基因组学与应用生物学杂志

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基因组学与应用生物学杂志 北大期刊 CSCD期刊 统计源期刊

Genomics and Applied Biology

  • 45-1369/Q 国内刊号
  • 1674-568X 国际刊号
  • 1.11 影响因子
  • 1-3个月下单 审稿周期
基因组学与应用生物学是广西大学主办的一本学术期刊,主要刊载该领域内的原创性研究论文、综述和评论等。杂志于1982年创刊,目前已被维普收录(中)、CA 化学文摘(美)等知名数据库收录,是广西大学主管的国家重点学术期刊之一。基因组学与应用生物学在学术界享有很高的声誉和影响力,该期刊发表的文章具有较高的学术水平和实践价值,为读者提供更多的实践案例和行业信息,得到了广大读者的广泛关注和引用。
栏目设置:综述与专论、研究论文、研究报告、实验技术。

基因组学与应用生物学 2009年第05期杂志 文档列表

基因组学与应用生物学杂志特邀评述
低毒病毒及板栗疫病菌低毒力机制835-844

摘要:低毒病毒是一类存在于板栗疫病菌细胞质中自主复制的无衣壳正链RNA病毒。感染低毒病毒后,板栗疫病菌的致病力显著降低,色素分泌减少,菌丝体由感染病毒前的桔黄色变为白色,产孢量降低或不产孢,漆酶表达水平明显下降。低毒病毒侵染性克隆的获得以及高效转化和转染体系的建立,使得低毒病毒成为目前唯一可以进行全面遗传操作的真菌病毒。利用低毒病毒作为探针来探测板栗疫病菌的致病力组成和毒力调节机制,己获得了一些很有意义的发现。本文介绍近几年低毒病毒及其与真菌相互作用的研究进展,包括低毒病毒的基因组和功能基因研究、低毒病毒和线粒体损害引起的板栗疫病菌低毒力机制、板栗疫病菌的RNA沉默系统以及低毒病毒抗RNA沉默的机制。低毒病毒/板栗疫病菌系统已经成为研究病毒与宿主相互作用以及病原真菌致病机理的很好的模式系统。

基因组学与应用生物学杂志研究报告
枯草芽孢杆菌群β-甘露聚糖酶基因克隆及同源性分析845-850

摘要:本文对33株枯草芽孢杆菌群菌株进行β-甘露聚糖酶活性筛选,其中的32株具有β-甘露聚糖酶活性,只有1株无β-甘露聚糖酶活性。通过基因克隆测序的方法获得33株枯草芽孢杆菌群菌株β-甘露聚糖酶基因编码区全序列,对酶基因进行同源性分析并构建系统发育树;在β-甘露聚糖酶基因系统发育树中,33株枯草芽孢杆菌群菌株聚为3个分支,分别是枯草芽孢杆菌分支、地衣芽孢杆菌分支和解淀粉芽孢杆菌分支;枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌和解淀粉芽孢杆菌β-甘露聚糖酶基因种内同源性大于91%,而种间同源性为60%~69%。

芒果AP1同源基因的克隆及其生物信息学分析851-858

摘要:我们采用RT-PCR方法克隆了2个A州同源基因全长cDNA,分别命名为MAPl—1(GenBankac—cession No.FJ529206)和MAPl—2(GenBankaccession No.FJ529207)。MAPl—1编码247个氨基酸,开放阅读框长度为741bp,蛋白质分子量为28.54kD,等电点为8.31;MAPl—2编码248个氨基酸,开放阅读框长度为744bp,蛋白质分子量为28.78kD,等电点为8.70。同源性分析表明,它们的核苷酸序列与其它木本植物A纠同源基因的一致性为72%~81%。实验分析表明,MAPl—1和MAPl—2第1至第61个氨基酸含有一个MADS盒结构域,第88至第178个为K盒结构域;两个基因均定位于细胞核,且功能位点分布存在着不同,推测这两个基因在花器官发育过程中的功能存在差异。蛋白二级结构预测显示,MAPl—1蛋白有12个α-螺旋,4个8折叠区,14个β-转角;而MAP1—2蛋白有11个α-螺旋,5个B折叠区,15个β-转角;其大多数氨基酸具有亲水性。本研究有助于进一步了解芒果的开花分子机理及成花的生物学发育阶段。

