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基因组学与应用生物学 2009年第01期杂志 文档列表

基因组学与应用生物学杂志研究论文

水稻突变体des2和des5的研究和定位1-9

摘要：小穗发育是决定水稻产量的主要农艺性状，鉴定控制小穗发育的关键基因对研究和分析调控农艺性状的分子机理是至关重要的。本文中，我们鉴定了一组小穗数目明显减少的突变体，命名为decreased spikeleu（des），这里详细研究des2和des5两个突变体。结果显示des2是由单基因隐性位点控制，图位克隆将此位点定位到6号染色体的长臂上，并最终克隆了此基因，发现des2是mocl的一个新的等位突变体。定位克隆和序列分析显示在des5中，LAX基因的编码HLH（螺旋-环-螺旋）结构域的区域发生了一个点突变，暗示des5是lax的一个新的等位突变体。我们的结果暗示小穗和水稻叶腋分枝的发育受相同的遗传途径调控。

基因组学与应用生物学杂志研究报告

碱茅（Puccinellia tenuifolra）Put-Cu／Zn—SOD基因的克隆及在酵母中的表达10-14

摘要：从碱茅根cDNA文库分离得到Put－Cu／Zn—SOD全长cDNA，其序列全长为2700bp，该基因的开放读码框为长615bp，所编码的蛋白由204个氨基酸组成，其预测分子量约为20．6kD、理论等电点约为5．63。Put－Cu／Zn—SOD氨基酸序列与水稻Cu／Zn-SOD序列有较高的同源性为87％。将Put-Cu／Zn—SOD基因构建到酵母表达载体pYES2，并转化至酵母（INVSc1）。对pYES2-Put-Cu／Zn—SOD转化酵母进行盐碱、氧化胁迫实验。结果表明：重组酵母的抗盐碱、氧化能力明显高于对照（pYES2转化酵母），结果显示了碱茅的Cu／Zn—SOD基因在酵母表达中，具有提高酵母抗盐碱和耐氧化能力。

巴西橡胶树4－羟基－3－甲基－2-（E）－丁烯基－4－磷酸还原酶基因（Hb—HDR）的克隆及表达分析15-21

摘要：4-羟基-3-甲基-2-（E）-丁烯基-4-磷酸还原酶（4-hydroxy-3-methyl-2-（E）-butenyl-4-diphosphate reductase，HDR）是异戊烯基焦磷酸合成途径之一甲基赤藓糖磷酸（methylerythritol phosphate，MEP）途径中的最后一个酶，催化4-羟基-3-甲基-（2E）-丁烯基-4-磷酸生成异戊烯基焦磷酸。根据植物HDR的同源序列设计引物，通过RT-PCR结合RACE的方法在橡胶树中获得了与其相应的HDR基因，命名为HbHDR。序列分析表明HbHDR长1627bp，编码462个氨基酸，属于LYTB家族，该氨基酸序列与烟草、长春花、胡黄连、拟南芥、银杏和火炬松的HDR同源性为79．1％、78．4％、76．5％、75．3％、72．2％和70．9％。半定量RT-PCR结果显示，乙烯诱导胶乳HbHDR的表达。

美国联合基因组研究所完成大豆全基因组测序21-21

摘要：美国能源部联合基因组研究所2008年12月8日宣布释放大豆（Clycine，max L．）全基因组序列，这一信息的公布必将推动世界上最有经济价值之一的大豆育种研究的新发展。大豆不仅占有世界上可食大豆的70％，还是生物燃料潜在的原材料之一。大豆在美国是仅次于玉米的第二大农业出口农作物。

