甜瓜基因组SSR位点分布规律与多态性初探

作者:高兴旺 王贤磊 杨雅婷 张自强 卢浩 李冠

摘要:以3个甜瓜品种"BM7"、"伽师瓜"和"Y8"为试材,选取甜瓜基因组的3个DNA区域进行SSR位点的分布规律分析,进一步通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检验甜瓜基因组SSR位点的多态性,以期初步揭示甜瓜基因组中SSR位点的分布规律及其多态性,进而为甜瓜及其它物种开展相关研究提供参考。试验表明:甜瓜基因组中平均每1.9kb就有一个SSR位点,富含A和T的重复基序出现的频率远高于富含C和G的重复基序的频率,没有发现全部由C、G构成的重复基序;二、三、四碱基重复基序的SSR位点占绝大多数(83.3%),五、六碱基重复基序的SSR位点分布较少(16.7%)。二、三、四、五、六核苷酸重复基序SSR位点平均长度依次为21、15、14、16、20bp。设计的82对SSR引物中81对扩增出产物,多态比例最高为48.1%。试验表明,甜瓜基因组中SSR分布具有一定规律,并且可以利用SSR分子标记开展相关研究;试验同时对更好地开展SSR和ISSR分子标记的相关研究奠定了理论基础和依据。

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关键词:
  • 甜瓜
  • 基因组
  • ssr
  • 分布
  • 多态性

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期刊名称:北方园艺

期刊级别:北大期刊

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杂志介绍:
主管单位:黑龙江省农业科学院
主办单位:黑龙江省农业科学院
出版地方:黑龙江
快捷分类:农业
国际刊号:1001-0009
国内刊号:23-1247/S
邮发代号:14-150
创刊时间:1977
发行周期:半月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
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