南极菲尔德斯半岛表层土壤样品中细菌多样性的系统发育分析
作者：李会荣; 孙嘉康; 陈丽珊; 俞勇; 陈波; 任大明
摘要：通过PCR结合变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术对从南极长城站附近表层土壤样品中获得16S rDNA序列特征片段V3区序列进行分离.对其中的主要12条DGGE条带进行胶回收,获得的DN段经测序以及计算机比对分析发现,它们分别属于β、γ、δ-变形细菌(Proteobacteria)、噬纤维菌-屈挠杆菌-拟杆菌(Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides, CFB) 群细菌、放线细菌(Actinobacteria)、蓝细菌属(Cyanobacteria)、酸杆菌属(Acidobacteria)和绿屈挠菌属(Chloroflexi)等系统分类群.南极表层土壤样品中的大部分16S rDNA序列与从其他土壤或沉积物样品中直接获得的序列相似性较高(93%-100%).
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关键词：
- 南极
- 表层土壤
- 细菌
- dgge
- 16s
- rdna
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