摘要：以24个籼稻品种（系）为材料,利用SSR标记技术分别采用NTSYS软件、DPS软件和MAGE软件在4种情况下进行聚类分析。结果表明,无论是利用NTSYS软件通过相关系数,还是利用DPS软件和MAGE软件通过遗传距离进行聚类分析,都基本能将恢复系、三系不育系、短光敏不育系3个类群分开,但由于所选标记及其检测到的等位基因数量不同,聚类的结果也随之不同,特别是水稻恢复系和不育系两大类群下的各亚类的分类结果不同。因此,认为只有首先确定合理的引物数量及其检测到的等位基因数,才能较为准确地进行聚类分析,进而有效地划分杂种优势群。