木薯(Manihot esculenta)AKT1基因的克隆及生物信息学分析

作者:陈秀珍; 白雪杨; 朱云峰; 刘银弟; 江行玉; 周扬

摘要:植物细胞中的K^+通道蛋白AKT1(Arabidopsis K^+transpoter 1)主要负责吸收K^+。本研究基于木薯基因组数据库信息,利用PCR技术从木薯中克隆一个MeAKT1基因,该基因全长2634 bp,编码877个氨基酸,生物信息学分析表明MeAKT1含有10个外显子和9个内含子,编码的氨基酸分子量为99.02 kD,等电点为8.43,属于稳定蛋白。MeAKT1包含有5个跨膜区域,N端含有1个Ion_trans结构域,C端有1个KHA结构域,其二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,进化树分析发现MeAKT1与蓖麻RcAKT1的亲缘关系最近。通过对MeAKT1蛋白的生物信息学分析有助于下一步深入研究MeAKT1在木薯耐贫瘠过程中的功能。

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关键词:
  • esculenta
  • akt1
  • 生物信息学分析

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期刊名称:分子植物育种

期刊级别:北大期刊

期刊人气:6134

杂志介绍:
主管单位:海南省科学技术协会
主办单位:海南省生物工程协会
出版地方:海南
快捷分类:农业
国际刊号:1672-416X
国内刊号:46-1068/S
邮发代号:84-23
创刊时间:2003
发行周期:半月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
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综合影响因子:0.89