PCR-RFLP分析桉树人工林土壤微生物的群落结构859-864

摘要:本研究利用限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)和16SrDNA序列分析相结合的方法研究了广西南宁高峰林场人工桉树林中土壤微生物的群落结构。通过采用直接法提取桉树人工林土壤中微生物总DNA,构建细菌的l6SrDNA克隆文库,从中随机挑取了192个阳性克隆进行检测,分析显示188个阳性克隆子确定含有16SrDNA并分归为52个不同的类群OTUs,随机挑取其中35个克隆进行测序,并构建了系统发育进化树。研究结果表明:桉树人工林土壤中细菌种类较为丰富,含有大量的未培养微生物,进一步的序列分析表明桉树人工林土壤中占优势的类群分别为A cidobacteria(40%)和Proteobacteria(27%)。本研究对桉树人工林土壤微生物群落结构进行了研究,为进一步研究桉树人工林环境质量变化提供基础资料。

鸡端粒酶RNA基因的克隆865-868

摘要:本研究采用扩增条件优化的PCR扩增技术,以MDCC-MSB1细胞基因组DNA为模板扩增出鸡端粒酶RNA(chicken telomerase RNA,chTR)全长基因,克隆到pMD18-T载体中,经酶切鉴定和PCR鉴定后测定序列。序列分析表明所克隆的鸡端粒酶RNA基因全长465bp,其中模板区的11个核苷(5'-CUAACC-CUAAU-3')合成端粒亚单位(TTAGGG)n。chTR基因的克隆为进一步研究chTR在马立克氏病发病过程中的作用以及马立克氏病的发病机制提供可能的序列基础。

银杏EST序列中微卫星的分布特征869-873

摘要:本文利用从NCBI下载的21590条银杏EST序列,分析了银杏(表达序列标签微卫星)EST-SSR在银杏EST序列的分布和比较了在不同长度EST序列中的SSR特性。在剔除冗余和低质量序列后,得到总长为5708.385kb的无冗余EST序列7961条,发现了405个EST序列(5.09%)含有475个SSR,长度400~1000bp的EST序列含SSR位点数为445个,占SSR总数的93.68%。二核苷酸和三核苷酸基元类型是银杏EST-SSR的主要类型,分别占SSR总数的73.89%和24.00%,最常见的SSR基元是:(AT)n、(AG)n、(AC)n、(AAG)n和(AAT)n。通过对银杏EST序列中SSR位点信息的发掘分析,为有针对性地设计EST-SSR引物,开发银杏EST-SSR分子标记奠定基础。

智能搜索引擎PosMed和PosMed-plus使科研人员更易识别克隆候选基因873-873

摘要:许多疾病的发生都是由遗传突变所致。研究人员可以通过一种称为连锁分析的技术,来确定染色体上突变发生的大致区间,但是这些区间通常包含几十或数百个基因。对研究人员来说,如何不用耗费大量人力对每个基因逐一进行检测,只需获取尽可能多的有关该疑难病症的知识,缩小最可能的候选基因的选择范围很有必要。

英国莱斯特大学科学家首次在欧洲使用昆虫防治入侵植物882-882

摘要:日本虎杖(Japanese Knotweed),是一种原产于日本的蓼科杂草,该物种19世纪50年代被作为观赏植物引入英国,之后蔓延成灾,不仅影响了英国本土植物的繁殖,也严重影响了本土野生动物的生存。现今英国每年需投入15亿元用于控制该杂草的蔓延。英国莱斯特大学的生物学家已确定在英国繁衍成灾的日本虎杖是世界上最大的雌性群体。

