小菜蛾传染性软腐病病毒的全基因组序列及其进化分析

作者:陈大嵩; 戴建青; 韩诗畴

摘要:传染性软腐病病毒(Iflavirus)属于小核糖核酸病毒目,是一类单股正链RNA病毒,其家族成员正在不断扩大。Iflavirus的寄主包括鳞翅目、膜翅目和半翅目的昆虫以及瓦螨,因其对一些重要的农业害虫产生致病性,因此是重要的潜在生防病毒种类之一。本研究利用小菜蛾转录组测序数据拼接出一条Iflavirus病毒基因组序列。通过查找ORF和序列相似性比对发现此基因组可编码一条完整的病毒多聚蛋白并与其他Iflavirus病毒同源,因此将这一新病毒命名为小菜蛾传染性软腐病病毒(Diamondback moth iflavirus),英文简称DBMIV。通过多聚蛋白序列与RNA聚合酶序列构建的进化树表明DBMIV与PNV、EOPLV和SEIV2进化关系最近。最后,利用RT-PCR扩增出DBMIV的外壳蛋白区域验证了新命名病毒在田间小菜蛾种群的感染。DBMIV的鉴定与命名为利用高通量测序数据鉴定病毒新种提供参考,为利用病毒生防重要蔬菜害虫小菜蛾提供研究思路。

分类:
  • 期刊
  • >
  • 自然科学与工程技术
  • >
  • 农业科技
  • >
  • 植物保护
收录:
  • 维普收录(中)
  • CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
  • 国家图书馆馆藏
  • 万方收录(中)
  • 北大期刊(中国人文社会科学期刊)
  • 上海图书馆馆藏
  • 知网收录(中)
  • 统计源期刊(中国科技论文优秀期刊)
关键词:
  • 小菜蛾
  • 传染性软腐病病毒
  • 基因组
  • 系统进化

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

期刊名称:环境昆虫学报

期刊级别:北大期刊

期刊人气:1356

杂志介绍:
主管单位:广东省科学技术协会
主办单位:广东省昆虫学会;中国昆虫学会
出版地方:广东
快捷分类:生物
国际刊号:1674-0858
国内刊号:44-1640/Q
邮发代号:46-18
创刊时间:1979
发行周期:双月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
复合影响因子:0.66
综合影响因子:1.34