天山樱桃EST-SSR引物开发及PCR反应体系优化

作者:秦雪; 陈淑英; 田嘉; 李鹏; 盛芳; 李疆

摘要:以新疆天山樱桃叶片为试材,从NCBI数据库中搜索天山樱桃EST序列,利用SSRHunter 1.3软件查找SSR位点,结合Primer 6.0设计引物,通过正交实验和单因素试验优化天山樱桃SSR-PCR反应体系,并用最佳体系对所开发的引物进行验证,以期为研究天山樱桃遗传多样性、构建遗传连锁图谱奠定基础。结果表明:从58对备选引物中随机挑选30对引物进行试验,有21对引物能够扩增出特异性条带,有效扩增率为70%。20μL天山樱桃SSR-PCR最佳反应体系为dNTP 0.2mmol·L~(-1)、引物0.4μmol·L~(-1)、Taq酶0.75U、模板DNA 60ng。

分类:
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关键词:
  • 天山樱桃
  • 引物开发
  • 体系优化

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期刊名称:北方园艺

期刊级别:北大期刊

期刊人气:17672

杂志介绍:
主管单位:黑龙江省农业科学院
主办单位:黑龙江省农业科学院
出版地方:黑龙江
快捷分类:农业
国际刊号:1001-0009
国内刊号:23-1247/S
邮发代号:14-150
创刊时间:1977
发行周期:半月刊
期刊开本:A4
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