基因组学与应用生物学杂志社
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基因组学与应用生物学杂志

《基因组学与应用生物学》杂志在全国影响力巨大,创刊于1982年,公开发行的月刊杂志。创刊以来,办刊质量和水平不断提高,主要栏目设置有:综述与专论、研究论文、研究报告、实验技术等。
  • 主管单位:广西大学
  • 主办单位:广西大学
  • 国际刊号:1674-568X
  • 国内刊号:45-1369/Q
  • 出版地方:广西
  • 邮发代号:48-213
  • 创刊时间:1982
  • 发行周期:月刊
  • 期刊开本:A4
  • 复合影响因子:1.11
  • 综合影响因子:0.741
相关期刊
服务介绍

基因组学与应用生物学 2015年第03期杂志 文档列表

胡杨Ring finger E3连接酶PeRH2提高烟草耐旱机制研究

摘要:近期研究表明泛素化在植物胁迫响应中扮演一个关键的角色。作为泛素-蛋白酶体系统(UPS)中的关键酶,泛素E3连接酶更是在细胞的新陈代谢中起着重要的作用。本文从胡杨中克隆了一个C端含有Ring finger结构域的蛋白(152个氨基酸)编码基因(Pe RH2),经过序列比对推断该基因编码产物为泛素E3连接酶,属于Ring finger家族中的Ring-H2构型。研究显示,甘露醇胡杨苗木在255 mmol/L甘露醇胁迫下,叶片Pe RH2表达量上调。拟南芥原生质体中瞬时表达融合质粒p Yellow0029-Pe RH2的研究表明,Pe RH2蛋白定位于细胞核。以农杆菌介导法将Pe RH2转入烟草,Sq RT-PCR结果显示,Pe RH2在转基因烟草中获得过表达。在255 mmol/L甘露醇处理下,转基因烟草幼苗耐受渗透胁迫的能力高于野生型和转空载体烟草。干旱处理后,转基因烟草的叶片保水力明显高于野生型和转空载体烟草,而叶片相对电导率、MDA的含量也要低于野生型和转空载体烟草。因此,过表达Pe RH2能够提高烟草的抗旱能力。
454-463

DRD4基因与人类认知能力的相关性研究

摘要:以某高校随机抽取的790余名汉族健康大学新生作为随机人群样本,采用PCR-SSCP结合DNA测序的方法探究位于多巴胺神经递质通路中的多巴胺D4受体基因(DRD4)上的共2个SNP,探索DRD4基因的正常功能多态与人认知能力的相关性。分析结果显示,DRD4基因上选取的两个SNP中,仅有rs936461与男性中央执行功能关联p值校正后仍然存在显著性(p=0.034)。说明DRD4基因可能与人的中央执行功能有关。
464-471

雄激素受体激动剂与拮抗剂高通量筛选细胞模型的构建

摘要:有效的雄激素受体(androgen receptor,AR)激动剂与拮抗剂,可上调或下调雄激素受体刺激反应,起到治疗相关疾病的作用。高通量细胞筛选模型的建立,可扩大AR激动剂与拮抗剂筛选范围,加快筛选速度。本研究通过构建人雄激素受体表达重组质粒pcDNA 3.1-h AR,并与受雄激素效应元件调控的报告基因质粒MMTV-LTR-Luc F-R共转染人胚胎肾细胞293T,构建基于双荧光素酶报告基因的AR激动剂与拮抗剂筛选高通量细胞模型。AR激动剂5α-双氢睾酮可诱导该细胞模型荧光素酶的产生,AR拮抗剂尼鲁他明可拮抗5α-DHT的刺激作用,糖皮质激素受体激动剂地塞米松对细胞模型荧光素酶的产生无作用。
472-475

重组肿瘤血管生成抑制因子CTF的构建和特征分析

摘要:为获得一种更高效的重组肿瘤血管生成抑制因子,利用重叠延伸PCR技术将来自钙网蛋白(calreticulin)和肿瘤抑素(tumstatin)的抗血管生成活性片段连接,构建融合基因CTF(calreticulin tumstatin fusion)并克隆至表达载体p ET-15b。运用生物信息学软件对其分子结构的生物学特征进行分析发现,CTF融合基因编码94个氨基酸,分子量为10.72 k D,理论等电点为7.68,利于基因工程表达;连接肽段部位呈中性且柔性良好,不影响两端活性区域原来的二级结构和融合蛋白保守结构域。研究结果表明,本研究构建的CTF能够保留钙网蛋白活性片段和肿瘤抑素活性片段各自空间结构,适合融合蛋白生物活性的发挥。
476-481

