斑节对虾泛素融合蛋白UbL40基因的克隆及表达分析

作者:傅明骏; 吴松; 唐蕾; 周发林; 邱丽华; 江世贵

摘要:从斑节对虾(Penaeus monodon)肝胰腺转录组数据中筛选获得泛素融合蛋白Ub L40基因(ubiquitin/ribosomal L40 fusion protein,Pm Ub L40)的部分序列,利用RACE技术克隆其c DNA全长序列,通过生物信息学进行结构分析;利用实时定量PCR技术检测该基因在斑节对虾不同组织及卵巢不同发育期的表达情况。结果表明,Pm Ub L40基因c DNA全长571 bp,开放阅读框(Open reading frame,ORF)长390 bp,编码129个氨基酸,预测分子量约14.7 ku,理论等电点为9.76。预测氨基酸序列的N-末端(1~76aa)为高度保守的泛素结构域,C-末端(77~129aa)为典型的核糖体蛋白L40结构域。多重序列比对表明不同物种的Ub L40在进化过程中高度保守。实时定量PCR结果显示Pm Ub L40基因在肝胰腺的表达量最高,肌肉、卵巢次之,其他组织的表达较低;在卵巢发育过程中Pm Ub L40基因在II期表达最高,其次是V期,显著高于I、III、IV期。研究结果表明Pm Ub L40基因在斑节对虾卵巢发育过程中可能具有重要作用。

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关键词:
  • 斑节对虾
  • 泛素融合蛋白l40
  • 卵巢发育
  • 基因克隆

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期刊名称:广东农业科学

期刊级别:统计源期刊

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杂志介绍:
主管单位:广东省农业科学院
主办单位:广东省农业科学院;华南农业大学
出版地方:广东
快捷分类:农业
国际刊号:1004-874X
国内刊号:44-1267/S
邮发代号:46-43
创刊时间:1965
发行周期:月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
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