基因组学与应用生物学杂志

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基因组学与应用生物学杂志 北大期刊 CSCD期刊 统计源期刊

Genomics and Applied Biology

  • 45-1369/Q 国内刊号
  • 1674-568X 国际刊号
  • 1.11 影响因子
  • 1-3个月下单 审稿周期
基因组学与应用生物学是广西大学主办的一本学术期刊,主要刊载该领域内的原创性研究论文、综述和评论等。杂志于1982年创刊,目前已被维普收录(中)、CA 化学文摘(美)等知名数据库收录,是广西大学主管的国家重点学术期刊之一。基因组学与应用生物学在学术界享有很高的声誉和影响力,该期刊发表的文章具有较高的学术水平和实践价值,为读者提供更多的实践案例和行业信息,得到了广大读者的广泛关注和引用。
栏目设置:综述与专论、研究论文、研究报告、实验技术。

基因组学与应用生物学 2007年第03期杂志 文档列表

基因组学与应用生物学杂志生物技术专栏
番茄中一个LSm1蛋白同源基因LeLSm1的克隆及表达分析183-189

摘要:从番茄品种超级大明星中克隆LSm1蛋白同源基因LeLSm1。LeLSm1基因全长cDNA共有1038个核苷酸,包含一个387个核苷酸的编码区,以及318个核苷酸的5′非编码区和333个核苷酸的3′非编码区,编码一个含128个氨基酸的蛋白质,分子质量为14.5ku,等电点为4.94。LeLSm1编码的氨基酸序列包含LSml蛋白的保守功能域,与截形苜蓿、拟南芥和水稻等植物的类似LSm蛋白具有高度的同源性,在氨基酸水平上的一致性依次为82.8%、82.0%和72.1%。用PCR方法克隆了LeLSml基因,其全长转录区共4751bp,其中包含5个外显子和4个内含子。Southern杂交结果显示,LeLSml是单拷贝基因。半定量RT-PCR分析表明,LeLSml在番茄五叶期和结果期的根、茎、叶以及花和果实中均有表达,且表达量无明显差异,是一个组成型表达基因。

野油菜黄单胞菌6-磷酸葡萄糖脱氢酶基因的初步分析190-195

摘要:野油菜黄单胞菌野油菜变种是发酵工业生产黄原胶的菌种,对该菌8004菌株全基因组序列进行分析,发现基因组中有两个编码6-磷酸葡萄糖脱氢酶的基因,编号分别为XC1977和XC4082,同源性分析显示这两个基因演绎的氨基酸序列只有36.3%的相似性。为了解这两个基因的功能,采用自杀质粒pK18mob对XC1977和XC4082分别进行诱变,构建这两个基因的非极性突变体,对突变体表型初步分析,发现XC1977和XC4082分别突变后不影响细胞的生长繁殖,但对胞外多糖产量的影响则不相同,XC1977突变使胞外多糖产量降低56.3%,而XC4082突变基本不影响胞外多糖产量,表明8004菌株的两个zwf基因在细胞中的功能不同,XC1977与细胞的胞外多糖合成产量有关。

一个用于体外鉴定野油菜黄单胞菌Ⅲ型效应物的报告质粒的构建196-200

摘要:许多革兰氏阴性植物病原细菌通过Ⅲ型分泌系统(T3SS),将效应物蛋白分泌并转运进入植物体内,从而引起植物发病或过敏反应。效应物是病原细菌和植物分子互作的关键物质。全基因组筛选鉴定Ⅲ型效应物蛋白并研究其功能,对于解明病原菌的致病机理、寄主范围和进化具有重要意义。利用avrBs1作为报告基因,将其过敏反应诱导结构域(AvrBs1 59-444)克隆到不含启动子的穿梭质粒pLAFR6上,构建一个用于Ⅲ型效应物转运体外鉴定的报告质粒pLJB,并以已经鉴定为效应物基因的XC_1553的启动子验证该报告质粒,证明pLJB工作正常。该报告质粒为进一步进行全基因组筛选鉴定野油菜黄单胞菌Ⅲ型效应物提供材料。

产L-丝氨酸的甲醇利用菌MB119的筛选与鉴定201-204

摘要:经过富集培养,从沼气池残渣中筛选到一株可利用甲醇为唯一碳源生长的细菌(MB119),该菌革兰氏染色为阴性,短杆状。经过培养条件的优化发现,该菌的最佳培养温度为28-32℃,最佳生长的甲醇浓度为0.5%,最适pH值为7.0。16S rDNA序列比对分析发现,与Methylobacterium sp.的部分16S rDNA同源性达99%。结合其一些生理特性,将该菌初步鉴定为Methylobacterium属。利用不同碳源对MB119进行培养,发现,该菌同其他甲基菌一样,能利用甲醇以及一些多碳化合物进行生长,但MB119不能利用其他甲基化合物(如甲醛、甲酸等)作为唯一碳源。利用静息细胞反应,发现该菌能产2.6mg/mL的L一丝氨酸。