《分子植物育种》中文网络版

摘要:《分子植物育种》(中文网络版,ISSN 1923-8258)是一本基于同行评审、开放取阅以及在线即时发表的期刊。主要发表植物育种领域中关于转基因育种与分子标记辅助育种的新知识与先进技术的原始研究论文。本刊致力于为转基因育种与分子标记辅助育种服务,主要发表在植物育种领域中涉及的分子遗传育种理论、分子育种技术与方法、分子育种产品研发等方面的基础和应用研究。所有发表的研究论文都应是在植物育种领域中具有创新意义的最新研究,特别是转基因、分子遗传学、作物QTL分析、种质资源的遗传多样
481-481

健康人粪便提取液细胞毒性的动态监测

摘要:本研究旨在探究自由生活、饮食和作息规律的健康人粪便提取液对肠上皮细胞的细胞毒性的范围及稳定性。共招募10名健康青年志愿者(男性:女性=1:1,年龄23~34岁),22 d内采集6次新鲜粪便样品(第1天,第2天,第3天,第8天,第15天,第22天),以人结直肠腺癌HT-29细胞作为模型,采用MTT(噻唑蓝)法检测粪便提取液的细胞毒性。志愿者采样前记录"24小时膳食回顾",用于膳食营养素分析。研究发现,自由生活的健康人粪便提取液的细胞毒性存在较大差异,细胞存活率的范围在12.3%~103.2%。每位志愿者在一段时间内的粪便提取液细胞毒性并不稳定,个体内差异的变异系数范围为10.6~43.5。细胞毒性与食物中能量和碳水化合物的摄取存在弱正相关关系,但与p H值无关。5名男性粪便提取液的细胞毒性显著高于5名女性。本研究表明自由生活的健康人粪便提取液的细胞毒性有较大个体间和个体内的差异,该结果为后续深入理解不同健康和疾病个体粪便提取液的生物活性与宿主肠道健康的关系奠定了基础。
482-487

意大利蜜蜂雌激素相关受体基因全cDNA的克隆及分析

摘要:采用RT-PCR、Race等技术克隆了意大利蜜蜂(Apis mellifera)雌激素相关受体基因am ERR的全长cDNA,同时采用Protparam、Swiss Model和MEGA等软件对所对应蛋白质的理化性质、二级及三级结构、分子系统进化关系等进行了预测和分析。克隆得到的意大利蜜蜂雌激素相关受体基因am ERR cDNA全长1 779 bp,其中ORF 1 305 bp,5’-UTR 197 bp,3’-UTR 277 bp,编码的蛋白质由434个氨基酸组成;am ERR基因有8个外显子和7个内含子。该基因较为保守,am ERR与拟黑多刺蚁pv ERR的序列相似性达到89.9%;am ERR的配体结合区缺少H2,由H3、H4和H12形成LBP,与配体结合的关键位点分别是Y246、T284和C316。以上结果为深入研究昆虫ERR基因的功能奠定了理论基础。
488-494

环江香猪FSHβ、ESR及ZAR1基因多态性分析

摘要:环江香猪是广西著名的地方品种,本研究采用PCR-RFLP、HRM结合测序的方法分析了广西环江香猪繁殖状相关基因FSHβ、ESR和ZAR1基因的多态性。结果显示,首次成功克隆测序了环江香猪ZAR1基因的外显子3,与Gen Bank中的ZAR1基因(DQ231443,gi:83727928)外显子3序列100%同源。针对134头环江香猪检测样本中均未发现FSHβ和ESR基因的多态突变位点。对ZAR1基因的外显子3和部分内含子3测序后发现5个新突变SNP位点,未见有已报道的对猪产仔数产生显著影响的外显子3(C54T)突变。论文显示不同品种猪基因突变多态性亦呈现为不同的模式,研究结果对建立环江香猪基因标记辅助选择方法具有重要意义。
495-499