盐生植物海马齿中与K^＋离子胁迫有关的基因功能初步鉴定22-26

摘要：盐生植物海马齿常年生长在海边沙地，能忍耐高盐干旱。本研究对从海马齿植物盐胁迫下的差减文库（SSH文库）中分离的3个全长基因SRTG152-I、SRTG152-Ⅱ和SRTG152-Ⅲ（GenBank：FJ457924，FJ457925和FJ457926）进行了微生物表达和耐盐分析。3个全长基因分别插入pET-22bf＋）表达载体，经过1mmol／L的IPTG在37℃下诱导3h，它们均获得了成功表达。耐盐性功能分析表明，3个基因对Ca^、Mg^2＋和Na^＋离子没有抗性，而在900mmol／L高浓度U离子的胁迫下与对照相比赋予菌株一定的U离子抗＋性。所以，我们初步推测这3个全长基因SRTG152-I、SRTG152-Ⅱ和SRTG152-Ⅲ是一类与U离子的抗性相关的基因。

EuFPS基因表达载体构建及对杜仲遗传转化的研究27-33

摘要：本实验用EcoRI和BamHI双酶切植物表达载体pSH737和含有目的基因的pUC—FPS，定向连接得到重组质粒pSH-FPS，将其导入农杆菌EHA105。采用农杆菌介导法对杜仲进行遗传转化，研究了卡那霉素（kanamycin，Kin）浓度、预培养时间、菌液浓度及侵染时间、乙酰丁香酮（acetosyringone，AS）浓度、共培养时间等对杜仲遗传转化效率的影响。结果表明，选择无菌苗苗龄15d的杜仲下胚轴，卡那霉素浓度50mg/L，农杆菌浓度OD600值0．3～0．6，侵染时间8min，侵染时菌体重悬液中添加50μmol／L乙酰丁香酮，共培养时间3d，抗性芽的获得率最高。对再生植株进行GUS检测发现有45％的植株呈阳性。

两种质粒中gus基因在植物细胞和根癌农杆菌中的表达特性研究34-38

摘要：以含有基因转化操作过程中常用的两种质粒载体pBI121和pCAMBIA2301的根癌农杆菌EHA105为材料，分别转化甜瓜子叶，应用组织化学方法检测了甜瓜子叶和子叶培养后的愈伤组织及根癌农杆菌菌液的瞬时转化效果，研究了两种不同的质粒载体上所含的gus基因在根癌农杆菌中和植物细胞中的表达特性。结果表明，不同质粒载体上所含的gus基因的表达特性不同，质粒载体pBI121上所含的gus基因既能在植物细胞中能表达，也能在根癌农杆菌细胞中表达，而质粒载体pCAMBIA2301上所含的gus基因能在植物细胞中表达，但是不能在根癌农杆菌细胞中表达。

具不同蛋白质含量水稻品种中天冬酰胺合成酶基因的表达39-45

摘要：为研究水稻中氮同化与籽粒蛋白质合成可能的关系，本实验通过Northern杂交分析比较了氮同化关键酶一天冬酰胺合成酶基因（OsAS）在不同水稻品种中的表达特性。结果显示，OsAS基因在水稻不同组织及其不同发育时期中的表达水平不同，以发育种子中的表达量最高，叶鞘和叶片中相对较弱；在籽粒发育过程中OsAS基因的表达呈先升高后下降的趋势。具不同种子蛋白质含量水稻品种叶片中OsAS基因的表达水平存在显著差异，相关性分析显示在籼亚种或粳亚种不同品种内OsAS基因表达量与籽粒蛋白质含量可能存在一定的关联。

水稻芽期耐冷性的QTL分析46-50

摘要：本研究以98个Nipponbare／Kasalath／／Nipponbare回交重组自交家系（backcross-inbred lines，BILs）组成的群体为材料，进行水稻芽期耐冷性数量性状基因座的检测和遗传效应分析。25℃正常条件下水稻发芽7d，芽长5～10cm，5℃低温处理10d，之后升温至25℃，缓苗10d，调查活苗率，并以活苗率作为芽期耐冷性的表型值，分析亲本和98个BILs的芽期耐冷性表现。采用Windows QTL Cartographer 1．13a软件的复合区间作图法，共检测到4个苗期耐冷性数量性状基因座（quantative trait locus，QTL），分别位于第3、第7和第12染色体上，命名为qSCT-3-1、qSCT-3～2、qSCT-7和qSCT-12。4个QTL的加性效应分别为11．16、11．14、-8.8和-14．59，可解释表型变异的12．11％，12．66％，6．82％和15．86％。