Ⅰ型磷酸酶抑制亚基-1对人宫颈癌HeLa细胞增殖的抑制作用883-888

摘要:PPI1(Inhibitor-1of protein phosphatase 1)是Ⅰ型磷酸酶的抑制亚基之一,其活化依赖于35位苏氨酸蛋白激酶(PKA)的磷酸化而发挥抑制作用。本研究目的在于探讨PPI1持续活化型突变体的表达对人宫颈癌细胞株增殖的影响及其可能的作用机制。利用PPI1野生型和活化型突变体表达质粒分别转染HeLa细胞,首先通过H3TdR掺入实验、迁移实验观察PPI1基因对HeLa细胞增殖能力的影响,研究结果表明:在活化型突变体表达的HeLa细胞株中,细胞3H掺入量和迁移能力明显受抑。其次通过流式细胞术、Giemsa染色法分析PPI1对HeLa细胞的细胞周期的影响;FACS分析表明HeLa细胞G2/M期比例明显升高;经脱氧胸苷同步化后,该组细胞进入有丝分裂期明显滞后。最后利用Western blot分析PPI1对MAPK信号转导通路的影响,Western blot分析显示该组细胞的ERK磷酸化水平明显下降。研究表明PPI1活化型突变体的表达可抑制人宫颈癌细胞株的增殖,这与其诱导HeLa细胞G2/M期停滞、有丝分裂的进入延缓有关,其中涉及到MAPK信号转导通路的活化受抑制。

孟山都和华中农业大学合作发展植物生物技术888-888

摘要:圣.圣路易斯、北京(新华社)/10月20日/-孟山度公司和华中农业大学已达成合作意向研发作物新性状,诸如高量,抗旱和氮高效利用。孟山都公司将对华中农业大学张启发教授科研团队开发的某些技术进行相应的评估和改进。

华东竹黄菌不同居群遗传分化的RAPD分析889-895

摘要:为了解竹黄地理居群间的遗传分化,本研究采用随机引物扩增多态性DNA分子标记技术对江苏、安徽和浙江3省的8个居群共32个竹黄样本进行了遗传多样性分析。从50个RAPD引物中筛选得到了5个随机引物,对供试材料的DNA进行扩增,共检测出77个位点,其中多态性位点52个,多态性位点比率为67.53%。UPGMA聚类分析结果表明,这8个居群分为三类:安吉居群、临安居群、宜兴居群、广德居群和泾县居群聚为一类;宁国居群和休宁居群聚为一类;淳安居群单独为一类。遗传多样性分析表明8个竹黄居群中,淳安居群的遗传多样性水平最高,安吉居群的遗传多样性水平最低。Nei's基因多样性指数和Shannon信息指数均表明竹黄物种水平的遗传多样性高于居群水平。

草鱼MYH mRNA表达量分析中采用的内参基因稳定性比较896-900

摘要:本研究分别以β-actin、18SrRNA和GAPDH为内参基因,采用实时荧光定量PCR对草鱼早期发育时期肌球蛋白重链(myosin heavy light,MYH)基因的mRNA表达量进行分析,并比较不同内参基因对MYH基因mRNA表达水平检测结果的准确性。研究结果表明,以β-actin和GAPDH作为内参,MYH基因mRNA表达水平完全一致,其表达量从原肠到仔鱼阶段逐次递增,仔鱼与原肠期阶段相比表达量差异显著;当采用18S rRNA作为内参时,MYH基因mRNA在发育阶段的表达量呈不稳定状态。因此,β-actin和GAPDH均可作为内参基因,用于草鱼早期发育中MYH基因mRNA的相对定量研究;而18S rRNA作为内参时,可能会对检测结果造成偏差。本研究不仅准确的揭示了草鱼MYH基因mRNA的表达特征,并且为荧光定量PCR技术在鱼类基因表达研究方面提供了有价值的参考。

磷脂酶Dβ在拟南芥低温信号中的转导作用901-907

摘要:磷脂酶D(PLD)不仅是植物中一类主要的磷脂水解酶,而且是一类重要的跨膜信号转导酶类。PLD的磷脂降解功能和信号转导功能均影响植物的抗冻性。本研究以PLDβ基因被敲除的拟南芥突变体及其野生型植株为材料,进行低温驯化和冻害胁迫处理,并分析其作用途径。结果表明,PLDβ基因介导低温信号转导作用,参与渗透调节途径中脯氨酸的调控和抗氧化系统中过氧化氢酶(CAT)活性的调控,并且与低温信号激素ABA不在同一条信号转导途径。本研究为探索通过调控PLD的活性提高植物抗冻性提供了新的途径,并为深入揭示植物的抗冻机理以及磷脂信号转导机制提供实验支持。

