可变剪接在肺腺癌预后中的价值

作者:张世超; 欧阳燕; 兰应武; 唐福州; 胡祖权; 曾柱

摘要:目的:探讨可变剪接在肺腺癌预后中的作用。方法:在TCGA数据库中收集474例肺腺癌组织的RNA-seq数据,绘制可变剪接图谱;通过单因素Cox回归分析确定肺腺癌中存活相关的剪接事件,再利用最小绝对收缩模型筛选用于监测存活的预后因子;收集5例肺腺癌患者的癌组织,采用PCR扩增及琼脂糖凝胶电泳检测CHEK 1、KIF 23、MCM 7和FN 1的mRNA亚型条带。结果:在肺腺癌中存在着大量的可变剪接事件并与预后相关,包括CHEK 1、KIF 23、MCM 7和FN 1,通过生物信息学利用可变剪接事件构建了高效的风险预测模型;KEGG途径分析表明,主要富集的基因与““regulation of autophagy”、“central carbon metabolism in cancer”和“cell cycle”有关;5例肺腺癌患者的癌组织PCR扩增结果显示,可变剪接核心基因CHEK1、KIF23、FN1确实存在CHEK1-AP-19309、KIF23-AP-31390、FN1-ES-57398等剪接体。结论:可变剪接事件可作为预测肺腺癌患者临床结果的指标,可为肺腺癌患者制定个体化治疗方案提供依据。

分类:
  • 期刊
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关键词:
  • 肺肿瘤
  • 预后
  • 肺腺癌
  • 可变剪接
  • 临床结果
  • 核心基因

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期刊名称:贵州医科大学学报

期刊级别:统计源期刊

期刊人气:2053

杂志介绍:
主管单位:贵州医科大学
主办单位:贵州医科大学
出版地方:贵州
快捷分类:医学
国际刊号:2096-8388
国内刊号:52-1164/R
邮发代号:66-48
创刊时间:1939
发行周期:月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
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综合影响因子:1.29