TES基因C端的分段克隆与表达205-209

摘要:为了在大肠杆菌中分段表达人类TES基因C端3个顺次排列的LIM结构域,利用PCR技术从含有TES基因全长编码序列的质粒pCMV-HA-TES中扩增出这3个LIM domain基因片段,分别重组入pGEM-T载体,再经酶切后,将获得的目的片段亚克隆入原核表达载体pQE-N1进行融合表达。酶切鉴定及测序结果表明,扩增产物与已知基因序列一致,成功构建了3个目的片段的pQE-N1表达质粒;SDS-PAGE结果显示,IPTG诱导表达出与预期分子质量大小相同的3个融合蛋白。

广西沼泽型水牛γ-干扰素基因的克隆与原核表达210-214

摘要:本研究克隆了广西沼泽型水牛γ-干扰素(interferon-γ,IFN-γ)基因,并构建了水牛IFN-γ原核表达质粒。从健康沼泽型水牛静脉无菌采血,分离外周血单个核细胞(Peripheral blood mononuclear cells,PBMCs),用刀豆素A(Concanavalin A,ConA)诱导培养13h后,提取细胞总RNA,用水牛IFN-γ/基因特异性引物通过RT-PCR扩增水牛IFN-γ成熟肽编码区cDNA序列,将其克隆到pMD18-T载体中。RT-PCR产物电泳可见约457bp大小目的片段。经过限制性酶切分析,测序证实克隆得到的基因序列正确。将IFN-γ/成熟肽编码区基因片段切下亚克隆到表达载体pET-32a+中,构建成重组表达质粒pET-mIFN-γ/。PCR、双酶切电泳和序列测定结果均证实已插入约457bp的IFN-γ基因片段。经异丙基硫代-β-半乳糖苷(IPTG)诱导,水牛IFN-γ/基因在大肠杆菌中获得了高效的表达,融合蛋白的分子量为35ku,表达量占菌体总蛋白的43.6%。

基因组学与应用生物学杂志珍稀濒危生物专栏
广西雅长自然保护区兰科植物区系分析215-220

摘要:在调查与统计广西雅长兰科植物自然保护区野生兰科植物区系的属、种组成及地理成分的基础上,分析其区系特点,该保护区兰科植物区系的特点是:(1)兰科植物种类丰富,居群数量大,迄今已知有113种(含5变种),隶属于44属,是广西兰科植物种类最丰富的保护区;(2)兰科植物地理成分复杂,热带性质明显,属的热带属(R)与温带属(T)数的比值(即R/T比值)达5.00;(3)兰科植物分布广泛,垂直分布以中海拔为多;(4)兰科植物生态类型丰富多样,特有性较强,并表现一定岩溶特有性。并提出应加强保护区兰科植物的科研、保护与管理工作的建议。

基因组学与应用生物学杂志动物科学·动物医学
草鱼消化道碱性蛋白酶的提取及鉴定221-226

摘要:用丙酮将草鱼肠脱脂,磷酸盐缓冲溶液提取粗酶液,再用10%-40%饱和度的硫酸铵分级沉淀制取粗草鱼消化道碱性蛋白酶。粗草鱼碱性蛋白酶的比活力为2800U/g,最适作用温度为37℃,最适作用pH为10.3。在50℃保温30min后还保留60%以上的酶活力,要使其损失约80%的活力,需要在60℃保温30min。50mmol/L的甲苯磺酰赖氨酸氯甲酮(TLCK)、甲苯磺酰氟(PMSF)和50μmol/L大豆胰蛋白酶抑制因子(SBTI)分别抑制78.92%、75.98%和80.23%的酶活力。SDS-底物-聚丙烯酰胺凝胶电泳表明碱性蛋白酶的活性成分有4种,一种为非丝氨酸蛋白酶,相对分子质量为105000;另外三种为胰蛋白酶,相对分子质量分别为26400、30750和43000。

羊奶乳清蛋白水解物的酶解制备227-231

摘要:采用Alcalase与Flavourzyme两种酶对羊奶乳清蛋白进行水解,以水解度为指标,对两种酶单独使用及复合使用水解羊奶乳清蛋白的工艺条件进行了研究。试验结果显示:采用Alcalase与Flavourzyme复合水解羊奶乳清蛋白的效果较好,特别是采用先添加Flavourzyme后加入Alcalase进行水解,不仅能提高羊奶乳清蛋白的水解度,使其达到32.81%,而且对改善水解液的口感有较大的作用。

