七星瓢虫滞育关联基因的转录组学分析

作者:齐晓阳 任小云 安涛 陈红印 黄建 张礼生

摘要:对七星瓢虫正常发育、滞育以及滞育解除的雌成虫进行RNA测序,并对筛选出来的滞育相关基因进行KEGG通路富集分析,从分子水平解析七星瓢虫滞育发机理。本研究以正常发育产卵、滞育30 d以及滞育贮存30 d后解除产卵的七星瓢虫雌成虫为研究对象,分别抽提RNA,合成c DNA,构建c DNA文库,文库检测合格后在Illummina Hiseq 2500测序仪上进行双向测序。根据测序结果,共获取unigene 82820个。采用两两比较法对正常发育组和滞育组、滞育组和滞育解除组进行差异表达分析,分别获得差异表达基因3501个和1427个。深入分析两组比对结果,将在滞育组上调且滞育解除组下调的unigene定义为滞育关联基因,共有443个基因为滞育关联基因。应用KEGG KAAS在线pathway比对分析工具对滞育关联基因进行通路富集分析,结果发现这些基因主要集中在碳水化合物代谢、脂质代谢以及信号转导等途径中。

分类:
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关键词:
  • 七星瓢虫
  • 滞育
  • 转录组测序
  • 滞育关联基因

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期刊名称:环境昆虫学报

期刊级别:北大期刊

期刊人气:1364

杂志介绍:
主管单位:广东省科学技术协会
主办单位:广东省昆虫学会;中国昆虫学会
出版地方:广东
快捷分类:生物
国际刊号:1674-0858
国内刊号:44-1640/Q
邮发代号:46-18
创刊时间:1979
发行周期:双月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
复合影响因子:0.66
综合影响因子:1.34