基于Ion Torrent PGMTM测序系统的人mtDNA全测序分析

作者:曹禹; 邹凯南; 黄江平; 马克; 平原

摘要:目的应用Ion Torrent PGMTM测序系统对人线粒体DNA(mitochondria DNA,mtDNA)全序列进行分析检测,研究不同组织间mtDNA序列差异情况。方法通过法医尸体检验采集6名无关个体的组织样本,包括胸腔血液、头发、肋软骨、指甲、骨骼肌和口腔上皮。使用4对引物对线粒体全序列进行扩增,应用Ion ShearTM Plus Reagents试剂盒和Ion Plus Fragment Library试剂盒等构建文库,并在Ion Torrent PGMTM测序系统上进行线粒体基因组全序列测序,并针对异质性位点和在HVⅠ区域突变位点,进行Sanger测序验证。结果所有样本的全基因组mtDNA都扩增成功,6名无关个体分属于6种不同的单倍型,同一个体不同组织之间mtDNA存在异质性差异。异质性位点和HVⅠ区域突变位点采用Sanger测序结果均得到验证。通过Kappa统计方法进行一致性检验后发现,相同个体不同组织的mtDNA序列检验结果仍具有较好的一致性。结论本研究所采用的人线粒体基因组全序列的测序检验方法,可以检测出同一个体不同组织间mtDNA的异质性差异,该差异具有较高的一致性,该结果对mtDNA在法庭科学中的应用具有指导作用。

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关键词:
  • 法医遗传学
  • dna
  • 线粒体
  • 遗传异质性
  • iontorrentpgmtm测序系统
  • 高通量核苷酸序列分析

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期刊名称:法医学

期刊级别:CSCD期刊

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杂志介绍:
主管单位:中华人民共和国司法部
主办单位:司法鉴定科学研究院
出版地方:上海
快捷分类:医学
国际刊号:1004-5619
国内刊号:31-1472/R
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创刊时间:1985
发行周期:双月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
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