生长猪对不同来源的饲用油脂消化能的测定232-234

摘要:试验选用24头体重20kg的三元杂交(杜洛克×长白×大约克)生长公猪,按单因子设计随机分为6个处理,分别饲喂用一定比例的油脂替换基础日粮的饲料,饲喂一定时间后采集粪便,测定生长猪对各试验日粮的干物质、能量的消化率,并用套算法计算各油脂的消化能。试验结果如下:乳脂粉A、乳脂粉B、冷喷油、饲料专用油、大豆油的表观消化能分别为26.34、29.86、27.49、37.37和32.02MJ/kg。上述结果在一定程度上弥补了当前国内文献中缺乏这几种常规的饲用油脂消化能值的空白,也进一步显示了粉末油脂在生产中的强大潜力,为丰富和研制高效绿色饲用油脂提供了科学的理论依据。

基因组学与应用生物学杂志农学·植物保护
铝胁迫下硝普钠对黑麦和小麦根尖细胞壁铝吸附的影响235-239

摘要:用一氧化氮供体硝普钠(sodium nitroprusside,SNP)处理铝胁迫下的黑麦和小麦幼苗,探讨铝胁迫和铝胁迫下外源NO对黑麦和小麦根尖细胞壁铝吸附的影响。结果表明:铝显著抑制黑麦和小麦根的伸长生长,小麦受抑制更为严重;SNP处理可缓解铝对黑麦和小麦根伸长生长的抑制作用,1mmol/LSNP处理最有效。小麦根尖对铝的吸附量和吸附速率显著高于黑麦的,1mmol/LSNP处理显著降低小麦和黑麦细胞壁对铝的吸附量,使根尖铝含量显著下降。铝与根尖细胞壁的结合是导致植物铝毒害的重要原因,而降低根尖细胞壁对铝的吸附是外源NO缓解铝毒害的重要机制。

高直链淀粉含量早籼组合优I315的选育与应用240-242

摘要:优I315是用高异交率优质不育系优IA为母本,与自选恢复系测315配组而成的杂交水稻早籼组合。该组合具有产量高、直链淀粉含量高(26.8%)、制种产量高等特点,可作为米粉加工型专用稻利用。该组合于2003年2月通过广西壮族自治区农作物品种审定委员会审定。文章介绍了其选育经过、特征特性及其应用技术。

木薯良种“GR911”的组织培养243-246

摘要:以“GR911”木薯的腋芽为外植体,研究木薯的组织培养技术。结果表明,在所设计的方案中,MS+6-BA1.0mg/L是较适合的初代诱导培养基;MS+6-BA1.5mg/L是较适合的增殖继代培养基;1/eMS+NAA0.1mg/L是较好的生根培养基。

牛角瓜的组织培养247-249

摘要:以牛角瓜的叶片为外植体,进行牛角瓜的组织培养。结果表明,培养基MS+2,4-D2mg/L利于愈伤组织的诱导;培养基MS+6-BA0.5mg/L+NAA0.1mg/L有利于芽的分化和增殖;生根壮苗的培养基为1/2MS+NAA0.5mg/L,其生根率100%;试管苗生根培养30d后移栽,成活率可达85%以上。

微波诱变选育亚-麻酸高产菌株250-252

摘要:采用微波处理方式,对产γ-亚麻酸的一株雅致小克银汉霉D5进行诱变处理,选育得到一株高产γ-亚麻酸的菌株D5-89。与出发菌株相比,该菌株γ-亚麻酸含量在油脂中的比例从10.31%提高到19.76%;发酵液中γ-亚麻酸的产量从0.3648g/L提高到0.6832g/L,提高了87.28%。该性状经过10次传代仍保持稳定。

玉米淀粉质原料生料酒精发酵的研究253-255

摘要:进行了玉米免蒸煮生料酒精发酵试验,对影响其发酵的主要因素进行正交试验研究,结果表明:玉米生料酒精发酵在发酵剂添加量占原料的0.7%、料水比1:4、起始pH5.5、35℃条件下发酵4-5d,原料淀粉利用率和酒精产率分别可达到81.4%和46.22%。

毛竹丛枝病病原研究256-261

摘要:从桂林灵川毛竹林分离到2株毛竹丛枝病菌的菌株B1和B2,两者都具有较强的致病力,但在培养性状和形态特征上有一定差异,且B2菌株的致病力更强。通过分析病原菌核糖体DNA的ITS序列,结果表明B1和B2菌株与GenBank中竹针孢座囊菌的ITS序列的同源性为99.17%-100%,而B1和B2菌株之间只有一个碱基的差异,进一步证实毛竹丛枝病的病原是竹针孢座囊菌Aciculosporium take Miyake[=Balansia take(Miyake)Hara]。接种发病率与毛竹生长季节、接种方法有关,接种竹笋首次获得成功。

基因组学与应用生物学杂志农牧业经济
广西奶牛养殖业发展中存在的问题及对策262-267

摘要:随着国家对“三农”问题的日益重视和农业产业化进程的加速推进,奶牛养殖在农业发展中的地位和作用也在不断提高和增强。为了进一步加快广西奶牛养殖业的发展速度,通过深入调查广西奶牛养殖企业现有的生产状况及生产水平,分析了目前影响广西奶牛养殖业发展中存在的问题,提出加快广西奶牛养殖业发展的思路与对策。