不同哺乳动物GDF9密码子偏性及聚类分析

作者:杨佳栋; 刘月琴; 张英杰

摘要:为更好地认识哺乳动物GDF9基因在长期进化过程中为适应环境形成的密码子使用模式,通过Codon W软件计算不同哺乳动物GDF9基因的密码子偏性指标,利用SPSS软件对密码子偏好性影响因素的相关性进行分析,结合密码子偏性和最小进化法分析其亲缘关系。GCT、TGT、TTT、ATT、CCT、AGA、ACT为哺乳动物GDF9基因的最优密码子,该基因偏爱使用以A或T结尾的密码子;G、C含量和蛋白质亲水性是影响GDF9基因密码子偏性的主要因素;聚类分析提示不同哺乳动物间的同源性越高,GDF9基因密码子使用特征的相似性越高。

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  • 统计源期刊(中国科技论文优秀期刊)
关键词:
  • 哺乳动物
  • gdf9
  • 碱基替换
  • 密码子偏性
  • 聚类分析

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

期刊名称:江苏农业科学

期刊级别:统计源期刊

期刊人气:18367

杂志介绍:
主管单位:江苏省农业科学院
主办单位:江苏省农业科学院
出版地方:江苏
快捷分类:农业
国际刊号:1002-1302
国内刊号:32-1214/S
邮发代号:28-10
创刊时间:1973
发行周期:半月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
复合影响因子:0.73
综合影响因子:1.16