粤北普通野生稻籼粳分化的SSR分析51-56

摘要：本文利用28对籼粳特异性SSR引物对174个粤北普通野生稻个体进行分析。28对引物均有多态性，平均每对引物扩增出的等位变异数和基因型数分别为10．6和28。粤北普通野生稻群体有较高的遗传多样性（O．7681），除了能扩增出典型的籼、粳特异基因，还能扩增出野生稻特有的基因。遗传一致度聚类分析表明粤北普通野生稻存在初步籼粳分化；2份（1．15％）材料偏籼，172份（98．85％）材料偏粳，群体以偏粳为主。基因组水平上整个粤北群体没有发现原始类型。

硅对柱花草铝毒的解毒作用57-61

摘要：为了解硅在解除豆科作物铝毒方面的作用，本文以5个品种的柱花草为材料研究了硅对铝胁迫条件下的植物根伸长及膜脂稳定性的影响。研究结果表明，在铝（30μmol／L）胁迫条件下柱花草根伸长受阻、根尖丙二醛（MDA）含量和抗氧化酶（POD，CAT）活性显著增加，而硅（1．4mmol／L）处理增加根中硅的含量而降低了铝对根伸长、MDA含量和抗氧化酶活性的影响，且铝处理前12h供给的硅和前处理溶液及铝溶液中均加硅处理的影响均显著；在不加硅条件下西卡品种的耐铝性显著低于其它品种，而经硅预处理的植株和在预处理及铝处理期间均供应硅的植株的耐铝性不同品种问的差异不显著。这些结果表明，硅能提高柱花草的耐铝能力并影响品种间耐铝差异性。

广西大王岭和大明山自然保护区苏云金芽孢杆菌收集与鉴定62-68

摘要：从广西大王岭和大明山两个自然保护区共采集到土样264份，共分离出597株芽孢杆菌，通过光学和电子显微镜检观察，16株分离株观察到伴胞晶体蛋白，初步确定为苏云金芽胞杆菌（Bacillus thuringiensis，简称Bt），出菌率为6．06％。在16株肪分离株中，有4株在芽孢形成过程中能产菱形晶体蛋白，其余12株能产圆形和其他形状的晶体蛋白。利用PCR—RFLP方法和SDS．PAGE方法对16株助分离菌进行了蛋白和基因型的鉴定，结果表明，16株分离株中含有4株crylAc基因，表达约130kD的晶体蛋白，其中含有cry30基因和cry40基因的菌株分别1株和3株，表达大约75kD的晶体蛋白；另外8株戤菌株表达蛋白大小不一，其基因型尚不能确定，有待进一步分析。生物测定表明，产菱形晶体含有crylAc基因的4株励分离株对鳞翅目小菜夜蛾幼虫有很强的毒杀活性，而其它分离株对小菜夜蛾没有毒杀活性。

广西桑蚕原料茧解舒率与茧层丝胶初期溶解速度的关系探讨69-75

摘要：本文通过对不同品种、不同庄口与季节原料茧茧层丝胶性能研究，结果表明广西的桑蚕原料茧，春茧和秋茧5min、10min两个处理水平的茧层丝胶初期溶解速度与蚕茧解舒率之间都存在着良好的正相关关系，茧层丝胶初期溶解速度越大，蚕茧的解舒率越大。庄口和季节是影响广西桑蚕原料茧茧层丝胶初期溶解速度的重要因素。而茧层丝胶初期溶解速度与蚕茧解舒率在品种水平上则没有相关关系，也就说明茧层丝胶初期溶解速度在品种间虽然有差异，但蚕品种并不是主要制约或影响蚕茧茧层丝胶初期溶解速度的直接因素。

