进一步研究发现b FGF能够促进Dlx1和Dlx2的表达。本研究结果提示b FGF可以通过DLX1/DLX2调控成釉细胞中牙釉质基质蛋白的基因表达。

BMP9结合ALK2受体激活BMPs/SMAD抑制乳腺癌MDA-MB-231增殖侵袭和迁移1569-1576

摘要:为探讨骨形态发生蛋白9是通过结合受体ALK1还是ALK2来抑制人乳腺癌癌细胞MDA-MB-231的增殖、侵袭和迁移,本研究采用RT-PCR检测ALK1、ALK2在MDA-MB-231中内源性表达,同时用RT-PCR检测显性负性突变ALK2腺病毒和BMP9腺病毒共感染MDA-MB-231后,DNALK2表达。采用MTT、细胞划痕实验、Transwell侵袭实验检测DNALK2对BMP9作用下MDA-MB-231增殖、侵袭、迁移的影响。RT-PCR检测DNALK2和BMP9腺病毒共感染MDA-MB-231后CTGF m RNA表达,Western blot检测BMPs/SMAD信号通路中SMAD1/5/8总的蛋白和磷酸化蛋白以及CTGF表达。结果显示,MDA-MB-231只存在ALK2表达,DNALK2和BMP9腺病毒共感染MDA-MB-231后,DNALK2 m RNA表达明显升高;MDA-MB-231/GFP/DNALK2组吸光度值(0.392±0.044)较MDA-MB-231/BMP9/DNALK2组(0.433±0.045)吸光度值无明显改变(p>0.05);MDA-MB-231/GFP/DNALK2组划痕愈合率(67.3±8.6)%与MDA-MB-231/BMP9/DNALK2组划痕愈合率(59.9±6.4)%无明显改变(p>0.05),MDA-MB-231/GFP/DNALK2组穿膜细胞数为(21.7±3.4)个与MDA-MB-231/BMP9/DNALK2组穿膜细胞数为(17.4±5.4)个无明显改变(p>0.05)。Western blot显示:DNALK2能阻断BMP9上调磷酸化SMAD1/5/8和下调人结缔组织生长因子CTGF表达。由此得出结论,BMP9可通过结合ALK2受体激活BMPs/SMAD信号通路来抑制MDA-MB-231增殖、侵袭和迁移。

《分子植物育种》征订启事1576-

生理层流剪切力对树突状细胞免疫表型的影响1577-1583

FRD上皮组织特殊染色液筛查宫颈病变的应用研究1584-1588

蓝青抗病毒合剂对临床分离细菌体外抗菌、抗病毒作用研究1589-1596

摘要:为了探讨蓝青抗病毒合剂的体外抗菌和抗病毒作用,本研究采用连续倍比稀释法进行药物体外抑菌实验,测定几种常见细菌的最低杀菌浓度(MBC)和最低抑制浓度(MIC);采用MTT法,进行体外抗病毒实验,测定蓝青抗病毒合剂对病毒半数中毒浓度TC50、半数有效浓度EC50及最低有效抑菌浓度。结果表明,蓝青抗病毒合剂对实验室保存菌种金黄色葡萄球菌、甲型溶血性链球菌、大肠埃希菌的MIC分别为15.56 mg/m L、7.78 mg/m L、31.13 mg/m L;MBC分别为15.56 mg/m L、15.56 mg/m L、62.25 mg/m L。蓝青抗病毒合剂对Hela细胞的半数中毒浓度(TC50)为12.21 mg/m L;对MDCK细胞半数中毒浓度(TC50)6.25 mg/m L;对呼吸道合胞病毒的半数抑菌浓度(EC50)为3.74 mg/m L,在2.56 mg/m L以上的浓度时对流感病毒引起的细胞病变及血凝现象有明显抑制作用。从这里我们可以看出,蓝青抗病毒合剂具有一定的抗菌、抗病毒作用。

Legume Genomics and Genetics(LGG)1596-

调强放疗对比传统放疗在头颈癌的治疗中的疗效的meta分析1597-1603

Journal of Mosquito Research(JMR)1603-

妇科肿瘤患者血清中HE4及CA125联合检测的临床意义1604-1607

基因组学与应用生物学杂志分子医学与临床应用_研究论文
GenoType MTBDRplus在内蒙古地区耐多药结核菌检测中的应用评价1608-1613

摘要:从2001年WHO/IUATLD全球抗结核药物耐药监测之内蒙古耐药监测结核菌1 114株中,选取经比例法药敏结果得到的耐多药(MDR)结核菌188株,利用Geno Type MTBDRplus方法检测该批菌株的RIF、INH耐药情况及其耐药基因突变形式。最终得到MDR菌株103(54.79%)株,单耐RIF菌株52(27.66%)株,单耐INH菌株10(5.32%)株,全敏感菌株20株,TUB条带缺失1株,kat G质控带缺失2株。RIF耐药菌株检测的是rpo B基因区,该基因突变菌株有155株;rpo B S531L突变菌株为49.68%(77/155)。INH耐药菌株检测的是kat G基因区和inh A基因启动子区,共113株,其中kat G基因突变菌株占79.65%(90/113),主要是S3-15T1突变;inh A基因突变菌株占22.12%(25/113)。因此,Geno Type MTBDRplus可用于内蒙古地区MDR结核菌的快速检测。其中rpo BS531L突变形式在RIF耐药菌株中最常见;在INH耐药菌株中,kat G基因突变较inh A基因突变常见,S315T1突变是INH耐药菌中常见的突变形式。