贵州地方山羊ADIPOQ基因外显子1和3多态性研究

摘要:为分析山羊ADIPOQ基因的多态性,筛选出对山羊繁殖性状有显著影响的SNPs位点,本研究以黔北麻羊和贵州黑山羊为试验对象,构建池DNA,采用PCR产物直接测序法对2个品种山羊该基因的外显子1和3进行单核苷酸多态性检测,估算各SNPs等位基因频率,并利用在线软件预测不同基因型的m RNA二级结构。结果显示,4对引物扩增片段均存在多态性,共发现5个单碱基突变,分别位于内含子1中的C109G,外显子3中的A730G、G1055A、A1691T和A2244G。利用生物信息学软件对外显子3中的A1691T、A2244G进行分析,结果表明2个SNPs位点均导致编码的m RNA二级结构发生改变。表明ADIPOQ基因在黔北麻羊和贵州黑山羊群体中存在较高的遗传多样性,ADIPOQ位点有望丰富两个山羊品种繁殖性状的研究内容。
500-505

《基因组学与应用生物学》征订启事

摘要:《基因组学与应用生物学》是由广西大学主管和主办,公开发行的双月刊科学期刊。《基因组学与应用生物学》主要刊登现代生物技术的前沿学科和基础学科如基因组学、分子细胞遗传学、生化与分子生物学和应用生物学等相关的原始研究成果。刊登植物、动物及微生物领域的生物在组织、器官、细胞、染色体、蛋白质、基因、酶和发酵工程等不同水平上的现代生物技术等基础与应用基础研究的成果。本刊按国际标准编排,题目摘要、图表和引用文献等均实行中英文对照。
505-505

叶酸对猪卵母细胞体外成熟后微管和微丝分布的影响

摘要:本试验探讨叶酸对猪卵母细胞体外成熟的影响,为提高其体外成熟效率提供参考。将体外收集的猪卵母细胞随机分成对照组和试验组(0 ng/m L,1 ng/m L,50 ng/m L),研究添加叶酸对猪卵母细胞体外成熟后纺锤体微管、染色体和微丝分布的影响。结果表明:10 ng/m L叶酸能有效的提高纺锤体微管、染色体和微丝正常分布率,与对照组相比具有上升趋势。当叶酸浓度为50 ng/m L时,纺锤体微管、染色体和微丝正常分布率呈下降趋势,其中微丝正常分布率显著低于10 ng/m L处理组(p<0.05)。综上所述,叶酸能提高猪卵母细胞体外成熟后纺锤体微管、染色体和微丝正常分布率,在本研究中以添加10 ng/m L叶酸效果最明显。
506-511

《分子植物育种》征稿启事

摘要:《分子植物育种》是由国家科技部批准,国家新闻出版署核准的刊物。本刊"立足国内,面向国际",是一份为转基因育种、分子标记辅助育种及常规育种服务的国际化科学杂志。围绕水稻、小麦、玉米、油菜、大豆、棉麻、薯类、果树、蔬菜、花卉、茶叶、林草等,刊登分子遗传育种理论、分子育种方法、分子育种研究动态以及优良种质培育等方面的科学论文应用成果。从2003年创刊以来,已被美国化学文摘(CA),英国《国际农业
511-511

甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E nifD基因的克隆、原核表达及纯化

摘要:基于NCBI数据库中固氮菌nif D基因的核苷酸序列,设计并合成特异性引物,以甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E为模板,通过PCR方法获得了Klebsiella variicola DX120E nif D基因的ORF;以p ET30a(+)为原核表达载体,构建重组表达质粒p ET30a-nif D。将正确的重组质粒转入原核表达菌株BL21(DE3),在28℃培养条件下经1 mmol/L的异丙基硫代半乳糖苷(isopro-ply-β-D-thiogalactopyranoside,IPTG)诱导表达;通过SDS-PAGE电泳检测融合蛋白表达情况。结果表明,本研究克隆得到甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E nif D基因的ORF为1 452 bp,编码483个氨基酸;原核诱导表达后经提纯和质谱鉴定,该蛋白等电点为5.90,分子量为53.87 k D,与预期大小一致。该蛋白在原核表达系统中以包涵体的形式成功表达。利用Ni柱亲和层析方法进一步获得了纯度较高的重组蛋白,为今后单克隆抗体的制备、蛋白质印记杂交检测(Western Bloting)等研究奠定了基础。
512-520

