两个苹果RNA解旋酶基因的基本特征与表达分析

作者:许瑞瑞 张世忠 曹慧 刘慧莲 王建波

摘要:利用生物信息学方法对2个苹果RNA解旋酶基因染色体定位、系统进化关系和氨基酸序列基本特征等进行了预测,分析了基因在果实成熟期和砧穗互作中的表达差异;并4用PlantCARE软件对二者的启动子序列中所包含的响应元件进行了预测和分析;利用qRT-PCR方法分析了2个苹果RNA解旋酶基因的组织表达模式。结果表明:“金冠”苹果基因组中鉴定了2个RNA解旋酶基因,命名为Mdhelicasel、Mdhelicase2,分别分布在苹果第6、17条染色体上;表达谱芯片分析发现,在苹果果实成熟时期和砧木接稳互作过程中,Mdhelicase1和Mdhelicase2基因的表达有不同程度的变化;2个基因的启动子区域存在多个胁迫响应元件,如MBS、HSEs、TC-rich repent、AREs、ABREs、GARE motif、P box、CGTCA motif、TGACE motif、IAght responsive elernonts等。Mdhelicase1、Mdhelicase2在“平邑甜茶”茎、叶、花、果实中都有表达,二者分别在茎和叶中的表达量最高。

分类:
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关键词:
  • 苹果rna解旋酶
  • 基因特征
  • 启动子序列分析
  • 表达分析

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期刊名称:北方园艺

期刊级别:北大期刊

期刊人气:17496

杂志介绍:
主管单位:黑龙江省农业科学院
主办单位:黑龙江省农业科学院
出版地方:黑龙江
快捷分类:农业
国际刊号:1001-0009
国内刊号:23-1247/S
邮发代号:14-150
创刊时间:1977
发行周期:半月刊
期刊开本:A4
下单时间:1-3个月
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综合影响因子:1.15