基因组学与应用生物学杂志分子医学与临床应用_研究报告
耐三代头孢大肠埃希菌血流感染的流行病学调查和危险因素分析1614-1622

摘要:为了探究血流感染中耐三代头孢大肠埃希菌(third-generation-cephalosporin-resistant Escherichia coli,3GCREco)的分子流行病学特点及感染危险因素,最终为临床用药和感染防控提供理论依据,我们在重庆医科大学附属第一医院2013年1月至2015年12月期间,选取了120例耐三代头孢大肠埃希菌血流感染患者作为耐药组,等比例选取120例三代头孢敏感大肠埃希菌血流感染患者为敏感组。采用VITEK2检测药敏情况、聚合酶链反应(PCR)扩增耐药基因、脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行流行病学调查,统计相关病例资料进行危险因素分析。我们的研究结果发现耐药组120株菌株对多数头孢类抗生素表现耐药,对哌拉西林/他唑巴坦多表现敏感,对碳青霉烯类均敏感;耐药组中超广谱β类酰胺酶(ESBLs)基因占65.00%(78/120);Ⅰ类整合子基因占14.17%(17/120);氨基糖苷类基因和喹诺酮类基因检出率较低,分别占5.83%(7/120)和3.33%(4/120);PFGE结果显示菌株间不存在克隆相关性;危险因素分析结果显示尿路感染(OR=2.222;p=0.029)、感染前手术史(OR=3.063;p=0.014)、头孢类抗生素使用史(OR=2.301;p=0.036)是其独立危险因素。这些结果提示我们血流感染中耐三代头孢大肠埃希菌ESBLs基因检出率高,引起的血流感染多与头孢类抗生素使用史、尿路感染及手术史相关,为此,我们建议临床工作者合理使用抗生素,减少侵入性操作,同时加强医院感染监管工作,从而减少耐药菌的传播与流行。

痰嗜酸性粒细胞检测与AECOPD全身激素使用关系1623-1628

有回声型超声造影在诊断婴儿幽门肥厚性狭窄中的优势1629-1632

摘要:为研究并讨论有回声型超声造影剂在诊断婴儿幽门肥厚性狭窄中的优势。本研究随机抽取2014年4月至2015年12月在本院就诊的40例疑诊IHPS的呕吐患儿,入选患儿均行超声造影、普通超声及X线造影检查。与手术治疗、药物保守治疗后的确诊结果相比,超声造影、普通超声检查和X线造影对IHPS患儿的诊断符合率分别为97.50%、92.50%和92.50%,Youden指数分别为88.89%、82.44%和74.55%,Kappa值分别为0.925、0.805和0.776,超声造影检查对IHPS的诊断效果明显优于普通超声检查和X线造影检查。由此得出结论,超声造影显示的幽门管结构层次较普通超声更加清晰,可以为外科手术提供更准确的参数测量值,避免术中切开深度过大造成不必要的伤害;超声造影较X线无辐射,通过实践可以证实超声造影能够完全取代X线造影,可以作为诊断IHPS时普通超声检查的补充或者替代。

二甲双胍减轻对乙酰氨基酚诱导的中毒性肝炎1633-1637

摘要:二甲双胍(metformin,MET)除具降糖效应外,还可发挥抗氧化及抗炎等药理效应,本研究探讨了MET在对乙酰氨基酚(acetaminophen,APAP)诱导的中毒性肝炎中的潜在保护效应。由于MET的部分效应依赖于腺苷酸活化蛋白激酶(AMP activated protein kinase,AMPK),本研究也尝试采用AMPK抑制剂dorsomorphin阻断MET在APAP模型中的效应,采用AMPK激活剂A-769662模拟MET的效应。结果显示:MET处理可显著抑制APAP诱导的血浆中天冬氨酸转氨酶(aspartate transaminase,AST)与丙氨酸转氨酶(alanine transaminase,ALT)水平、丙二醛(malondialdehyde,MDA)含量、过氧化氢酶(catalase,CAT)活性、肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)与白介素-6(interleukin-6,IL-6)浓度的上升,明显减轻APAP导致的肝组织病理学异常。AMPK抑制剂共同处理不能阻断MET对APAP模型中ALT及AST水平上升的抑制效应,AMPK激活剂处理不能模拟MET对ALT及AST水平的抑制效应。本研究结果提示:MET可有效减轻APAP诱导的中毒性肝炎,这一效应不依赖于AMPK。

基因组学与应用生物学杂志分子医学与临床应用_评述与展望
乙肝相关性肝细胞肝癌代谢重编程机制探讨1638-1642

摘要:乙型肝炎病毒作为外源因素进入肝细胞,可影响细胞内信号传导,改变基因表达,调节代谢过程,导致细胞生长异常,与肝癌的发生有关。研究乙型肝炎病毒改变信号传导通路的机制,有利于了解乙肝代谢异常的机制及与肝癌发生的关系,为乙肝和肝癌的代谢治疗寻找方法。