大肠杆菌gdhA基因的密码子偏好性分析及优化

摘要:本研究对10种生物的谷氨酸脱氢酶gdh A基因分别进行了针对单独生物的密码子使用偏好性的分析并进行了比较。分析结果表明:在10种生物中,gdh A基因在编码时对密码子的使用存在较大不同,水稻、痢疾杆菌、柠檬酸杆菌、大肠杆菌的有效密码子数(effective number of codons,ENc)值均在40左右,说明水稻、痢疾杆菌、柠檬酸杆菌、大肠杆菌的密码子使用偏好性较强;其余6种生物的ENc值均在50左右,差异并不大,说明其余6种生物的密码子偏好性要相对弱些。水稻、痢疾杆菌、柠檬酸杆菌、沙门氏菌、地衣芽孢杆菌和大肠杆菌这6种生物的gdh A基因在编码时偏好使用G或C结尾的密码子;玉米、大豆、蓖麻及拟南芥这4种生物的gdh A基因在编码时偏好使用A或T结尾的密码子。在10种生物中,密码子CUA、UAG的RSCU(relative synonymous codon usage)值均小于1,属于使用频率较低的密码子;其余各种密码子在不同生物中均表现出不同的偏好性。在聚类分析中,10种生物基于gdh A基因密码子用法与基于CDS序列的聚类结果大体一致。根据密码子分析的结果,对gdh A基因进行密码子优化,以期提高在大豆中的表达水平。
521-529

《基因组学与应用生物学》征稿启事

摘要:《基因组学与应用生物学》(ISSN1674-568X,CN45-1369/Q)是由广西大学主管和主办,公开发行的双月科学期刊,创刊于1982年,由北京大学教授朱玉贤院士任主编,广西大学教授陈保善博士和海南省热带农业资源研究所所长方宣钧博士任执行主编。《基因组学与应用生物学》原名为《广西农业生物科学》,已入编《中文核心期刊要目总览》2011年版(即
529-529

假定蛋白基因XC2038与十字花科黑腐病菌致病相关

摘要:十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pv.campestris,Xcc)是研究植物病原细菌和寄主互作的模式细菌,鉴定其致病相关基因对于控制作物病害有重要的意义。XC2038在Xcc 8004中注释为功能未知的假定蛋白基因。本研究利用实验室前期构建的XC2038基因的Tn5gus A5插入突变体164H09,并构建了该突变体的互补菌株C164H09,随后对各菌株的致病性及相关表型进行了检测。结果表明,164H09影响Xcc 8004胞外多糖、泳动性及生物被膜的形成,影响在寄主满身红萝卜上的致病性,而突变体的互补菌株能将以上表型恢复至野生型水平。综上可知,假定蛋白基因XC2038与十字花科黑腐病菌致病相关。
530-534

Molecular Plant Breeding(MPB)

摘要:Molecular Plant Breeding(online,ISSN 1923-8266)is an open access and peer reviewed journal.It publishes original research papers involving in the transgenic breeding and marker assisted breeding in plants,particular in the areas of transgene,molecular genetics,crop QTL analysis,germplasm genetic diversity,and advanced breeding technolo-
534-534

永兴岛土壤芽胞杆菌多样性与抗线虫活性分析

摘要:从永兴岛的土壤中分离到187株芽胞杆菌,利用16S r DNA序列分析与RFLP技术对芽胞杆菌进行多样性分析,并初步探索了其抗南方根结线虫的活性。16S r DNA PCR-RFLP酶切图谱和代表菌株系统发育分析表明,永兴岛土壤中分离的187株芽胞杆菌分属于16个遗传类群,这些芽胞杆菌主要分布在Bacillus、Lysinibacillus、Paenibacillus、Brevibacillus和Sporosarcina 5个属。抗线虫的筛选结果显示,有5株芽胞杆菌表现出很好的抗线虫活性,其中活性最高的DB14381,可能是Lysinibacillus属的新资源。本研究揭示了永兴岛土壤蕴含丰富的芽胞杆菌物种多样性及潜在的新分类单元,并且存在拮抗南方根结线虫的芽胞杆菌资源。
535-540