东北草地野大麦对混合盐碱胁迫的生理响应及转录组分析

作者:宋士伟; 焦德志; 杨允菲

摘要:为了研究盐碱胁迫下野大麦(Hordeum brevisubulatum)的生理响应及耐盐碱基因的发掘,采用不同浓度NaCl与NaHCO3混合液胁迫处理45日龄幼苗,通过理化分析方法确定野大麦盐碱逆境胁迫临界值,通过转录组测序技术(RNA-Seq)分析基因表达情况。结果表明,不同浓度(100、200、300、400、500mmol·L^–1)混合盐碱胁迫2d后,野大麦叶片可溶性蛋白含量、超氧化物歧化酶(SOD)活性呈先升高后降低的趋势,均在300mmol·L^–1达到最大值,脯氨酸、可溶性糖含量呈连续上升趋势。选取300mmol·L^–1处理组的野大麦叶片进行转录组测序分析,与对照组(无盐碱处理)相比有4163个基因上调,1936个基因下调;对差异表达基因进行GO功能分类,可分为生物过程、细胞组分和分子功能3个主类52个小类;4405个差异基因被注释到132个通路中,主要涉及蔗糖合成、脯氨酸合成、过氧化物酶体等代谢途径,蔗糖合成酶(SuS)、鸟氨酸转氨酶(OAT)、谷氨酸激酶(ProB)、谷氨酸-5-半醛脱氢酶(ProA)、超氧化物歧化酶(SOD)等的编码基因上调表达。野大麦可以通过提高某些渗透调节物质含量适应盐碱逆境胁迫,这种代谢过程调节蕴涵相关基因表达调控的生理机制。

分类:
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关键词:
  • 野大麦
  • 盐碱胁迫
  • 生理响应
  • 转录组测序
  • go功能分类
  • kegg注释
  • 代谢通路

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期刊名称:草业科学

期刊级别:北大期刊

期刊人气:3114

杂志介绍:
主管单位:中国科学技术协会
主办单位:中国草学会;兰州大学草地农业科技学院
出版地方:甘肃
快捷分类:农业
国际刊号:1001-0629
国内刊号:62-1069/S
邮发代号:54-51
创刊时间:1984
发行周期:月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
复合影响因子:1.93
综合影响因子:1.79