番茄超氧化物歧化酶的生物信息学分析

作者:郭笑; 苑广信; 王曼力; 赵南晰; 李洪宇; 安丽萍

摘要:超氧化物歧化酶(SOD)是生物体内重要的抗氧化酶。以在NCBI数据库中注册的7种番茄SOD蛋白质为分析对象,利用生物信息学方法,分析了SOD蛋白质的理化性质、信号肽、糖基化位点、磷酸化修饰、一级和二级结构以及系统进化特点。结果表明:7种蛋白质间的理化性质存在较大差异;氨基酸序列中不含信号肽,均不是分泌蛋白;不同类型的番茄SOD中所含糖基化以及潜在磷酸化位点数目不同;它们的氨基酸序列同源性较低,二级结构也存在较大差异;系统进化树可作为番茄SOD家族蛋白遗传分化研究的重要依据。该研究为深入开展SOD的酶学特征及植物抗氧化的分子机制研究提供重要的理论依据。

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关键词:
  • 番茄
  • 超氧化物歧化酶
  • 生物信息学
  • 抗氧化

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期刊名称:北方园艺

期刊级别:北大期刊

期刊人气:17725

杂志介绍:
主管单位:黑龙江省农业科学院
主办单位:黑龙江省农业科学院
出版地方:黑龙江
快捷分类:农业
国际刊号:1001-0009
国内刊号:23-1247/S
邮发代号:14-150
创刊时间:1977
发行周期:半月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
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