首例抗除草剂油菜品种907-907

摘要:2010年种植季节酝酿中的新除草剂Clearfieldcanola将成为首例抗除草剂油菜品种。

小肽营养素对断奶仔猪生产性能及血液生化指标的影响908-912

摘要:本试验将40头21d断奶的三元杂交猪随机分为4组,用4组不同日粮组成及营养水平的饲料(Ⅰ:基础日粮+2%喷雾干燥血浆蛋白粉(SDPP);Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ组分别在基础日粮中添加1%,2%和3%小肽营养素)饲养21d后称重、测定血液生化指标并进行统计分析。结果表明:添加小肽营养素对断奶仔猪的生产性能无显著影响;各处理组的血清总蛋白、血糖和血清尿素差异不显著,2%小肽组的球蛋白、免疫球蛋白含量显著高于其它组;小肽产品可以部分等蛋白取代断奶仔猪日粮中的血浆蛋白粉。通过了解小肽营养素替代喷雾干燥血浆蛋白粉对21d断奶仔猪的生产性能和血液生化指标的影响,为肽类产品在断奶仔猪日粮中的应用提供了依据。

拜耳作物科学首次测序油菜籽和油菜全基因组912-912

摘要:2009年10月9日拜耳作物科学公司宣布他们已经完成油菜籽和油菜全基因组及其与芜菁、甘蓝相同基因组序列的测序,显示了拜耳在深入了解油菜遗传密码水平的独特。油菜籽和油菜是仅次于大豆的油料作物,约占世界油料作物总产量的15%。

猪卵母细胞体外成熟的发育潜力及核移植重构胚构建方法的研究913-920

摘要:为了提高猪体细胞核移植重构胚发育潜力,本研究对体外成熟28h、32h、36h、40h、44h、48h、52h和56h的猪卵母细胞分别进行去核构建重构胚。研究结果表明,成熟44h的卵母细胞核移植后有较高的融合率(58.99%)、卵裂率(67.52%)和囊胚率(22.78%),而成熟48h的卵母细胞则分别为56.51%、65.73%和15.96%;且卵龄为44h的卵母细胞核移植后分裂率与囊胚率显著高于卵龄为40h、36h、32h、28h的卵母细胞的分裂率与囊胚率(P〈0.05)。卵龄为48h的卵母细胞融合率高于卵龄为52h卵母细胞的融合率(P〈0.05)。同时我们还探讨了不同去核方法(盲吸法、Hochest33342染色法和Spindle-view system)对猪体细胞核移植重构胚发育能力的影响。研究结果发现,盲吸法、Hoechest33342染色法和Spindle-view system法的去核率分别达到76.33%,100.00%和98.40%。Hoechest染色法去核率显著高于盲吸法的去核率(P〉0.05),而与Spindle-view法去核率没有差异(P〉0.05)。三种方法在融合率和囊胚率方面差异不显著(P〉0.05),但Hoechest染色法的分裂率较低,差异显著(P〈0.05)。进一步的研究表明,细胞质内注射进行核移植构建重构胚的分裂率和囊胚率分别为68.13%和6.44%;透明带下注射法则为60.37%和8.08%,两者差异不显著(P〈0.05);两者均可运用于猪体细胞的核移植,这为建立有效的猪体细胞核移植体系提供了参考。

广西桑蚕茧丝质量与性能指标的测定分析921-928

摘要:本研究对广西桑蚕茧的茧丝质量与性能指标进行了测定分析。结果表明,广西桑蚕茧外形略小,茧层丝胶含量、茧层易溶丝胶含量、丝胶溶解性以及茧丝纤度等主要指标均与江浙夏秋用桑蚕茧有明显差异。桑蚕茧的茧层丝胶含量、易溶丝胶含量随庄口、季节不同而有显著差异;春季桂南地区的蚕茧茧层丝胶含量高于桂西北地区,秋季刚好相反。茧层易溶丝胶含量在11.6%-14.4%之间,约占丝胶总含量的41%~45%,茧层易溶丝胶含量和解舒率呈显著的正相关关系,即茧层易溶丝胶含量越多,蚕茧解舒越好。庄口和季节是影响桑蚕茧层易溶丝胶含量高低与蚕茧解舒优劣的重要因素。广西桑蚕茧层丝胶对煮茧温度更敏感,茧丝纤度粗细变化开差大。因此,我们认为目前困扰广西桑蚕茧加工技术突破的原因之一是缫丝工艺技术,采用传统缫丝工艺技术难以正常发挥广西桑蚕茧的茧丝优势与特性。