用EST—SSR分子标记技术构建大白菜核心种质及其指纹图谱库76-88

摘要：摘要利用EST-SSR分子标记对大白菜种质资源基因库中686份样品所代表的1900份大白菜种质资源进行分析研究。构建大白菜种质资源的核心种质并且形成核心种质的EST—SSR指纹图谱库。结果表明利用4组鉴定白菜品种的EST—SSR的特异性标记组合，获得近158个EST—SSR多态的标记，对大白菜种质资源基因库中686份样品所代表的1900份大白菜种质资源进行核心种质的构建提供了分析数据。形成的核心种质包括168份样品，占库存资源的8．8％，它的多态位点百分率保持了原群体的100％。所构建的核心种质涵盖了原资源的绝大部分区域来源的品种，包含了早、中、晚熟品种中所有典型的大白菜类型和其相关的特征特性。并进一步进行了核心种质资源遗传多样性分析。核心种质的EST—SSR指纹图谱库中，每一份样品的指纹都是唯一的，为登记、评价、整理、分发、繁殖等种质资源库的管理和育种者对其材料的利用提供了重要的有价值的信息。EST-SSR标记组合是构建中国大白菜核心种质及其指纹图谱的经济、高效的方法。

利用AFLP技术鉴定凤凰单丛古茶树种质资源89-93

摘要：本文采用AFLP技术对34个凤凰单丛古茶树资源进行了种质鉴定分析。结果显示，筛选出多态性较高的5对引物中，引物组合E41M42、E41M39和E41M33可鉴别出供试的全部资源，鉴别效率为100％；有23份资源具有特异带，占供试材料的67．6％。由此研究表明，AFLP技术可以通过特异带、特异的谱带类型、不同引物提供谱带的组合将凤凰单丛古茶树资源区分开来，这对保护凤凰单丛古茶树资源的育种产权、登录新品种、鉴定和检测其种子与苗木的真实性和纯度具有重要的现实意义。

基因组学与应用生物学杂志实验技术

DNA提取方法对一串红不同部位DNA提取的比较94-100

摘要：本文以一串红的叶片、茎段、花为材料，分别采用高盐低pH法、十二烷基硫酸钠（SDS）法、改良十六烷基三乙基溴化铵（CTAB）法、核DNA法和十六烷基三乙基溴化铵（CTAB）区室法等5种不同方法对其进行了基因组DNA提取效果的比较分析。结果表明，除用高盐低pH法在一串红花中未提取出DNA外，其它均可提取出DNA，都能进行RAPD扩增。5种方法在一串红DNA提取中，提取效果由高到低依次为：核DNA法、改良CTAB法、SDS法、CTAB区室法、高盐低pH法；3个部位提取结果显示：叶片较容易得到高质量的DNA，茎段次之，花最差。

甜叶菊RNA分离方法研究101-104

摘要：甜叶菊组织中酚类、萜类和多糖等代谢产物含量较高，RNA难分离，易降解，使用现有的方法提取甜叶菊组织RIgA产率低、质量差，无法应用于实验操作。本文针对甜叶菊组织次生代谢物多的特点，以传统的CTAB法（cetyl trimethyl ammonium bromide）为基础，分别采用不同的方法进行RNA抽提和纯化。结果发现采用CTAB－LiCl法提取的RNA完整性好，且纯度高；传统的CTAB法提取的RNA完整性好，但有DNA和其它杂质的污染；高盐溶液法提取的RNA降解比较严重，同时还有杂质污染。结论说明CTAB—LiCl法适用于多糖类植物RNA的分离。

珍珠黄杨叶片的蛋白质提取方法探讨105-108

摘要：蛋白质样品制备是双向电泳的核心。为了找到一种适合提取珍珠黄杨叶片蛋白质的方法，本文以该树种扦插苗的叶片为材料，用TCA_丙酮沉淀法、Tris-饱和酚法和2-D Clean-Up Kit提取蛋白质，并进行双向凝胶电泳，采用银染法进行检测。结果表明，TCA-丙酮沉淀法得到的样品图谱背景模糊、拖尾；Tris-饱和酚法得到的样品图谱清晰，蛋白点饱满，无纵向或横向拖尾，但有蛋白点丢失；2-DClean-Up Kit提取的蛋白质样品得到了较好双向电泳图谱。